GO分析傻瓜式操作,分分钟搞定,一表三图完美可视化!
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给你一些基因,第一列是基因名,第二列是logFC(基因的变化倍数)。如下:
怎么预测他们的功能?那就是做GO分析,预测基因集的功能。
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symbol是数据,GO傻瓜式高级代码是代码。操作完后你可以得到一表三图。表是说明了这些基因的功能是什么。三图是通过三种方式对结果进行可视化。
一表三图
前面两图一表说明这些基因参与什么生物学过程,而最后这张图又诠释了每一个过程里面具体是那几个基因参与,简直完美。
那么操作呢?安装R,安装Rstudio,打开GO分析傻瓜式高级代码.R:
首先ID转换(安装、加载使用org包):
随后GO分析及可视化(安装、加载、使用clusterprofiler包):
OK,这样基因的GO分析就出来了,非常傻瓜式的操作,3图1表就搞定了。长按下方二维码关注公众号《医学人才帮》,回复“528”即可免费领取该GO分析测试数据及傻瓜式万能代码:
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