赛哲生物CTO林东旭：回首2020，持续深耕病原微生物诊断百亿市场｜大咖说
世界卫生组织（WHO）发布的《2019年全球卫生估计报告》显示，2019年肺炎与其他下呼吸道感染是最致命的传染病，是全球第四大死亡原因。而传染病的可怕之处在于，其可直接或间接地在人与人之间传播，且病毒传播速率极快，在无医疗控制条件下，能迅速波及大片区域甚至全球。随着全球化的发展，疾病的传播也变得越来越快，感染范围越来越广。
在我国，每年有超过10亿人次发生传染病感染，其中的绝大多数常见感染通过经验性的治疗和常规的检测手段都能解决，但每年还有约2000万人发生疑难、危重感染，且这部分感染属于诊断的空白地带。
应对传染病爆发的关键在于明确传染病的病原体。在感染病原体诊断领域上，作为国内较早进入基于宏基因组新一代测序技术（mNGS）临床检测的企业、并专注病原微生物领域已逾十年的，广州赛哲生物科技股份有限公司（简称“赛哲“）近期也对宏微RPD-seq检测服务产品进行大幅度的升级，包括破壁，提取，去宿主，建库，数据分析等技术环节。
病原体诊断，感染临床诊治的新方向
赛哲首席技术官（CTO）林东旭是赛哲技术团队的新血液。“我觉得我的加入，无论对于赛哲还是我自己，都是一个双赢的决定，”林东旭说。除了高通量测序技术（NGS）外，赛哲也有基于荧光定量qPCR平台和免疫层析平台的产品，这些都是体外诊断产品（IVD）产品。这其中有些已经完成了临床试验，并且预计赛哲明年会增加到多个二类/三类体外诊断试剂注册证。
在实现检测领域智能化、数据化的路径上，赛哲的软件产品iSagene也已经投入应用。据林东旭介绍，iSagene分为线上和线下两个版本，线上是基于云平台，可以在手机上下载客户端方便操作，线下系统作为服务器可以在医院投放。无论是线上还是线下功能都可以实现全流程的自动化，如数据分析的自动化和输出报告的自动化。在测序设备方面赛哲也进行相应的布局，包括和illumina合作开发Fontosage Miniseq【中文名：灵雀】测序仪在传感染方向的应用等。林东旭总结道：“赛哲的布局贯穿从产业上游仪器到下游数据分析、从临床服务到试剂报批的全产业链的打造。”
行内对于检验学最大的疑问是，即使检验技术研究再发达，如果临床医生拘泥于传统技术，对新技术不接受、不使用，那么技术等于被闲置了。林东旭则表示，这些猜想并不存在。他认为，感染病原体诊断研究发展到现在，最大的成果之一，就是不断改变了临床医生对于新技术的认可和接受程度和速度。从产品投入市场到被广泛认可的过程中，需要较长时间的市场教育。但以mNGS为核心的感染病原体诊断正相反，产品上市后能够迅速的得到临床认可，应用场景也越来越丰富。
林东旭分析，这离不开以下几个原因。第一，感染病原体诊断精准切入临床痛点。为临床诊断上一些不明原因的发热，新发的或者罕见的感染疾病提供了一种可选择的手段。其次，感染病原体诊断能够提供完整的解决方案。mNGS是无差别的检测，单次检测可以覆盖细菌，真菌，病毒，寄生虫，支原体衣原体等，并且可以给出耐药基因信息作为抗生素治疗参考。同时，疫情的爆发提高了国家对传感染疾病诊治的重视程度，“可以说是最高级别了”。
临床对感染病原体诊断寄予厚望，不断提升检测准确性和时效性也是检测产业须更加奋身去解决。“这需要系统性的改进，而不能只关注到某一个环节。”林东旭表示，这也赛哲的实验室的挑战。在新版宏微RPD-seq®的提升上，赛哲从多个环节入手，包括湿实验和干实验。“行业内有句话，谁的数据库更大更完整，谁的报告可能就更准确”，林东旭指出，赛哲在高质量数据库积累和挖掘方面，已经积累了10万例数据库，并且将依托本地数据库配合AI人工智能算法开发对结果判读进行优化提升。
mNGS病原检测，更大的发展空间在中国
赛哲曾参与中国食品药品检定研究院第一批mNGS国家参考品的协同标定，与全球著名基因测序公司illumina有多年的合作共同开发测序设备。林东旭表示：“像illumina这样的公司，在选择合作伙伴的时候是非常挑剔的”。这一定程度上也客观反映了赛哲的技术研发能力、行业地位以及影响力。
林东旭是耶鲁大学医学院细胞生物学博士后、贝勒医学院分子与人类遗传学博士后。回国之后的六年，林东旭一直从事分子诊断行业工作，专注于mNGS和二代测序技术，开发了基于NGS技术的临床检测产品。
病原诊断mNGS技术最早临床应用是2014年发表在新英格兰杂志的脑脊液的案例。但美国的mNGS技术在临床上的应用发展却相对缓慢，至今仅局限于脑脊液这一个样本类型。而在国内，mNGS的临床样本研究已经增加了痰液，血液，肺泡灌洗液，组织，关节液，胸腹水，口腔拭子等样本，并逐渐成为研究的主流，应用场景和医院科室也逐渐增多，且在这一方面已实现弯道超车。
林东旭预测：“mNGS病原检测，更大的发展空间在中国。”他指出，在特殊时期下，我国对于疫情的快速有效控制，是病原体检验行业稳定发展的强心剂。国内检测检验行业所占市场份额也在逐年增加。中国报告网数据显示，2019年中国质量检测行业市场规模约为3047.62亿元，较前年上涨了14.69%。
在这些产业的实践下，WHO最新数据显示，与2000年相比，2019年全球下呼吸道感染造成的死亡人数减少了近50万。梧桐树资本投资总监王东东更是直呼：“新冠疫情影响下，已然引燃了临床病原微生物诊断百亿市场。”