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[迟到的搬运工] 巴塞尔报告(第九期,2022年11月19日)

拍老师 拍帮主的后花园 2023-02-08
各位周末好~
实在不好意思,这一期《巴塞尔报告》,整整迟到了一周……
不过各位都懂的,这并不是Cornelius小哥的锅,而是咱作为搬运工实在太懒~

前几天忙着写《钉子户养成记》系列,
同时又要响应后台点播,
而且微博那边还得跟人各种撕逼对线,
所以一不小心就拖延症发作了

正好这一期比较简短,所以随便搬运搬运得了,然后咱再自己加点料吧。
(上一集请见:巴塞尔报告(第八期,2022年10月30日)



第一部分,BQ.1大家族的多样化
  • BQ.1*大家族内部正在发生微型的趋同演化热潮,各个增速较明显的子分支纷纷不约而同地活动刺突蛋白R346T和Y144del突变。这俩突变已然多次独立冒头。

  • 目前来看,在BQ.1*的骨架上,刺突蛋白Y144del突变的增益几乎和R346T持平。

  • 大致来说,截止现在(2022年11月11日),大约三分之二的BQ.1大家族成员带有刺突蛋白R346T,大约三分之一带有刺突蛋白Y144del,大约15%则做到了既要又要……这些既要又要的BQ.1成员们,比起普通款BQ.1增速快了每天5%左右,或者大致相当于每两周翻一番。

  • BQ.1.1子分支最近继续分化出了两个第八阶子毒株,但这两个第八阶高手都没有S:Y144del突变,而且目前绝对数量太少,所以还暂时看不出来增速。其中CZ.1(即BQ.1.1.1.1)额外获得了S:F490I突变,已在四个国家现身,有可能免疫逃逸能力比BQ.1.1更牛鼻;而CW.1(即BQ.1.1.14.1)额外获得了S:G446S突变,目前还是英国独家限量版。




第二部分,XBB大家族仍然活跃

  • 尽管目前来看,BQ.1大家族带有S:R346T和S:Y144del的子毒株在北美和欧洲的增速应该超过了XBB,但在近未来,BQ.1和XBB两家能否河蟹共存仍然有悬念。

  • XBB这边比较有看点的子毒株包括:XBB.1.1(额外获得了S:E484T)、XBB.1.5(额外获得了S:F486P)、XBB.4(额外获得了S:K444R),以及XBB.4.1(额外获得了S:K444R和S:T470N)。




第三部分,XBB适应性略逊一筹,但仍有共流行的可能


  • 在坡县,XBB已经成为主流毒株超过两个月,但流行率基本在2/3左右徘徊。剩下1/3则主要是各种BA.5和BA.2.75子毒株。这种迹象可能代表着宿主免疫背景已经开始多样化,而这种多样化背景的一个后果就是——多毒株共流行——当然,现在还没有实锤,但坡县的BQ.1流行率正在持续低位攀升。

  • 由于缺乏测序数据(尤其是BQ.1大本营尼日利亚),所以目前还不清楚BQ.1和XBB之间的交叉免疫情况,总之,需要继续观察,才能确认到底会不会发生多毒株共流行。




第四部分,值得关注的新发子毒株

  • CH.1.1(即BM.4.1.1.1.1,或BA.2.75.3.4.1.1.1.1),在BA.2.75基础上额外多出了刺突蛋白R346T、K444T、L452R和F486S,目前已在全球多地出现(拍老师的画外音:咱们这边已经抢跑过啦)

  • CJ.1(即BM.1.1.1.1,或BA.2.75.3.1.1.1.1),在BA.2.75基础上额外多出了刺突蛋白R346T、F486P和F490S(拍老师的画外音:咱们这边也抢跑过啦)

  • XBF,土澳独家限量版,BA.5.2.3和CJ.1的重组株,其中刺突蛋白RBD部分继承自CJ.1(拍老师的画外音:这个终于没抢跑过……)

——之前关于CH.1.1和CJ.1的抢跑,请品鉴:

以上,搬运完毕!鸣谢Cornelius小哥~
原文传送门:
https://github.com/neherlab/SARS-CoV-2_variant-reports/blob/main/reports/variant_report_latest_draft.md



下面进入加料时间。照惯例,走一个天阶序论排行榜呗。(关于“天阶序论”这个黑话的典故请见:世界名画赏析之《天阶序论》
——请品鉴:
一句话总结:
  • 这是一个战力通膨的时代……七阶遍地走,六阶不如狗,五阶更是差点从排行榜上消失了
  • 这又是一个无限内卷的时代……XBB和BQ两大门阀如日中天,但增速排行榜冠军却被过气的BA.2.75家族最新小选手CH.1.1火中取栗



继续加点料呗。Cornelius小哥念叨的“多毒株共流行”,已然在土澳成为了现实……
——维州,XBF成绩亮眼:
——昆州,BQ.1.1一骑绝尘:
——新州,BR.2.1一枝独秀:

当然了,土澳的问题,还不止是BQ.1、BR.2.1和XBF,
而是说,各大变异株到了土澳,增速都跟在其他地方不大一样……
难道是土澳宿主们的免疫背景有啥独到之处?

——具体来说,请品鉴:
以维州和新州为例,
XBB直接萎了可还行?
新州的XBC又为啥在涨???




最后例行抢个跑吧。

——请品鉴:
XBB和BQ.1两大家族,
已然在印尼成功合流。

以上!各位下期再见啦。



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