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我们3500位微信群友中每周都有人要做菌群测序分析。为了降低群友科研成本,提高服务质量,我们组织群友团购测序分析。现在已经随时可以团购菌群结构谱测序分析(16S/18S/ITS)等产品。
团购信息如下:
1. 产品:菌群结构谱测序分析(16S/18S/ITS)
2. 价格:16S,如果只包建库、测序,而不用分析,每份样品240-270元,根据样品数而定。16S,如果包DNA提取到高级分析所有步骤,500份及以上,320元每份;499-300份及以上,340元每份;299-200份,360元每份;199-100份,380元每份;99-50份,410元每份;49-30份,440元每份;29-10份,470元每份。如果不包DNA提取,每份样品便宜25元。如果是18S/ITS,则在16S的基础上加25元每份样品。
3. 微生太群友特惠:微生太群友(在微生太建立的各微信群中均为微生太群友)可以通过群内拼团获得进一步优惠。例如,微生太群友A有100份样品要做16S,本来单价是380元;群友B,群友B有200份样品要做16S,本来单价是360元。群友A联系了群友B并决定两人一起拼团(当然是两位群友各付自己样品部分的,而且是分别打款),那么两人的单价都是300份样品对应的单价,即340元。
4. 实验周期:30-40天
5. 团购时间:随时
6. 合作流程:(1)确定合同;(2)取样;(3)提取DNA及质检;(4)支付首款;(5)测序分析;(6)验收结果并支付尾款;(7)售后服务。
7. 联系方式:江舜尧,微信a17316279151;电话:13391510601;邮箱:jiangshunyao@microeco.tech.
8. 分析内容:
分析项目 | 分析 | 备注 | |
基础分析项目 | |||
原始测序数据的质控 | |||
1 | 原始测序数据的处理 | √ | |
2 | 疑问序列的剔除 | √ | |
3 | 高质量序列长度分布统计 | √ | |
序列归并和OTU划分 | |||
1 | OTU划分 | √ | |
2 | OTU分类地位鉴定 | √ | |
3 | OTU精简和分类鉴定结果统计 | √ | |
4 | 多样本共有OTU的Venn图分析 | √ | 样本(组)≤ 5 |
常规分析项目 | |||
Alpha多样性分析 | |||
1 | Rarefaction稀疏曲线 | √ | |
2 | Specaccum物种累积曲线 | √ | 样本≥ 10 |
3 | 丰度等级曲线 | √ | |
4 | Alpha多样性指数计算 | √ | |
分类组成分析 | |||
1 | 各分类水平的微生物类群数统计 | √ | |
2 | 各分类水平的分类学组成分析 | √ | |
3 | Metastats分析 | √ | 样本(组)≥ 2 |
4 | LEfSe分析 | √ | 分组≥ 2 |
群落组成交互式可视化 | |||
1 | 系统发育树构建 | √ | |
2 | MEGAN可视化展示 | √ | |
3 | GraPhlAn可视化展示 | √ | |
4 | Krona交互式展示 | √ | |
5 | 热图分析 | √ | 样本≥ 3 |
Beta多样性分析 | |||
1 | PCA分析 | √ | 样本≥ 3 |
2 | UniFrac-PCoA分析 | √ | 样本≥ 3 |
3 | UniFrac-MDS分析 | √ | 样本≥ 5 |
4 | UniFrac-UPGMA聚类分析 | √ | 样本≥ 3 |
5 | 基于UniFrac距离的多组比较和箱线图展示 | √ | 分组≥ 2 |
高级分析项目 | |||
菌群比较分析和关键物种筛选 | |||
1 | RDA分析 | √ | 样本≥ 3:提供影响因素数值或分组≥ 2 |
2 | PLS-DA分析 | √ | 分组≥ 2 |
3 | Adonis/PERMANOVA分析 | √ | 样本≥ 3:提供影响因素数值或分组≥ 2 |
4 | ANOSIM分析 | √ | 分组≥ 2 |
5 | 随机森林分析 | √ | 分组≥ 2 |
优势物种互作关联网络分析 | √ | 样本(组)≥ 3 | |
群落代谢功能预测 | √ | 仅限16S rRNA基因数据 |
9. 结题报告模板:点击本微文最左下角“阅读原文”即可下载。
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