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环状circRNA与外泌体研究策略与生信实操网络研讨会【国自然热点】

医药加 医药加平台 2022-07-15



环状circRNA与外泌体研究策略与生信实操网络研讨会

时间:扫码咨询金老师    参会方式:腾讯会议


【课程背景】

环状RNA(circRNA)和外泌体(exosome)是当今生命科学领域发展迅速的前沿领域。在高等生物中,存在着一个巨大的、尚未被完全发现circRNA世界,circRNA研究将从全新的角度揭示生命调控的分子机制,并为人类疾病的诊断和防治提供理论依据和新的技术,受到科学家们广泛关注。外泌体可以由多种类型细胞释放,其中含有丰富的miRNA、circRNA等调控性非编码RNA,在细胞间信息交流中发挥重要调控功能。circRNA和外泌体研究不仅受到主流学术期刊的青睐,还是国家自然科学基金等鼓励申报的重要领域。通过参加此次研讨班,有助于缩短发表论文和获得研究基金的周期。因此,我们研究设计了这次环状circRNA与外泌体研究策略与生信实操班,通过集中和系统的学习,可以掌握环状circRNA与外泌体分析与设计相关的策略、数据库、在线工具、本地软件的使用。

如果您是从事医学、动物、植物学等生物学方向的科研工作者(学术),无需有工具操作和编程语言基础,都可以来参加本次培训班。



示例图 外泌体circRNA调控机制图(PMID: 32600329,Mol Cancer,2020)


示例图 外泌体circRNA功能机制图。(PMID: 32713345,Mol Cancer . 2020)



【专家介绍】S教授,博导,长期专注于circRNA研究,主持多项国家自然科学基金项目,发表多篇高水平学术论文。具有扎实的理论基础和丰富的研究经验,熟悉调circRNA研究现状,精通研究策略和技术方法。宋伟博士,中国精准医疗学会委员。成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。培训经历:在北京、上海、广州、沈阳、成都、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有:医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。


【学习预期】1.掌握circRNA的调控模式、研究策略、常用研究技术;2.掌握外泌体分离、检测和常用数据库使用方法;3.熟悉circRNA、外泌体等相关国家自然科学基金标书撰写思路。4.掌握circRNA-miRNA分析、预测常用数据库使用方法;5.掌握circRNA-RBP分析、预测常用数据库使用方法;6.掌握circRNA在疾病中调控下游功能通路机制分析方法。


主办方:医药加科研培训中心,上海循掘生物科技中心培训时间: 扫码咨询金老师地点:线上:腾讯会议网络会议室          通过腾讯会议直播,主办方会后统一提供录屏。 收费标准:会务费:3000元/人;优惠政策:1.提前确认报名及转账的,可以提前拿到学习材料2.三人组团报名,每人优惠100元3.四人组团报名,每人优惠200元,4.六人组团报名缴费,可免1人会务费! 可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。 注意事项:使用win10以上系统的电脑。
交费方式:A:银行转账账户名称:上海循掘生物科技中心    账户号:1001064709100016561开 户 行:中国工商银行上海市永泰路支行B:支付宝转账收款人:yonghong1028@126.com     户  名:金永红C:公务卡支付

报名咨询方式:



课程安排

环状RNA与外泌体研究策略与生信分析日程

时间安排

课程表

介绍

第一天

9:00-10:00

环状RNA相关背景

环状RNA调控模式

10:15-12:00

环状RNA研究策略和技术方法

RNA-RNA、RNA-蛋白质等相互作用研究技术: 报告基因分析、RIP、RNA pull-down、ChIRP、ChIP、Cut&tag、EMSA、FISH、PLA等

13:30-14:30

外泌体

外泌体分离方法、检测方法和常用数据库

14:45-15:45

典型案例分析

研究案例分析

16:00-17:30

国自然标书解读

国自然标书书写交流,近5年内四份环状RNA,外泌体标书全文解析

答疑

第二天

9:00-10:20

基础简介

生物信息介绍

国自然外泌体及circRNA介绍

外泌体及circRNA的创新文献解读

circRNA调控机制

10:40-12:00

外泌体及circRNA数据来源

NCBI GEO数据库查找外泌体或circRNA数据

circRNA注释数据库-circBase

circRNA编码数据库-circRNADb

circRNA-seq高通量测序解读

miRNA注释数据库miRBase

13:30-15:00

circRNA参与的ceRNA关系预测

ceRNA介绍

StarBase数据库实操

circBank数据库实操

miRWalk数据库实操

ceRNA网络构建

15:15-16:15

circRNA参与的RBP关系预测

Circular RNA Interactome数据库实操

catRAPID数据库实操

RBP蛋白功能分析实操

16:30-17:30

结果演示

Cytoscape软件构建网络图演示;

R软件构建桑基图演示;

答疑

答疑

培训过程生成图片示例图:

示例图 ceRNA网络图

示例图 非编码RNA调控网络及功能富集分析(pathway)

circRNA参与的调控桑基图sangkey



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