高清视频发放：PRISMA+生信答疑 线上沙龙第五期
发送沙龙到后台，复习往期内容。 直播QQ群：463367325
上周六，猴哥为大家在线讲解了meta基础-构建PRISMA框架，并专场解答了上一位同学通过有道云笔记发来的meta循统基本方法相关问题。
赵老师也在现场回答了以下一系列生信大数据相关问题。
(* ￣3)(ε￣ *)感谢小编编组的辛苦工作，我们这回有视频了！
发送 GSNX 到后台，马上得全套现场课程+答疑视频，跟随两位老师的逻辑，开始小白的历练之路吧~
本周六是赵老师的大数据直播，有心的读者会发现，freescience沙龙直播课程是meta与生信轮替，两位老师同场答疑解惑！
所以，尽管有了小编编组辛勤整理的视频和问答图文，大家还是尽可能安排时间+良好的网络环境现场收听哦~
想和可爱的小编编们成为小伙伴，一起灌水写作吗？点这里就好啦~
沙龙meta问答版
本期的沙龙meta问答，猴哥专场详细解答的婉君同学通过有道云笔记同步来的一系列优质问题。
点这里查看猴哥与婉君同学的问答图文。
点这里学习宏基因组公众号的刘永鑫博士分享的有道云笔记使用心得
这次猴哥直播的讲解部分，不久前在GCBI学院上讲过类似的，点这里直达上次讲解的视频。
沙龙生信问答版
问：请问下GEO数据库芯片里成组设计的如何做差异表达分析呢？里面一个GSE号就对应了癌VS癌旁。 GEO2R只能做独立的，成组设计的做不了
答（赵忻艺）：现场视频解答
答（赵忻艺的部分文字回答）：是的，通过genespring，采用配对t检验或者用R的统计包。
问：只能分析geo数据？（不编程就能完成差异表达分析-点文字直达）
答（赵忻艺）：现场视频解答
答（赵忻艺的部分文字回答）：这个工具没有用过，geo数据包含很多，不是都能分析的，例如甲基化等等。
问： 请教下，这两个barcode是否分别指向肿瘤样本和正常样本呢
答（赵忻艺）：现场视频解答
答（赵忻艺的部分文字回答）：以前回答过，查看以前的录音。
----其他的相关问题----
问：请问有人可以提供有偿的样品拆分帮助吗，pe接头加index
答（洲更）：你是指原来多个样品用不同barcode建库
问：是的
答（洲更）：于是一个PE结果里有多个barcode标记的样本吗？你可以去看下fastx toolkit
（点这里认识学霸洲更）
----其他的相关问题----
问：请教，我该如何用R选出n段序列超过2个AG双碱基的序列啊
答（赵忻艺）：现场视频解答
答（赵忻艺的部分文字回答）：写个正则表达式匹配下。
问：想问一下群里的同学，有没有知道怎么用DNAman比对氨基酸序列的？其实我想问的是比对序列了后，怎么找到我想要比对的那个氨基酸，就比如我要看第600位的氨基酸，怎么才能找到
答（赵忻艺）：现场视频解答
答（赵忻艺的部分文字回答）：没有用过这软件，但一般软件都有查询定位功能。
问：各位大神，请问GEO中gpr格式的数据怎么用R读取并做火山图和热图？
问：同问。还有txt格式的如何读取？
答（赵忻艺）：现场视频解答
答（赵忻艺的部分文字回答）:Gpr是芯片的一种原始数据格式用genespring或R都可以导入，具体要看芯片的类型采用不用的R包。
问：这个最后一栏的indentifier指的什么呢？
答（赵忻艺）：现场视频，无上下文未解答。
问：请问有没有熟悉cytoscope的大神？想请教个问题：我用这个软件做网络想把go分析中分析出的不同信号通路的蛋白用不同的颜色表示但是不同通路用有相同的蛋白请问怎么在同一个节点标记多个颜色？
答（赵忻艺）：现场视频解答（cytoscope官网寻找）
问：各位大神，请教个问题，TCGA数据库怎么提取临床信息呢，有木有脚本呢？
实名制直播群
~~~~(>_<)~~~~国家规定群主背锅
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猴哥：Freescience公众号meta分析栏目现任主编。讲师，副主任医师，武汉大学肿瘤学博士，专注于胃肠道肿瘤分子生物学机制、系统评价/Meta分析、数据挖掘、临床统计研究。