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一盏茶一篇meta(三)
在上一期中,猴哥分五步讲了SNP META的检索式。本期讲第六步,海选基因(超级女声)。
SNPmeta分析系列
海选基因多态性(三原则)
6.1.配对原则--拿来主义,从别人发的snpmeta中找基因,与我关心的 疾病配对(从meta分析到基因突变)
6.1.1 基因多态性
在pubmed中检索《基因多态性》的检索式(重要的事情说三遍,这是 第二遍)
在下面窗口输入哦。。。
6.1.2 meta分析
在pubmed中检索《meta分析》的检索式(重要的事情说三遍,这是第二遍
6.1.3 将6.1中的snp 和6.2中的meta用AND连接起来
为什么要用AND?
让我们告诉你,通关密语:
"You AND Me,(From oneworld,)We are family”.
我和你,来自不同的“国度”,“AND”在一起。如果是自己--“wo”家里的,请“OR”在一起。
总结一句话:我和你,AND一起; “我wo”家里,OR一起。很好记哦,有没有。。。
最后在这233955文章中找自己感兴趣的gene,然后列成一个表并分类整理,整理好如下图所示:
6.1.4 找到自己关心的疾病,然后配对找原始研究
6.2 从点突变开始寻找(从基因突变到meta分析)
6.2.1 点突变和癌症,找到2376文章,然后筛选基因哦
例如,下面这篇就有很多与化疗反应有关的基因多态性。。。Langer R,2005,Association of pretherapeutic expression of chemotherapy- related genes with response to neoadjuvantchemotherapy in Barrett carcinoma;Clin Cancer Res. 2005Oct 15;11(20):7462-9. PMID:27128842 (文中table1),赶快用excel记录下来哦,别告诉其他人哈,一个基因就是一篇文章!
一般人,我不告诉他。。。,我只告诉二班的。。。
6.2.2 点突变和疼痛,找到2376文章,然后筛选基因哦(pain是比肿瘤、免疫、神经系统疾病、慢病更新的方向哦)Trescot AM 2014 A review ofthe role of genetic testing in pain medicine. Pain Physician.2014 Sep-Oct;17(5):425-45. Review. PMID:25247900
请看方法中的一段话,哇,好多基因与pain有关,猴哥还没有写哦,想写的同学们,快快行动,天下武功,唯快不破,你一定要比我快,比我幸福哈。。。。
6.3 跟随“大牛”脚步,筛选基因
6.3.1 韩国欧巴 Song GG 老师,检索一下他。。。
6.3.2 吓死宝宝,188篇
同学们试一下这个检索式:song gg[au] AND meta-analysis[tiab]
2016年4月份就有snpmeta 4篇哦。
6.3.3 国内LI S 老师,检索一下。。。
6.3.4哇,305篇哦,2016年4月也有4篇哦。。。
6.4 总结
一个人的一生应该是这样度过的:当他回首往事的时候,他不会因为虚度年华而悔恨,也不会因为碌碌无为而羞耻;这样,在临死的时候,他就能够说:“我的整个生命和全部精力,都已经献给世界上最壮丽的事业——为人类的meta事业而斗争。
开始奋斗吧,少年。。。
(回复SNP1获得猴哥小礼包哦~ )
勘误声明:上次推文有误现已修正
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