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柳叶刀最新论文:2019-nCoV的基因组序列与人类SARS病毒不同

柳叶刀 柳叶刀TheLancet 2020-09-14

《柳叶刀》1月30日发表两篇关于2019新型冠状病毒的研究论文。本研究是对取自武汉市9名患者的10株新型冠状病毒基因组序列进行了新的遗传分析,发现该病毒与两种源自蝙蝠的SARS类似冠状病毒的关联最为密切。柳叶刀针对2019新型冠状病毒研究创建“2019-nCoV资源中心”,所有相关内容完全免费获取。





  • 2019-nCoV很可能是最近才侵染人类并且被相对迅速地检测出来。

  • 该病毒进入人类细胞所使用的分子“通道”可能与严重急性呼吸系统综合症(SARS)病毒相同。


《柳叶刀》1月30日发表一项研究,对取自武汉市9名患者的10株新型冠状病毒(2019-nCoV)基因组序列进行了新的遗传分析,发现该病毒与两种源自蝙蝠的SARS类似冠状病毒的关联最为密切。

 

作者认为,尽管该分析表明蝙蝠可能是该病毒的原始宿主,但在武汉市华南海鲜市场出售的某一种动物可能是将该病毒传播至人的中间宿主。因此,对该病毒的演变、适应和传播仍亟需进一步调查。

 

在本研究中,作者报告了9名不明原因的病毒性肺炎患者的流行病学数据。通过对患者肺部采集到的细胞和分泌物样本进行提取和培养,获得2019-nCoV病毒样本,并对其进行分析以明确病毒的起源和其进入人体细胞的方式。

 

在这9名患者中,有8名患者曾去过华南海鲜市场;1名患者从未去过该市场,但在发病前曾就住于市场附近的一家酒店中。

 

作者在取自患者的全部10份基因样本中均发现了2019-nCoV,包括8个完整基因组和2个部分基因组。各样本的基因序列几乎完全相同(超过99.98%的基因序列相同),这表明该病毒是最近才侵染人类。

 

值得关注的是,本研究发现来自不同患者的2019-nCoV病毒基因序列几乎相同。这一发现说明,分离得到的2019-nCoV起源于同一来源,传播发生的时间还很短,并被相对迅速地检测出来。但是,随着病毒传播给更多的人,对突变的发生进行不断的监测是有必要的”, 该研究的通讯作者之一、山东第一医科大学(山东省医学科学院)、山东省高等学校新发传染病病因流行病学实验室史卫峰教授表示。[1]

 

将2019-nCoV的基因序列与病毒库进行对比,作者发现与其关联最为密切的病毒是源于蝙蝠的两种SARS类似冠状病毒(bat-SL-CoVZC45和bat-SL-CoVZXC21) ,共有基因序列达88%。从遗传学角度来说,2019-nCoV与人类SARS病毒(基因序列相似性约为79%)和中东呼吸综合征(MERS)病毒(基因序列相似性约为50%)相差较大。

 

通过研究该病毒的棘突蛋白(与细胞受体结合并促使侵入人类细胞的病毒表面蛋白),研究人员发现2019-nCoV的棘突蛋白与人类SARS病毒具有相似的结构,尽管存在一些细微差异。因此,作者提出2019-nCoV可能与SARS病毒使用相同的分子通道(受体为ACE2)进入细胞,但这一点仍然需要进一步确认。

 

根据数据分析,作者指出导致武汉市疫情爆发的2019-nCoV最初的宿主可能是蝙蝠,并通过在华南海鲜市场出售的某种目前尚未明确的野生动物传播给人类。

 

中国疾病预防控制中心武桂珍教授说:“这些数据与蝙蝠携带的冠状病毒库大体一致,特别是2019-nCoV。尽管蝙蝠在此次传染病流行过程中很重要,但在蝙蝠与人类之间仍然存在其他动物作为中间宿主的可能”。

 

她解释道:“第一,疫情的首次报告是在2019年12月下旬,彼时武汉的大多数蝙蝠都在冬眠;第二,在华南海鲜市场上未发现有蝙蝠或出售蝙蝠,但是有许多非水生动物(包括哺乳动物);第三,2019-nCoV与它的近亲bat-SL-CoVZC45和bat-SL-CoVZXC21 之间的基因序列相似度不到90%,这意味着这两种源于蝙蝠的冠状病毒并不是2019-nCoV的直接祖先;第四,在SARS和MERS中,蝙蝠都是其自然宿主,另一种动物作为中间宿主,而人类作为最终宿主。这再次说明该病毒在野生动物中存在着未知的中间宿主源并且有可能通过中间宿主传播给人类。” [1] END


NOTES TO EDITORS(上下滑动查看)


The first study was funded by National Key Research and Development Program of China, National Major Project for Control and Prevention of Infectious Disease in China, Chinese Academy of Sciences, Shandong First Medical University. It was conducted by researchers from Chinese Center for Disease Control and Prevention, Universities of Shandong, Shandong First Medical University and Shandong Academy of Medical Sciences, Hubei Provincial Center for Disease Control and Prevention, BGI PathoGenesis Pharmaceutical Technology, Chinese Academy of Sciences, People’s Liberation Army General Hospital, Wenzhou Medical University, University of Sydney, The First Affiliated Hospital of Shandong First Medical University.


[1] Quotes direct from authors and cannot be found in text of Articles.



*中文翻译仅供参考,一切内容以英文原版为主。



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