希望组率先获取Nanopore R10芯片，敬请期待超高共有序列准确度！

Nanopore准确度是大家关心的一个重要问题，而目前Nanopore测序准确度最高的R10芯片将于2019年7月22号在希望组武汉测序中心全国首发，这是继5月份引进全球首台商业化PromethION 48测序仪之后，希望组Nanopore测序服务的再次升级！R10是牛津纳米孔公司（Oxford Nanopore Technologies）开发的新型纳米孔测序芯片，相比于之前的R9.4.1版本，它的纳米孔通道更长，并具有双读头（dual reader-head），性能大幅度提升。下面，我们一起来看看官方测试的R10芯片的亮眼表现吧！

图1 希望组PromethION 48 测序仪

Reader head加倍

目前Nanopore测序通用版本R9.4.1有一个纳米孔通道，一个Reader head；而R10具有两个Reader heads，纳米孔通道更长，凭借这一特点R10能够检测更多的碱基信号，极大提升了同聚物区域的测序准确度。

图2 R10和R9.4.1纳米孔在同聚物区域的比较

Q50共有序列准确度

R10现在可以提供与R9.4.1相当的原始读取准确度，但提高了共有序列准确度。在模拟群落金黄色葡萄球菌（S. aureus）样本上已达到Q50（99.999％）的共有序列准确度，这相当于每100,000个碱基中只有1个错误！

图3 R10和R9.4.1原始读长准确度及共有序列准确度

不重叠的错误区域

如图4所示，合并金黄色葡萄球菌的数据集，发现R10和R9.4.1中的错误没有重叠，将两种类型的数据叠加在一起后极大地提高了序列的准确性，只有一个错误位点。因此R10和R9.4.1数据的组合可以相互校正产生更高的共有序列准确度。

图4 R10和R9.4.1错误分布没有重叠

测序通量对比

24小时运行时间的数据量比较显示，R10芯片产量在11Gb左右，相对于R9.4.1有所下降，但随着接下来对运行条件的进一步优化，通量还会得到进一步提高。

图5 R10和R9.4.1测序通量对比

以上为R10芯片在微生物等小型基因组上进行的测试，相比R9.4.1，具有双Reader head的R10芯片在同聚物区域的准确度、共有序列准确度方面得到了极大提升。同时R9.4.1和R10不重叠的错误区域，提供了利用两种数据的组合产生更高的共有序列准确性的新思路。

牛津纳米孔公司还将继续在软件，分析算法，化学试剂等方面进行优化，进一步改善R10芯片的产量，易用性和准确性，从而为纳米孔测序提供更广泛的应用。希望组作为纳米孔测序技术应用的先锋，将于2019年7月22号在希望组武汉测序中心全国首发R10芯片，并迅速在不同样品中评估和测试其性能和特点，最新进展敬请期待！