RNA甲基化(m6A)数据分析与课题设计网络精讲班(国自然热点)
肿瘤免疫与新型细胞死亡课题设计及生信分析网络培训班【4月30日-5月1日】
RNA甲基化(m6A)数据分析与课题设计网络精讲班
会议背景
会议目标
授课专家
主要内容
授课方式
1、理论结合实操;
2、案例讲解分析结合;
3、协助分析学员的实际数据
日程安排表
RNA甲基化(m6A)数据分析与课题设计会议日程 | |||
日期 | 时间 | 大纲 | 详细内容 |
周六上午(理论) | 8:30-10:30 | RNA甲基化功能机制 | 1.RNA甲基化研究概述 |
2.RNA甲基化类型、特征、生成和作用机制 | |||
3.RNA甲基化对RNA加工代谢的调控 | |||
4.RNA甲基化调控多种生物学功能的作用机理 | |||
10:45-12:00 | RNA甲基化研究策略及思路分析 | 1.RNA甲基化在疾病等领域中的研究应用 | |
2.通过高分文献解读并总结RNA甲基化调控肿瘤研究思路 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
周六下午(理论+实操) | 13:30-15:30 | RNA甲基化测序和数据分析(一) | 1.RNA甲基化研究技术路线概览。 |
2.RNA甲基化常用的各种测序技术 | |||
3.m6A甲基化的研究思路和分析内容 | |||
4.m6A测序技术流程介绍及测序报告解读 | |||
15:45-18:00 | RNA甲基化测序和数据分析(二) | 5.m6A甲基化测序的项目延伸及思路拓展 | |
6.m6A peak鉴定(R包exomePeak、MACS2)、peak差异分析 (R包exomePeak)、motif分析(Homer、MEME)及peak分布(RMBase)等 | |||
周日上午(理论) | 8:30-10:30
| RNA甲基化多组学整合分析思路及课题设计(一) | 1.RNA甲基化与RNA甲基化蛋白功能网络研究 |
2.整合多组学探索RNA甲基化的功能和机制 | |||
3.RNA甲基化与RNA-seq、Ribosome profiling等数据整合分析 | |||
10:45-12:00
| RNA甲基化多组学整合分析思路及课题设计(二) | 4.非编码RNA(miRNA、circRNA及lncRNA等)的RNA甲基化分析思路 | |
5.RNA甲基化研究策略、课题设计与经验交流 | |||
6.RNA甲基化相关国自然课题介绍 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
周日下午(理论+实操) | 13:30-15:30 | 利用公共数据库和多组学数据进行甲基化课题设计及基金申请(一) | 1.通过TCGA,GEPIA,ENCORI等数据库挖掘RNA甲基化癌症研究思路 |
2.通过RNA甲基化常用数据库(RMBase,m6AVar,MeT-DB,whistle)等明确关键基因的修饰位点 | |||
3.预测RNA甲基化位点在线工具介绍 | |||
4.RNA甲基化修饰基因功能富集分析(DAVID,Metascape等) | |||
15:45-17:30 | 利用公共数据库和多组学数据进行甲基化课题设计及基金申请(二) | 5.RNA甲基化研究常见图形绘制:分布趋势图,饼图,热图,韦恩图,火山图,散点图,GO、KEGG富集图,网络图,累积曲线图,GSEA图等 | |
6.RNA甲基化基金申请写作思路、准备内容及方案设计注意事项等 | |||
7.讨论及个性化问题答疑 | |||
备注 | 上课使用软件为R和Rstudio |
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