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江舜尧 2018-06-02

点击以上“微生太”可以关注我们。


我们3500位微信群友中每周都有人要做菌群测序分析。为了降低群友科研成本,提高服务质量,我们组织群友团购测序分析。现在已经随时可以团购菌群结构谱测序分析(16S/18S/ITS)等产品。

团购信息如下:

1. 产品:菌群结构谱测序分析(16S/18S/ITS)

2. 价格:16S,如果只包建库、测序,而不用分析,每份样品240-270元,根据样品数而定。16S,如果包DNA提取到高级分析所有步骤,500份及以上,320元每份;499-300份及以上,340元每份;299-200份,360元每份;199-100份,380元每份;99-50份,410元每份;49-30份,440元每份;29-10份,470元每份如果不包DNA提取,每份样品便宜25元。如果是18S/ITS,则在16S的基础上加25元每份样品。

3. 微生太群友特惠:微生太群友(在微生太建立的各微信群中均为微生太群友)可以通过群内拼团获得进一步优惠。例如,微生太群友A有100份样品要做16S,本来单价是380元;群友B,群友B有200份样品要做16S,本来单价是360元。群友A联系了群友B并决定两人一起拼团(当然是两位群友各付自己样品部分的,而且是分别打款),那么两人的单价都是300份样品对应的单价,即340元。

4. 实验周期:30-40天

5. 团购时间:随时

6. 合作流程:(1)确定合同;(2)取样;(3)提取DNA及质检;(4)支付首款;(5)测序分析;(6)验收结果并支付尾款;(7)售后服务。

7. 联系方式:江舜尧,微信a17316279151;电话:13391510601;邮箱:jiangshunyao@microeco.tech.

8. 分析内容

 

分析项目

分析

备注

基础分析项目

原始测序数据的质控



1

原始测序数据的处理


2

疑问序列的剔除


3

高质量序列长度分布统计


序列归并和OTU划分

1

OTU划分


2

OTU分类地位鉴定


3

OTU精简和分类鉴定结果统计


4

多样本共有OTU的Venn图分析

样本(组)≤ 5


常规分析项目

Alpha多样性分析

1

Rarefaction稀疏曲线


2

Specaccum物种累积曲线

样本≥ 10

3

丰度等级曲线


4

Alpha多样性指数计算


分类组成分析

1

各分类水平的微生物类群数统计


2

各分类水平的分类学组成分析


3

Metastats分析

样本(组)≥ 2

4

LEfSe分析

分组≥ 2

群落组成交互式可视化

1

系统发育树构建


2

MEGAN可视化展示


3

GraPhlAn可视化展示


4

Krona交互式展示


5

热图分析

样本≥ 3

Beta多样性分析

1

PCA分析

样本≥ 3

2

UniFrac-PCoA分析

样本≥ 3

3

UniFrac-MDS分析

样本≥ 5

4

UniFrac-UPGMA聚类分析

样本≥ 3

5

基于UniFrac距离的多组比较和箱线图展示

分组≥ 2

高级分析项目

菌群比较分析和关键物种筛选

1

RDA分析

样本≥ 3:提供影响因素数值或分组≥ 2

2

PLS-DA分析

分组≥ 2

3

Adonis/PERMANOVA分析

样本≥ 3:提供影响因素数值或分组≥ 2

4

ANOSIM分析

分组≥ 2

5

随机森林分析

分组≥ 2

优势物种互作关联网络分析

样本(组)≥ 3

群落代谢功能预测

仅限16S rRNA基因数据

9. 结题报告模板:点击本微文最左下角“阅读原文”即可下载。



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