NOESY实验混合时间(mix time)参数优化(原创)
NOESY实验mix time 参数设置
NOESY谱,特别是质子与质子之间的NOESY谱,因其可以提供核与核之间的空间距离信息而被广泛使用,特别是研究生物大分子的结构,必然少不了NOESY谱的距离约束信息进行结构计算,而NOESY谱提供的距离约束信息的数量和质量,直接影响了后续生物大分子的结构计算。很多化学、生物领域的研究者利用NOESY谱,对分子结构和构象进行研究。NOESY提供的距离信息,来源于交叉弛豫,而偶极偶极相互作用是交叉弛豫的主要贡献者,偶极偶极相互作用是核与核之间的直接相互作用,受核与核之间的距离影响,在一定的条件下,偶极偶极弛豫速率与核之间距离r有近似如下的正比关系:~ 1/r6。因此,在1H-1H NOESY谱,质子A与质子B出现了交叉峰就表明质子A和B在空间上非常靠近,无论质子A和B之间相隔了多少个化学键,甚至是质子A和质子B分别属于不同的分子。
NOESY实验的基本脉冲序列如下图所示,由3个90°脉冲和时间延迟组成,其中,一个关键的实验参数就是混合时间(mixtime)tm,在Bruker谱仪中是参数d8,混合时间tm设置合适与否,直接关系到NOESY谱能否提供足够有效的距离信息。混合时间太短,不能建立足够的NOE效应,时间太长,NOE效应会衰减,大分子的效应更加明显。
一般来说,由于大分子存在自旋扩散效应,混合时间tm一般设置在50ms-150ms之间,而不适宜更大的混合时间;对于小分子,我们可以使用下列方法对混合时间tm进行优化,方法如下:
调用t1ir1d脉冲序列,t1ir1d脉冲序列即用来测量纵向弛豫T1的反转恢复法的一维实验序列,如下图所示,首先,将弛豫参数d7设置为一个比较大的值,比如10秒,采集一个氢谱,进行相位校正并保存相位参数。然后调整时间延迟d7,直到所有信号都最小,此时的时间延迟d7足以小分子建立NOE效应,这个时间延迟d7就是小分子最佳的混合时间tm;对于较大的分子,混合时间tm可以取d7的70%左右,而大分子,要远远小于这个值,一般以经验值为准。
NOESY谱是实验中最难获得高质量的谱之一,即使是有很多实验经验的人,针对某个具体的实验样品,也需要多次摸索的,很少有一次就成功的。
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