衰老T细胞：癌症治疗的潜在生物标志物和靶点 | EBioMedicine6月刊精选
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论文精选
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衰老T细胞：癌症治疗的潜在生物标志物和靶点
T细胞未能根除肿瘤微环境中的肿瘤细胞主要是由于T细胞功能障碍所致。具有增殖和效应器功能缺陷的衰老T细胞在老化、慢性病毒感染和抗原刺激持续存在的自身免疫性疾病中积累。越来越多的证据表明，诱导T细胞衰老是恶性肿瘤逃避免疫监视的关键策略。在这篇综述中，作者总结了衰老T细胞在肿瘤发展中的一般特征、功能调节和信号网络，并强调了它们作为多种癌症治疗（包括化疗、放疗和免疫治疗）预后生物标志物的潜力。此外，作者讨论了预防或恢复肿瘤特异性T细胞衰老的可能治疗策略。了解这些关键问题可能会提供增强癌症免疫治疗的新策略。
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在叙利亚仓鼠中比较新出现的SARS-CoV-2变异株的传染性和毒力
新的SARS-CoV-2变异株正在全球范围内出现并传播，其可具有更易传播、更具毒性和/或逃避自然获得和疫苗诱导的免疫力的威胁。人们目前至少已经确定了三个主要的原型变异株，包括英国（B.1.1.7）、南非（B.1.351）和巴西（B.1.1.28.1）变异株，这些变异株正在取代以前的优势毒株，导致新的COVID-19流行病。在本研究调查中，作者利用叙利亚仓鼠，研究了两种受关注的原型变异株B.1.1.7和B.1.351相较于两种基础SARS-CoV-2毒株的传染性和毒力。他们发现，新的变异株可以非常有效地感染仓鼠下呼吸道，其与基础毒株的感染力相当。此外，变异株造成的疾病结果（包括组织学评分、微型计算机断层扫描以及特定的抗病毒和促炎细胞因子表达谱）与基础毒株引起的结果相似，这与感染这些变异株的患者的临床证据一致。值得注意的是，变异株B.1.1.7在仓鼠中可以强烈提升促炎细胞因子水平。这项研究为相关的临床前感染模型奠定了基础，这对于评估当前和未来的疫苗和针对B.1.1.7和B.1.351变异株的治疗方法是必要的。
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长链非编码RNA和DNA甲基化介导的转录失调的泛癌特征
长链非编码RNA（LncRNA）长期以来被认为是染色质的一个组成部分，参与表观遗传修饰过程。最新的体外研究证据表明，lncRNA可以通过与许多表观遗传调节因子相互作用来调节DNA甲基化，从而在不同条件下调节细胞中的基因表达。但是，目前还缺乏系统性的对这一调节机制的全面研究。此外，目前尚无研究系统地探索这种表型背后的一般机制及其在肿瘤发生中的影响。通过对来自癌症基因组图谱（TCGA）的18种人类主要癌症的5,970 个样本的全基因组表达、DNA甲基化和拷贝数变异图谱的综合分析，作者首次表明lncRNA 相关的DNA甲基化调控在多种癌症类型中普遍存在且保守。他们提出并探索了四种潜在的调控关系，可以解释蛋白质编码基因的甲基化和相关lncRNA。此外，作者还研究了lncRNA 相关的DNA甲基化调控在它们参与的基本生物学过程和呈现的癌症特征方面的生物学和临床意义。此项工作从表观遗传调控及其对肿瘤发生的影响的角度，为研究lncRNA与蛋白质编码基因之间的复杂相互作用提供了新的思路。
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体育锻炼是肌萎缩侧索硬化（ALS）的危险因素：来自孟德尔随机化、转录组学和风险基因型分析的一致证据。
肌萎缩侧索硬化（ALS）是一种普遍致命的神经退行性疾病。ALS是由基因-环境相互作用决定的，对这些相互作用更好的理解可能会导致有效的个性化医疗。体育锻炼在ALS 发展中的作用目前存在争议。在本研究中，作者第一次提出了体育锻炼是ALS发展的一个致病因素的孟德尔随机化证据。此外，作者通过测量运动对ALS风险基因表达的影响来解决基因-环境相互作用。最后，作者详细分析了体育活动与ALS最常见的遗传风险因素-C9ORF72的六核苷酸（(G4C2）重复扩增之间的关系。实验结果表明，参与频繁和剧烈的体育活动是ALS 的风险因素，特别是在某些风险基因型的背景下。这可以解释先前研究中的一些争议，这些研究在很大程度上忽略了ALS患者的遗传异质性。这项研究结果为未来的研究提供了一个平台，以前瞻性的方式在选定的谱系中探索特定基因型与运动诱发的ALS之间的相互作用。
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血液RNA标记物组RISK4LEP可在临床发病前数年预测麻风病
麻风病是一种由麻风分枝杆菌引起的传染病，其在中低收入国家仍然构成相当大的健康和经济威胁。不幸的是，麻风病经常被延误或误诊，导致不可逆转的残疾和畸形。在临床症状出现之前识别有患麻风病风险的个体，对于减少麻风相关的残疾以及细菌的传播至关重要。在本项研究中，作者收集了孟加拉国麻风病患者家庭接触者的静脉血，以确定预测麻风病发展的转录组生物标志物。血液采集在招募没有任何症状的参与者入组时和麻风病确诊时进行。他们通过RNA测序技术研究出现任何症状之前的进展者与健康人之间，以及每位进展者纵向的差异基因表达。作者使用机器学习方法（Random Forest）确定了预测麻风病的标记物组，并使用逆转录定量PCR (RT-qPCR)进行验证。标记物组RISK4LEP包含4个基因（MT-ND2, REX1BD, TPGS1, UBC），可在麻风病临床诊断4-61个月之前预测其发展。该标记物组具有用于麻风诊断测试的潜力，因为它基于未受刺激的全血和少量基因，因此具有快速、用户友好的即时检测的基本特征。END
*中文翻译仅供参考，一切内容以英文原文为准。
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