环状circRNA与外泌体研究策略与生信实操网络研讨会【国自然热点】
环状circRNA与外泌体研究策略与生信实操网络研讨会
时间:扫码咨询金老师 参会方式:腾讯会议
环状RNA(circRNA)和外泌体(exosome)是当今生命科学领域发展迅速的前沿领域。在高等生物中,存在着一个巨大的、尚未被完全发现circRNA世界,circRNA研究将从全新的角度揭示生命调控的分子机制,并为人类疾病的诊断和防治提供理论依据和新的技术,受到科学家们广泛关注。外泌体可以由多种类型细胞释放,其中含有丰富的miRNA、circRNA等调控性非编码RNA,在细胞间信息交流中发挥重要调控功能。circRNA和外泌体研究不仅受到主流学术期刊的青睐,还是国家自然科学基金等鼓励申报的重要领域。通过参加此次研讨班,有助于缩短发表论文和获得研究基金的周期。因此,我们研究设计了这次环状circRNA与外泌体研究策略与生信实操班,通过集中和系统的学习,可以掌握环状circRNA与外泌体分析与设计相关的策略、数据库、在线工具、本地软件的使用。
如果您是从事医学、动物、植物学等生物学方向的科研工作者(学术),无需有工具操作和编程语言基础,都可以来参加本次培训班。
示例图 外泌体circRNA调控机制图(PMID: 32600329,Mol Cancer,2020)
示例图 外泌体circRNA功能机制图。(PMID: 32713345,Mol Cancer . 2020)
交费方式:A:银行转账账户名称:上海循掘生物科技中心 账户号:1001064709100016561开 户 行:中国工商银行上海市永泰路支行B:支付宝转账收款人:yonghong1028@126.com 户 名:金永红C:公务卡支付
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课程安排
环状RNA与外泌体研究策略与生信分析日程 | |||
时间安排 | 课程表 | 介绍 | |
第一天 | 9:00-10:00 | 环状RNA相关背景 | 环状RNA调控模式 |
10:15-12:00 | 环状RNA研究策略和技术方法 | RNA-RNA、RNA-蛋白质等相互作用研究技术: 报告基因分析、RIP、RNA pull-down、ChIRP、ChIP、Cut&tag、EMSA、FISH、PLA等 | |
13:30-14:30 | 外泌体 | 外泌体分离方法、检测方法和常用数据库 | |
14:45-15:45 | 典型案例分析 | 研究案例分析 | |
16:00-17:30 | 国自然标书解读 | 国自然标书书写交流,近5年内四份环状RNA,外泌体标书全文解析 答疑 | |
第二天 | 9:00-10:20 | 基础简介 | 生物信息介绍 国自然外泌体及circRNA介绍 外泌体及circRNA的创新文献解读 circRNA调控机制 |
10:40-12:00 | 外泌体及circRNA数据来源 | NCBI GEO数据库查找外泌体或circRNA数据 circRNA注释数据库-circBase circRNA编码数据库-circRNADb circRNA-seq高通量测序解读 miRNA注释数据库miRBase | |
13:30-15:00 | circRNA参与的ceRNA关系预测 | ceRNA介绍 StarBase数据库实操 circBank数据库实操 miRWalk数据库实操 ceRNA网络构建 | |
15:15-16:15 | circRNA参与的RBP关系预测 | Circular RNA Interactome数据库实操 catRAPID数据库实操 RBP蛋白功能分析实操 | |
16:30-17:30 | 结果演示 | Cytoscape软件构建网络图演示; R软件构建桑基图演示; | |
答疑 | 答疑 |
培训过程生成图片示例图:
示例图 ceRNA网络图
示例图 非编码RNA调控网络及功能富集分析(pathway)
circRNA参与的调控桑基图sangkey
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