干货 | SEM二维相面积和尺寸分析教程
介绍:
Image J 图像分析软件是美国国家心理健康研究所(National Institute of Mental Health)开发的免费科学图像分析工具,之前被广泛应用于生物学研究领域,从未被应用于材料相面积分析。
笔者在实际操作中发现,这款软件可以轻松处理SEM图像,从而得到二维相面积大小,不同相的实际尺度,相数量等等。但是由于软件限制,目前本款软件最适用于两相结构。
通过操作 Image J 软件,我们可计算选定区域内分析对象,进而得到一系列几何数据。这些几何分析数据包括:长度、角度、周长、面积、长轴、短轴、圆度、最佳椭圆拟合、最小外接矩形拟合以及质心坐标等【1-3】。
问题1:图一中可见明显两相结构-Bright phase and Dark phase,如何得到两相的比例?
相信很多童鞋看到了问题一就会愣住,因为bright phase和dark phase分布的区域非常多,而且相互交叉,印象中好像没有哪款软件可以直接快捷的得到两相的面积比,会PS的同学可以使用魔棒工作,一点点抠图,模糊的估算一下大致的比例,但是相信工作量会异常的大。
当遇到这种情况时候我们的image J软件就有用武之地了。
问题2:求图二中白色相的实际面积以及最长距离。
这个问题其实不难解决,图中已经有了实际的比例尺,求白色相的最长距离,最笨的方法可以用尺子量,就能得出来。但是如何求得实际面积?因为白色相的形状非常不规律,常规方法根本无法计算。
这时候,不要着急,我们可以用image J 软件。
首先我们需要安装image J软件,由于这是一款免费的软件大家可以直接从官方网站下载:https://imagej.nih.gov/ij/,具体的安装流程非常简单,跟着软件安装提示,一步一步的操作即可。
不过当大家发表论文的时候千万记得引用相关文献哦,毕竟免费的软件需要我们大家的支持和鼓励。下面我们直接言归正传的开始解决我们的两个问题。
问题1解决步骤:
(1)首先我们要将SEM图片的白边和上下面的文字全部删掉,这里我们可以用到很多中软件,可以用PS,可以用系统自带的作图工具,甚至可以用美图秀秀。
(2)将裁剪后的图片载入image J 软件。点击open选项,进而载入图片。
(3)这时候我们会看到如下图的显示,最上面的长条叫做TOP BAR,也就是工具栏,工具栏里面有各种画图形,画直线的工具;最下面的图片显示区域,显示了图片的大小。
(4)这时候我们选择image选项-type-8bit或者16bit。这样我们就能得到灰度图片,意味着图片将会以黑白两色显示,这样会便于我们快速分析两相。
(5)这时候我们选择image选项-adjust-threshold选项,设置阈值,我们能发现图中的所有白色相全部变成了红色。
(6)这时候我们发现了白色相已经全部被标记成了红色。
(7)这时候我们选择analyze-analyzeparticles 选项。
(8)我们将看到如下图的操作窗口,由于我们只需要得到两相的比例,所里我们不需要真实的尺寸,我们只需要如下图勾选选项。
(9)点击OK后我们会得到Summary结果框,从框中我们很容易就防线白色相的二维尺度的相面积为27.028%,那我们就能推断出黑色相的二维尺度的面积为100-27.028%=72.972%。
(10)假如你想知道每一块相的面积大小,你可以在第8步时候同时勾选ADD to Manager选项。
(11)这时候我们就能从ROI表中找到每一个编号的相面积大小以及比例。但是如果有很多相并且十分具体,统计上会存在一点误差,并且是软件自行查找。
看到了问题一的解决过程,大家知道了问题二该如何解决吗?实际上我们可以用相同的思路来解决问题二,那么我就将问题二作为一个作业留给大家,也可点击下方二维码进入我们的工程专业群进行讨论,好多志同道合的小伙伴在等着你。
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下期我会继续分享问题二的解决思路,欢迎大家继续关注。
参考文献:
1.毕利东,张斌,潘继花.运用Image J软件分析土壤结构特征:土壤,2009:4 l(4):654-58
2. T. Collins, ImageJ for Microscopy. BioTechniques, 43,S25-S30. http://dx. doi. org/10.2144/000112517, (2007).
3. M.D. Abràmoff, P.J. Magalhães, S.J. Ram, Image processing with ImageJ,Biophotonics international, 11 (2004) 36-42.
雨中专栏
2017-06-06 最新进展 | 氢储存效率增加,新能源革命来临?
作者简介:雨中,加国工科博士男,才高德好素养佳。偶尔做点小实验,思想敏锐人人夸。踏实奋进写论文,至今已得十多篇。交友广泛爱分享,微信日日朋友圈。
目前主要从事固态储氢合金,复杂氢化物储氢材料的制备以及储氢性能改良。在国内外期刊发表SCI论文8篇,授权发明专利2项,实用新型专利1项。
来源 | 雨中 特约投稿发布
供稿 | 学术咖材料学版
编辑 | 小咖咖