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多组学数据整合挖掘与分析网络精讲班【国自然热点】

医药加 医药加平台 2022-07-15




【医药加】多组学数据整合挖掘与分析网络精讲班


               时间:扫码咨询金老师    参会方式:腾讯会议

【背景介绍】

2021年度国家自然基金医学科学部共批资助10138项目,批助金额总计441310万元。这些项目中大部分都与编码基因有直接或间接的关联。其中,与通路(pathway)关联的有1349项,金额4.89亿;与miRNA相关的有630项,金额2.3亿;与lncRNA相关的有395项,金额1.45亿,与甲基化相关的有213项,金额8748万,与突变相关的有190项,金额7410万;

如何获得有创新意义的疾病靶标基因(mRNA,Protein,lncRNA,circRNA,miRNA,Mutation等)是项目申请及文章写作时最常见的问题。

目前,多组学整合分析是一个非常热门且创新的方向。通过多组学整合分析我们可以更加快速、准确的找到与研究方向关联的biomarks。它的核心原理是期望通过高通量数据,找到所有基因在不同组学水平中的变化并进行分析,获得关键基因在各个组学都有显著作用。

多组学整合分析的原始数据来源有两种:(1)自己采集样本做高通量测序/芯片/质谱等;(2)使用公共数据库中的组学数据(比如TCGA、GEO、EBI、SRA、CGGA、PRIDE等)。

【主要内容】详细内容见下文日程表

  1. 多组学分析常用数据库;

  2. 多组学分析常用软件和工具;

  3. 教授对应的图片制作方法(包含但不限于聚类热图、火山图、富集分析图、Venn图、pathwaymap)


【会议预期】

通过两天两晚的学习,了解多组学整合分析思路对项目及文章的帮助,以及实操常见的数据库、在线工具和本地软件。使得学员可以自己完成一个完整的分析报告并获得疾病相关的靶标基因。

【讲师简介】

宋伟博士

成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。

研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。

培训经历:在上海、北京、广州、沈阳、南京等城市举办过几十场培训班。






































































































【会议日程】


会议时间:扫码咨询金老师

会议地点:腾讯会议网络会议室

主办方:医药加科研培训中心,上海循掘生物科技中心

收费标准

会议费用:3200元/人


优惠政策:

1. 提前报名并付款的,可以预先拿到学习资料

2. 三人组团报名,每人优惠100元

3. 四人组团报名,每人优惠200元,

4. 五人组团报名缴费,额外带一人免费注册同价值学习班!

5、可额外缴纳500元,作为复听费用(复听同样的课程)

可开具正规会务费发票,提供纸质盖章邀请函


付款方式:

A:银行转账

账户名称:上海循掘生物科技中心    账户号:1001064709100016561

开 户 行:中国工商银行上海市永泰路支行

B:支付宝转账

收款人:yonghong1028@126.com     户  名:金永红

C:公务卡微信支付


报名咨询金老师



通过本次研讨会,您将学会以下作图:

示例图通路富集分析结果图

示例图聚类热图分析

示例图 网络图


示例图 pathway map图

示例图 关键基因的KM生存曲线图


示例图柱状图与venn


示例图 相关性散点图


【获得会议通知及课程介绍与报名联系方式】




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