重磅|m6A领域必读的40篇文章（多方合作推出，非综述类，何川就占了6篇，杨运桂4篇）

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iNature：RNA甲基化修饰最近几年成为了热点，尤其是N-6-methyladenosine （m6A）修饰，这从中科院等机构发布的2017年前沿，最近几年的自然科学基金项目及发表的文章可以看出。iNature编辑部也查看了m6A相关的文章，总共有859篇（非综述类，同时排除不相关的文章），同时也是从2013年开始出现井喷现象，迅速爆发，我们发现这些文章的总引用量是17660，施引文章是8776篇；紧接着我们统计了引用量最高的40篇文章，发现总引用量是7898次。非常的有趣，这40篇占到总引用率的44.73%，但是文章只是总文章的4.66%，说明这些文章非常的有影响力，故我们着重介绍这40篇文章。

1怎么找到长m6A相关的文章

由于使用百度很难搜索到可靠的英文文章，故在这里，小编推荐使用雅虎搜索引擎，在搜索栏里面输入web of science这几个关键词，得到以下界面（图.1）。

图1. 网页的打开

再次，进入web of science网站（这个网站是要收费的，一般综合性大学及中科院会购买），得到了以下的界面（图.2）。

图2.Web of Science界面

在界面输入m6A或者是N-6-methyladenosine关键词，选项栏选择“主题”（图.3）。

图.3 搜索m6A文章

点击检索，之后去除综述及排除不相关的文章，总共得到859篇文章，这些文章都是高度同m6A相关。

2859篇文章的分析

对于这859文章进行分析，我们发现总引用率是17660次，去除自引，有13618次，施引文章是8776篇，去除自引有8326篇（图.4）。

图.4  859篇文章引用情况

我们再看一下，不同时间对于m6A的引用情况，发现2012年前，m6A引用非常低，2012年引用量是505次，2013年引用量是689次，2014年是1154次，2015年1706次，2016年是3115次，2017年3846次（图.5  ）。

图.5  859篇文章不同时间段引用情况

之后我们看了引用率排名前40篇文章的引用情况，发现这40文章的总引用是7898次，去除自引是7759次（图.6）。

图.6 核心40篇文章引用情况

我们再看看这40篇文章各个时期的引用情况，我们发现2012年引用量是207，2013年引用量为,328次，2014年624次，2015年906次，2016年1555次，2017年1600次（图.7）。

图.7 40篇文章不同时间段引用情况

非常的有趣，这40篇占到总引用率的44.73%，但是文章只是总文章的4.66%，说明这些文章非常的有影响力，故我们着重介绍这40篇文章。

340篇文章的分析

我们通过分析，美国占了23篇；中国7篇；以色列4篇；英国及加拿大都是2篇；德国及澳大利亚都是1篇（图.8）。

图.8 40篇文章的国家分析

我们通过机构分析，发现芝加哥大学都是6篇文章；其次是中国科学院有4篇文章；康奈尔大学3篇（图.9）。

图.9 40篇文章的大学或研究所分析（第一单位）

我们在统计了这40篇文章发在什么杂志上，非常的有趣，在Nature居然达到了9篇；NATURE CHEMICAL BIOLOGY是7篇；CELL是4篇；NUCLEIC ACIDS RESEARCH是3篇（图.10）。总的来说，Nature及其子刊比较喜欢发表m6A的文章，另外Cell也不示弱。很奇怪，对于Science这一次，对于m6A不是很感冒。

图.10  40篇文章所发杂志分析

我们在统计了这40篇文章发表的时间，发现在2011年以前，只有5篇；2011年居然达到了1篇；2012年有3篇；2013年有6篇；2014年12篇；2015年有11篇，2016年有2篇。所以，我们认为，对于lncRNA领域，主要兴起于2013年以后，这个从2383篇文章中，也有类似的规律（图.11）。另外，对于2016及2017年的分析，由于时间较短，故有一些经典的文章没有达到相应的引用量，不过，我们相信，过一段时间，对于2016及2017年的有些文章，肯定会脱颖而出。

图.11  40篇文章发表时间统计

最后我们统计了通讯作者，发现何川 有6篇；杨运桂有4篇；Chang, Howard Y（张元豪），Jaffrey Samie ，MOSS B，Rechavi Gideon，Pan,Tao 都是2篇（图.12）。

图.12  40篇文章通讯作者统计

440篇文章列表

	标题	通讯作者	来源出版物名称
1	Topology of the human and mouse m(6)A RNA methylomes revealed by   m(6)A-seq	Rechavi, Gideon	NATURE
2	N6-Methyladenosine in nuclear RNA is a major substrate of the obesity-associated FTO	He, Chuan	NATURE CHEMICAL BIOLOGY
3	Comprehensive Analysis of mRNA Methylation Reveals Enrichment in 3 ' UTRs   and near Stop Codons	Mason, Christopher E	CELL
4	N-6-methyladenosine-dependent regulation of messenger RNA stability	He, Chuan	NATURE
5	ALKBH5 Is a Mammalian RNA Demethylase that Impacts RNA Metabolism and   Mouse Fertility	He, Chuan	MOLECULAR CELL
6	Genome-wide probing of RNA structure reveals active unfolding   of mRNA structures in vivo	Weissman, Jonathan S	NATURE
7	A METTL3-METTL14 complex mediates mammalian nuclear RNA N-6-adenosine   methylation	He, Chuan	NATURE CHEMICAL BIOLOGY
8	In vivo genome-wide profiling of RNA secondary structure   reveals novel regulatory features	Assmann, Sarah M	NATURE
9	Widespread occurrence of 5-methylcytosine in human coding and   non-coding RNA	Preiss, Thomas	NUCLEIC ACIDS RESEARCH
10	N-6-methyladenosine modification destabilizes developmental regulators in   embryonic stem cells	Zhao, Jing Crystal	NATURE CELL BIOLOGY
11	Mammalian WTAP is a regulatory subunit of the RNA N6-methyladenosine   methyltransferase	Yang, Yun-Gui	CELL RESEARCH
12	Pseudouridine profiling reveals regulated mRNA   pseudouridylation in yeast and human cells	Gilbert, WV	NATURE
13	N-6-methyladenosine-dependent RNA structural switches regulate   RNA-protein interactions	Parisien, M;Pan, Tao	NATURE
14	N-6-methyladenosine Modulates Messenger RNA Translation Efficiency	He, Chuan	CELL
15	m(6)A mRNA methylation facilitates resolution of naive pluripotency toward differentiation	Hanna, Jacob H	SCIENCE
16	Transcriptome-wide Mapping Reveals Widespread   Dynamic Regulated Pseudouridylation of ncRNA and mRNA	Fink, Gerald	CELL
17	Structural imprints in vivo decode RNA regulatory mechanisms	Chang, Howard Y;	NATURE
18	Dynamic m(6)A mRNA methylation directs translational control   of heat shock response	Qian, Shu-Bing	NATURE
19	5 ' UTR m(6)A Promotes Cap-Independent Translation	Jaffrey, Samie R	CELL
20	5'-TERMINAL AND INTERNAL METHYLATED NUCLEOTIDE-SEQUENCES IN HELA-CELL   MESSENGER-RNA	MOSS, B	BIOCHEMISTRY
21	Perturbation of m6A Writers Reveals Two Distinct Classes of mRNA   Methylation at Internal and 5 ' Sites	Lander, Eric S;Regev, Aviv	CELL REPORTS
22	Induction of sporulation in Saccharomyces cerevisiae leads to   the formation of N-6-methyladenosine in mRNA: a potential mechanism for the   activity of the IME4 gene	Bokar, JA	NUCLEIC ACIDS RESEARCH
23	RNA SHAPE analysis in living cells	Spitale, Robert C;Chang, Howard Y;	NATURE CHEMICAL BIOLOGY
24	A link between FTO, ghrelin, and impaired brain food-cue responsivity	Batterham, Rachel L	JOURNAL OF CLINICAL INVESTIGATION
25	FTO-dependent demethylation of N6-methyladenosine regulates mRNA splicing   and is required for adipogenesis	Yang, Yun-Gui	CELL RESEARCH
26	MTA is an Arabidopsis messenger RNA adenosine methylase and interacts   with a homolog of a sex-specific splicing factor	Fray, Rupert G	PLANT CELL
27	N-6-methyladenosine marks primary microRNAs for processing	Tavazoie, Sohail F	NATURE
28	iRNA-Methyl: Identifying N-6-methyladenosine sites using pseudo   nucleotide composition	Chen, Wei；Chou, Kuo-Chen;Lin, Hao	ANALYTICAL BIOCHEMISTRY
29	The fat mass and obesity associated gene (Fto) regulates activity of the   dopaminergic midbrain circuitry	Bruening, Jens C	NATURE NEUROSCIENCE
30	RNA motif discovery by SHAPE and mutational profiling  (SHAPE-MaP)	Weeks, Kevin M	NATURE METHODS
31	Single-nucleotide-resolution mapping of m6A and m6Am throughout the   transcriptome	Jaffrey, Samie R	NATURE METHODS
32	Probing N-6-methyladenosine RNA modification status at single   nucleotide resolution in mRNA and long noncoding RNA	Pan, Tao	RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY
33	Nuclear m(6)A Reader YTHDC1 Regulates mRNA Splicing	Yang, Yun-Gui	MOLECULAR CELL
34	IDENTIFICATION AND MAPPING OF N6-METHYLADENOSINE CONTAINING SEQUENCES IN   SIMIAN VIRUS-40 RNA	CANAANI, D	NUCLEIC ACIDS RESEARCH
35	m(6)A RNA Methylation Is Regulated by MicroRNAs and Promotes   Reprogramming to Pluripotency	Wang, Xiu-Jie;Yang, Yun-Gui;Zhou, Qi	CELL STEM CELL
36	NUCLEOTIDE-SEQUENCES AT N6-METHYLADENOSINE SITES OF HELA-CELL MESSENGER   RIBONUCLEIC-ACID	MOSS, B	BIOCHEMISTRY
37	Structural basis for selective binding of m(6)A RNA by the YTHDC1 YTH   domain	Min, Jinrong;He, Chuan;Xu, Chao	NATURE CHEMICAL BIOLOGY
38	Transcriptome-wide mapping of N-6-methyladenosine by m(6)A-seq based on   immunocapturing and massively parallel sequencing	Rechavi, Gideon	NATURE PROTOCOLS
39	pRNAm-PC: Predicting N-6-methyladenosine sites in RNA sequences via   physical-chemical properties	Xiao, Xuan	ANALYTICAL BIOCHEMISTRY
40	Chemical pulldown reveals dynamic pseudouridylation of the mammalian transcriptome	Yi, Chengqi	NATURE CHEMICAL BIOLOGY

另外，我们再补充一篇，Oxidative demethylation of 3-methylthymine and 3-methyluracil in single-stranded DNA and RNAby mouse and human FTO（2008年，何川），这篇是m6A的起始篇。

注：大部分数据参考Web of Science，另外也部分参考了由中科院等机构发布的2017年前沿。同时也非常的感谢中国科学院科技战略咨询研究院冷伏海及周秋菊俩位老师，能够提供mRNA甲基化修饰的参考文献，使我们编辑组得到了一些参考，对此表示非常的感谢。另外，对于这些文献，我们主要是参考web of science及2017年前沿，这些文章仅作参考。另外，也感谢交通大学张良老师提供的建议。

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