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R-地理数据处理基础-NC格式数据读取,可视化及导出为GeoTiff文件
目录
0.问题导入
1.示例数据
2.将NC文件中的FSDS变量导入为raster
3.数据可视化检查(图2)
4.结果写入GeoTiff文件
5.总结
6.解决本示例问题所采用的R-packages
7.致谢
0. 问题导入
目前,很多地理数据均存储为NetCDF格式(下简称NC格式),而往往内含多变量,不方便处理。其中,一种解决思路就是将NC格式文件中的多个变量数据转格式为单变量的GeoTiff文件(图1),进而进一步处理。
1. 示例数据
本示例数据格式为NC格式数据,内含7个变量。
ncfile = ncdf4::nc_open('L:\\JianShu\\2019-12-4\\data\\clmforc.Qian.c2006.T62.Solr.1972-01.nc')names(ncfile$var)
[1] "EDGEE" "EDGEN" "EDGES" "EDGEW" "FSDS" "LATIXY" "LONGXY"
2. 将NC文件中的FSDS变量导入为raster
input_nc = 'L:\\JianShu\\2019-12-4\\data\\clmforc.Qian.c2006.T62.Solr.1972-01.nc'varname = 'FSDS'
nc2raster = raster(input_nc, varname = varname)
3. 数据可视化检查(图2)
png("L:\\JianShu\\2019-12-4\\plot1.png",height = 15,
width = 20,
units = "cm",
res = 1000)
print(levelplot(nc2raster))
dev.off()
4. 结果写入GeoTiff文件
重点来啦,最重要的是要保证writeRaster 函数中的 overwrite 选项设置为 TRUE ,否则二次读取再存储系统会报错!
Error in .getGDALtransient(x, filename = filename, options = options, :filename exists; use overwrite=TRUEError in .getGDALtransient(x, filename = filename, options = options, :
filename exists; use overwrite=TRUE
因此
output = 'L:\\JianShu\\2019-12-4\\FSDS.tif'writeRaster(nc2raster, output, format = 'GTiff', overwrite = TRUE)
5. 总结
本篇主要解决了以下几个问题:
如何读取并导入NC文件?
如何将NC文件中的变量进行空间可视化?
如何将NC文件导出为GeoTiff格式?
6. 解决本示例问题所采用的R-packages
library(raster)library(ncdf4)
library(rasterVis)
library(lattice)
7. 致谢
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