检测这几种口腔菌，能区分HIV患者有没有肺病
研究名称：Alterations in oral microbiota in HIV-infected individuals related to pulmonary function
来源：第20届“艾滋病副发病变和药物不良反应”国际研讨会
去年10月，第20届“艾滋病副发病变和药物不良反应”国际研讨会在美国纽约召开。
多位国际专家分别介绍了可能影响艾滋病患者的日益复杂的问题，包括肺病、动脉粥样硬化、中枢神经系统功能障碍和克隆造血。
艾滋病（HIV）是慢性阻塞性肺病（COPD）的一个独立风险因素。超过六成的HIV患者，都至少存在一种呼吸道症状。但其中的机制还并未完全明确。
在目前的医学认知中，COPD的发病机制与吸烟、老龄化、使用抗逆转录病毒药物以及免疫系统的重建有关。
而近年来有关微生物学的研究，逐渐为科学家们打开了一个新的视角：微生物群的改变（及其相关炎症、免疫激活），有可能在病变过程中扮演重要角色。
视频地址：
https://www.intmedpress.com/comorbidities/2018webcasts/
在这场专题研讨会上，来自匹茨堡大学的医学博士Yang Libing发表了名为《Alterations in oral microbiota in HIV-infected individuals related to pulmonary function （HIV感染者口腔微生物群与肺功能的关系）》的主题报告。
他们的研究小组发现：
在肺功能异常的HIV患者中，口腔微生物群发生了改变。但这种改变并未出现在无肺功能异常的HIV患者中。
“这意味着，肺功能异常与某些细菌有关。口腔微生物在HIV慢性肺部疾病的发病机制中起独特作用。我们所观察到的这些特异细菌，也许可以作为HIV患者肺功能障碍的生物标志物”，杨博士说。
HIV患者是否存在COPD，与口腔菌群有关
对于HIV COPD，最常见的一种表现是：一氧化碳（DLCO）扩散能力降低。
在这项实验中，杨等人收集了168名男性（其中75名HIV阳性、93名HIV阴性）志愿者的唾液和粪便样本，使用16S测序和LEfSe方法发现：
相对HIV阴性组，HIV阳性组的口腔微生物群α多样性较低（也就是较不健康）；
在微生物群的组成上，HIV阳性和阴性组具备显著差异；
不论是HIV阴性还是阳性，吸烟行为都可以改变他们的口腔菌群。但在HIV阳性组中，吸烟行为与口腔微生物组的关联更为强烈。
而口腔菌群的分析结果显示，根据HIV阳性患者的DLCO扩散能力不同，微生物群也不同。
值得注意的是，只有HIV阳性患者，才伴随口腔菌群α多样性的降低。而这种DLCO与口腔菌群的关联，没有在HIV阴性组观察到。
（红色）特定的细菌种类与肺损害有关，包括 Veillonella、Streptococcus、Lactobacillus 菌；
（绿色）特定的菌属与正常的肺功能有关，包括 Prevotella、Fusobacterium、Parvimonas 菌等。
这意味着，口腔菌群在HIV COPD的病理学中存在独特作用。“或许我们可以将相关的口腔细菌和相关炎症作为干预HIV-COPD的靶标”，杨博士说。
不过，研究小组并未在粪便菌群中观察到几个分类组的显著差异。尽管在肺功能正常/受损组中，几个数据点显示出了不同。
对此，杨博士表示计划收集更多的样本，并进一步观察这是否是由样本量不足导致的。
口腔微生物群作为生物标志物的潜力
我们已经知道，口腔微生物群落是一个复杂的生态系统，具有抵抗病原体、维持体内平衡和调节免疫系统的功能。
而牙齿的舌、颊粘膜、龈上和龈下表面、软腭和硬腭以及唾液，代表了不同的生态位或生境，栖息着不同种类的微生物群落。
比如，在舌头上，科学家们观察到了Veillonella atypica, P gingivalis, Selenomonas subspecies, Actinobacillus actinomycetemcomitans, Prevotella intermedia 和 Capnocytophaga 菌；
而口咽部栖息的成员是Streptococcus pyogenes, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenza, Haemophilus parainfluenzae菌。
口腔微生物组已被认为是一种较理想的口腔肿瘤生物标志物，科学家们很早就观察到微生物在口腔癌发生、发展中的作用。一支上海交大研究小组2017年9月发表于《Scientific Reports》的研究表明：
一些与牙周炎相关的细菌，包括Fusobacterium, Dialister, Peptostreptococcus, Filifactor, Peptococcus, Catonella 和 Parvimonas菌在口腔鳞状细胞癌（OSCC）样本中显著富集。一些与Fusobacterium 菌相关的OTUs有良好的诊断标志物潜力。
牙龈卟啉单胞菌在OSCC发生发展中的作用
甚至，口腔细菌与部分远端器官癌症也有关联，比如结直肠癌、胃癌：
2017年，爱尔兰科克大学分析了99例CRC患者、32例息肉患者和103例健康人的口腔拭子、结肠粘膜和粪便微生物群发现，与对照组相比，CRC中也存在多种高丰度的口腔菌群，如 Streptococcus 和 Prevotellas pp.菌。
他们为此开发了一种基于口腔和粪便微生物群的分类器，可将患有CRC和腺瘤的个体与健康对照组区分开来，而且，这一分类器对腺瘤的鉴别能力要高于传统检测方法。
点图回顾：《22种癌症相关消化道菌群：筛查、诊断和预后标志物》
相对于肺部来说，口腔微生物群易于获得，且生物量高。过往的报道已经发现，某些种类的 Veillonella 和 Streptococcus菌与炎症有关，在口腔健康状况不良的人群中，也发现了大量 Lactobacillus 菌。
此外，一些口腔细菌还被发现与阿尔茨海默症、儿童肥胖症和慢性营养不良有关。
当然，其中的潜在机制，仍然需要时间跨度更大，以及更多的研究去调查。
在本次研究中，杨等人的猜测是：口腔微生物群通过吸入和弥散进入肺部。口腔和肺微生物群的改变，以及相关的代谢和免疫反应的改变，进一步导致了肺损伤。
点图回顾《Nature子刊“肠-肺轴”重磅综述：肺部菌群与呼吸系统疾病》
相关阅读