第六届DPABINet脑网络进阶特训营(云端)通知
DPABINet可以基于DPABISurf/DPARSF的脑功能分析结果以及DPABIFiber的脑结构纤维分析结果进行深入的脑功能/结构网络分析。想要在脑网络研究上抢占先机?快快入营!下一届要再半年之后哦!如果想学习如何用DPABIFiber构建纤维结构网络,可以参加DPABIFiber高阶特训营;如果是脑影像小白,可以参加DPABI基础特训营哦。
【本届进阶特训营培训目标】让医生背景的研究者熟练掌握脑网络和图论相关分析,能够实现以下文章的效果:
1. C. G. Yan et al., Reduced default mode network functional connectivity in patients with recurrent major depressive disorder. Proc Natl Acad Sci U S A 116, 9078-9083 (2019).
2. X. Chen et al., The subsystem mechanism of default mode network underlying rumination: A reproducible neuroimaging study. Neuroimage 221, 117185 (2020).
3. L. Li et al., Eight-week antidepressant treatment reduces functional connectivity in first-episode drug-naïve patients with major depressive disorder. Hum Brain Mapp, 25391 (2021).
4. L. Wang et al., Altered intrinsic functional brain architecture in female patients with bulimia nervosa. J Psychiatry Neurosci 42, 414-423 (2017).
5. H. Yang et al., Disrupted intrinsic functional brain topology in patients with major depressive disorder. Molecular Psychiatry (2021).
人类大脑是宇宙中最复杂的网络系统之一,由约1011 个神经元与约1015 条连接构成。由于人类大脑是一个高度整合和相互协作的复杂系统,研究不同大脑区域之间的相互整合对于理解大脑区域之间的信息交互与大脑网络之间的协调合作至关重要。为了使大脑网络研究能够更简便易行的开展,The R-fMRI Lab PI Dr. Yan特开发了免费开源软件DPABINet。DPABINet已随DPABI发布,能够简洁明了地实现脑网络的构建,图论指标的计算,统计和呈现相关功能。
另外,为了更好地构建脑网络,我们推荐采用DPABISurf对数据进行皮层重建和预处理。DPABISurf是基于大脑皮层的脑成像数据分析软件,解决了基于体空间分析忽视大脑按皮层延展的特性的问题,提高了脑信号提取的敏感性和特异性。DPABISurf可以计算大脑皮层厚度、面积和曲率,还可以计算基于皮层的ALFF/fALFF、ReHo、Degree Centrality和功能连接图等。DPABISurf提供基于皮层的图像统计和显示功能,并可独立于MATLAB运行。
DPABINet和DPABISurf的使用如同DPABI软件一样简单,但手把手的实战培训能够让学员以最正确有效的方式精通DPABISurf和DPABINet脑网络分析。兹定于2023年3月25日至3月27日举办为期三天的第六届DPABINet脑网络进阶特训营(为DPABI系列软件国内独家授权培训)。
本届DPABINet脑网络进阶特训营由The R-fMRI Lab PI Dr. Yan主讲,面向心理学、认知神经科学、生物医学工程学、临床医学等领域的科研人员和研究生,及希望在该领域进行深造的高年级本科生。因为本届特训营为高阶特训营,因此需要学员具有DPABI/DPABISurf/DPARSF的学习基础。(如果不具备相关基础,请务必先参加DPABI/DPABISurf/DPARSF脑影像基础特训营!)在进阶特训营中,学员将首先复习DPABISurf皮层重建和数据预处理,然后系统学习脑网络研究的的基本概念以及DAPBINet软件的相关操作。更为重要的是,要求学员带着自己的项目和数据前来学习,与导师进行深入的研究项目讨论,带着研究问题对数据进行处理,接受手把手的系统科研培训,在特训营期间得到能够发表的研究结果并进行科学阐释。
本届特训营诚挚欢迎您的参与,期待与您在线上相见!
一、时间:2023年3月25日——3月27日
二、地点:DPABI云端特训营。本次特训营采用云端小班形式举办。将在云端会议大厅进行授课和讨论交流学习。在云端小会议室进行小组助教一对一查错辅导。对于本地计算力不够的学员,将开放云端服务器进行数据处理练习。
授课教师(http://lab.rfmri.org/People)
The R-fMRI Lab 成员
本次特训营由DPABI/DPABISurf/DPABIFiber/DPABINet/DPARSF创始人、爱思唯尔 2019、2020和2021年中国高被引学者The R-fMRI Lab PI Dr. Yan主讲,The R-fMRI Lab各位老师和同学担任助教,提供小班教学和一对一辅导。
学员对象为心理学、医学、生物学、计算机、教育学等领域的教研人员、研究生或高年级本科生(需要具有DPABI/DPABISurf/DPARSF学习基础)。
参加培训人员需自带笔记本电脑并提前安装好DPABI软件及示例数据(推荐携带自有数据),具体说明可查阅:
http://rfmri.org/DPABI
http://www.rfmri.org/DemoData
1) 特训:人民币5999元/人。请携带苹果电脑或内存16G以上的Windows电脑(请提前更新到Windows 10最新版或Windows 11)。
2) 特训+DPABI教育工作站套装:人民币14499元/人。费用除(1)中特训外,含价值¥8999的DPABI教育工作站一台(已预装Windows/Linux双系统和DPABISurf,为14英寸轻薄窄边框商务办公笔记本电脑:八代四核八线程i5-8265U, 16G内存, 512G固态硬盘+2T机械硬盘, 指纹识别)。
为了支持青年学者积极学习DPABISurf/DPABINet,本届进阶特训营特针对学生及博士后推出Merit Award。申请者请填写“DPABI进阶特训营学员Merit Award申请表”(http://rfmri.org/DPABIAdvancedCamp_Merit_Award.docx),描述所进行的项目,当前遇到的困难及对特训营的预期收获,发送至question@deepbrain.com。评审获得Merit Award的青年学者即可获得价值人民币1000元的进阶特训营优惠券!
请微信扫描下文二维码在手机上填写信息完成报名。
电话:18710123119
邮箱:question@deepbrain.com
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附:第五届DPABINet脑网络进阶云端特训营回顾
2022年9月24日至26日,第五届DPABINet脑网络进阶特训营在云端成功举办。本届脑网络进阶特训营采用小班现场授课形式,由DPABI/DPABISurf/DPABIFiber/DPABINet/DPARSF创始人、爱思唯尔 2019、2020和2021年中国高被引学者——The R-fMRI Lab PI Dr. Yan亲自主导授课,带领来自全国各地、不同领域的十余位学员进行了为期三天的高强度、高质量的学习训练。
本届特训营上,Dr. Yan系统讲授了基于皮层的数据分析及脑网络分析的基本概念与原理,介绍了最新版的DPABISurf和DPABINet软件各模块的相关操作,并通过对学员手把手地教学指导,帮助学员熟悉软件的各项功能,使学员全面体验DPABISurf和DPABINet模块强大的脑成像数据处理功能。
详细讲授DPABINet脑网络分析功能原理,针对DPABINet最新版本进行加强培训
本次特训营上,Dr. Yan针对最新发布的DPABI V6.2版本中的新功能模块DPABINet进行了系统讲授。人类大脑是一个高度整合、相互协作的复杂系统,是宇宙中最复杂的网络系统之一,研究不同大脑区域之间的相互整合对于理解大脑区域之间的信息交互与大脑网络之间的协调合作至关重要。为了使大脑网络研究能够更简便易行的开展,The R-fMRI Lab特开发了免费开源软件DPABINet。DPABINet随DPABI软件包发布,它能够简洁明了地实现脑网络的构建、图论指标的计算、统计和结果呈现等相关功能。
另外,DPABISurf针对大脑皮层的脑成像数据分析,解决了基于体空间分析忽视大脑按皮层延展的特性的问题,提高了脑信号提取的敏感性和特异性。DPABISurf可以计算大脑皮层厚度、面积和曲率,还可以计算基于皮层的ALFF/fALFF、ReHo、Degree Centrality和功能连接图等。DPABISurf提供基于皮层的图像统计和显示功能,并可独立于MATLAB运行。
DPABINet和DPABISurf的使用如同DPABI软件一样简单。在DPABISurf软件之前,专业脑皮层图像数据处理软件Freesurfer等要求其使用者具有专业的编程技术,这大大限制了该软件的普及率和可利用性。而DPABIsurf/DPABINet基于Freesurfer、fMRIPrep、ANTs、FSL、Circos等领域内最先进图像处理软件的特定模块,结合docker技术,提供了更简洁友好的使用界面,为编程水平有限的使用者免去了诸多困扰和烦恼。同时,本次手把手的实战培训能够让学员以最正确有效的方式精通DPABINet脑网络分析。这不仅为更广大科研人员架设了一座通向脑成像数据处理专业领域的桥梁,而且为进一步扩大脑成像技术的普及,使得其价值作用得到更充分的发挥,以促进人类和科学发展伟大事业添瓦助力。
以人为本的特训安排
本次特训营采用现场小班授课形式举办,在为期三天的训练营上,Dr. Yan现场授课,并亲自一对一指导,同时有多名助教在现场与同学们面对面交流答疑,保证每一位学员都能够完成最新版DPABI V6.2及DPABINet的安装与DPABISurf/DPABINet数据处理流程,并尝试利用该软件推进自己的课题研究。
特训营鼓励每位学员带着自己的项目和问题来参加培训,这不仅可以为每位学员提供具体的学习目标和充分的学习动机,提高培训效果,另外,针对不同学员在研究中不同的数据处理需求,Dr. Yan一一进行了耐心细致的解答;不光解决了学员“DPABINet怎么用” 的基础困难,还解决了学员“DPABISurf及DPABINet脑网络分析如何为不同研究需求提供解决方案”的进一步需求。
在这个互动教学过程中,学员们不仅收获了第一手学习资源和宝贵的软件使用经验,而且通过与The R-fMRI Lab PI Dr. Yan针对自己的科研问题进行直接讨论,改进了自己科研课题实验设计和分析思路。训练营的设计和安排充分考虑了每一位学员的个体差异,采取小班教学,保证了每一位学员都有充分的机会和空间获得高质量的辅导帮助。
9月26日下午的结营仪式上,学员们进行了学习成果汇报交流,并向Dr. Yan及其团队的工作表达了高度肯定和衷心感谢。在经过本次特训营为期三天的培训后,大部分学员都达成了从软件安装到对自己数据的脑网络及图论分析结果进行呈现的飞跃,达成了本次培训的目标,学员们纷纷表达了对未来工作的展望和成果的期待。
未来,DPABI软件将持续更新升级,努力为更广大的研究者们提供操作简单、功能全面、内容专业的脑成像数据分析服务!
第五届DPABINet进阶特训营合影
授课现场The R-fMRI Lab PI Dr. Yan一对一辅导
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