[留言讨论专区][例行抢跑] 巴塞尔报告（第六期，2022年10月2日）
前言
照惯例，首先瞅一眼近期变异株增长速度排行榜。
——请品鉴啦（可能需要点开大图）：
以上排行榜按相对增长速度的置信区间最小值排名； 前两名仍然是BQ.1.1和BA.2.3.20不变； 由于第四名XBB的流行区域（印度、尼泊尔、孟加拉等）刚好测序力度有限，所以XBB排名可能有低估； 前任头号种子选手BA.2.75.2的增速放缓，目前已经掉出前十，但BA.2.75家族又有多个新发变异株顶上，包括BN系列、BR系列、BY系列、CA系列等，其中BN.1有望再续辉煌； BA.5家族的另一个后起之秀BU.1也值得关注。
下面开始正式搬运。
第一部分，BQ.1倍增时间仅一周，最迟11月下旬成为欧洲主流毒株
上任种子选手BA.2.75.2果然被截胡了，下手的正是之前提到过几次的BQ.1家族；
BQ.1目前在欧洲和北美的倍增时间差不多是一周左右翻一番，截止9月中旬，市占率差不多1%，所以保守估计，11月下旬之前将成为主流毒株（前提是不会半路杀出新的程咬金）；
BQ.1.1作为BQ.1的子毒株（额外多出刺突蛋白R346T突变），增速更加迅猛，两周时间序列数量翻了七倍多（从29条增加到213条）。
拍老师的画外音：为啥之前预测BA.2.75.2将于10月底完成新老交替，而现在BQ.1反而需要11月下旬前才能完成新老交替？不是BQ.1不够猛，而是它的竞争对象已经不是前任主流毒株（BA.5.2.1），而是一大波同辈甚至晚辈新发变异株
——请继续品鉴：
Tom Wenseleers老师的东西，大家都爱引用~上图咱这边儿也搬运过，结果现在Cornelius小哥重复搬运了……总之，上图估算了BA.2.3.20、BQ.1、BA.2.75.2等的相对增长优势。其中BA.2.3.20和BQ.1基本达成平手，都是每天15%左右（以BA.5.2为基线）；
Cornelius小哥又补充了一嘴：他认为BA.2.75家族其他成员仍然有机会反攻倒算，比如说BN.1；
顺便一提，根据Cornelius小哥估算，在老家尼日利亚，BQ.1已于8月底成功一桶浆糊。
第二部分，其他值得关注的变异株
本期Cornelius小哥点名的几个值得关注的变异株是：BA.2.3.20（排行榜第二）、XBB（排行榜第四）和XBC（测序记录太少暂未上榜）；
其中BA.2.3.20和XBB，之前已经品鉴过不止一次了，这里就跳过吧（延伸阅读：《次世代毒王争霸赛已经揭开序幕（BQ.1.1、BA.2.3.20和XBB）》）；
XBC这货比较新，之前公众号这边也没怎么提到过，这里就详细解说一下吧。XBC大概率起源于菲律宾，现在大佬们比较倾向的假说是——当地有人持续感染了Delta家族某个比较原始的子分支（21I），之后又再次感染了Omicron BA.2，最后两种毒株在宿主体内发生多重重组的产物。
——请品鉴：
↑上图各位想必已经挺眼熟了，Peacock老师PowerPoint杰作，解释一下：
每个横条代表一个重组株的基因组，其中红框框出来那个横条就是XBC（#1100是申请Pango命名时的批次号）；
横条的紫色部分代表来自Omicron BA2的基因片段，绿色部分是来自Delta 21I的基因片段，灰色部分则没法判明到底来自哪一边；
横条上的红色短线代表XBC自己养蛊憋大招养出来的特征突变；
所以跟其他Delta/Omicron重组株相似，XBC的刺突蛋白RBD和S2部分主要来自BA.2，其他部分则大部分是Delta的骨架；
具体而言，XBC在刺突蛋白上的特征突变包括：R19I, P25S, P209L, L212S, D215H, G446S, L452M, F486P, N703I。可以说是相当阴间了……
XBC截止昨天（2022年10月1日）全球一共发现14条序列，但已然分布全球四大洲，包括：菲律宾、韩国（菲律宾输出）、土澳、奥地利和美帝。
——请品鉴：
第三部分，“大趋同时代”
所谓“大趋同时代”（the great convergence），其实就是咱这边从大半年前起就一直念叨的那股趋同演化风潮，只不过大佬们取名的本事更棒，想出来了一个煽情的牛鼻名字而已（鸣谢：密苏里大学Marc Johnson老师赐名）；
上面那张示意图也是Johnson老师的PPT大作（不要问为啥大佬们纷纷选择用PowerPoint搞示意图，问就是随性……），这张图大致表达清楚了这个所谓“大趋同时代”的脉络，下面详细解释。
上图的关键线索，在于Johnson老师的一个假设，即——刺突蛋白346、444、452、460和486这五个位点，是当前适应性背景下，对病毒增益最明显的位点（依据是咱们之前品鉴过的那个Bloom老师的模拟计算器）……
以下姑且称作“五朵金花”吧。
Johnson老师进一步假设：不管是哪个分支的病毒，也不管是通过抗原漂变还是跃迁演化，五朵金花入手数量越多，则越能取得相对于其他竞争毒株的增长优势。
于是，上图位置越靠右的子分支，摘下的五朵金花越多，然后呢从左到右的那些箭头（以及箭头上标注的突变），则代表这些毒株获取五朵金花的过程。
最后，明显可见：
一共有18种不同的变异株获得了三朵金花；
一共有5种（或6种）变异株获得了四朵金花；
只有BQ.1.1一枝独秀，实现了五朵金花全制霸
当然了，咱们不难看出，Johnson老师这张图其实挺糙。
比如说，三朵金花的BA.2.3.20跟五朵金花的BQ.1.1，其中相对增速是差不多的……
但如果不那么吹毛求疵，只是用这张图来大致说明“大趋同时代”的毒株演化路径的话，问题应该不大。
第四部分，“大逃逸时代”
在最后这一部分，Cornelius小哥搬运了北大曹老师他们的最新预印本，说明了新发变异株们逆天的免疫逃逸能力。
这部分咱这边儿已经搬运过了，这里就不重复了，详见：《关于BA.2.75的一些信息更新（2022年9月17日版）》。
总之，两句话总结：
BA.2.75.2、BQ.1.1之类的，全都是免疫逃逸界的顶尖高手，各种疫苗和既往感染史产生的抗体都拿它们没办法；
BQ.1.1可以逃逸市面上所有单抗药；
很可惜，曹老师的预印本面世才不到10天，就已经落后时代了，现如今免疫逃逸界的上限已经变成了XBB，其次是BM.1.1.1，再然后则是CA.1、BM.4.11、BN.1和BM.1.1。一个月前还傲视群雄的BA.2.75.2跟BQ.1.1，现如今已经跌出前五了……
——请最后品鉴：
以上，搬运完毕，各位两周后再见啦！
本人知识星球暂时下线~
预计9月24日恢复（跳票中）。