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一种基于菌群采样器的粪便菌群采样方法

2018-02-08 微生太

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图1 Longsee菌群采样保护套装外观

 

该采样神器品名Longsee菌群采样保护套装,由微生太和南芯医疗联合推出,由采样器、采集管和4ml保护液等组成。其中的保护液能瞬间固化样本中的菌群,使样本的菌群种类和丰度不再变化,同时有效保护菌群DNA完整性,为菌群测序分析以及代谢组质谱鉴定等后续实验提供高质量的样本。

该套装尤其适合采集和保护粪菌样本。具有以下优点:(1)采集的样本在常温下放置7天,样本中菌群种类和丰度与新鲜样本的一致;(2)采集后样本可在常温下运输;(3)DNA的收获率高、完整性好、测序稳定性好;(4)不会影响质谱检测。


基于Longsee菌群采样器的粪便菌群采样方法

 

图2 Longsee菌群采样保护套装操作流程图

 

1)选择一个干净的蹲厕或马桶,冲洗干净,然后在便池内垫两层干净的纸巾,防止大便样本直接掉进便池水中;

2)将粪便排在铺好的纸巾上;

3)打开包装,带上一次性手套,取出采样保护套装,准备采样;

4)旋开采集管,持盛液管一端,用采样杆取约1-2粒黄豆粒大小的粪便;

5)将取好粪便的采样杆插回管内,旋紧密封旋盖;

6)手握采集管,在靠近易折杆侧用拇指推压盛液管中部,使盛液管中的杆子沿根部折断,露出小孔,轻挤盛液管使保护液通过小孔流入装有粪便的管内;

7)将盛液管中的液体全部挤入下端管中,轻轻晃动采集管,让采样头凹槽中的大便样本与采样头分离并与保护液充分混匀,使管内液体呈悬浊状;

8)将粪便采集管装回原包装袋,通过快递等方式送给研究人员;

(9)研究人员可将采集管内的粪液从出液嘴滴出到标好样品名称的灭菌冻存管,每管约1ml(每个采样器中的混合液共可分三管),长时间保存于-80℃冰箱以备检测。样品名称命名规则:样品名称只能用英文字母或阿拉伯数字或两者的组合,而且字符数大于3小于9。


该菌群采样器采购价:35元每个采样器。


备注:

样本筛选标准:

1.如果受试者存在以下情况,则需剔除:

(1)5年内有过胃肠道大手术的(胆囊切除术和阑尾切除术);

(2)有过主要肠道切除手术;

(3)炎症性肠病(IBD),包括溃疡性结肠炎、克罗恩病(Crohn’s disease)或不确定的结肠炎;

(4)肠易激综合症(IBS);

(5)持久性、传染性胃肠炎、结肠炎或胃炎;持续或慢性腹泻的病因不明,艰难梭状芽胞杆菌感染(复发)或幽门螺杆菌感染(未治疗);

(6)慢性便秘;

(7)历史性的胃或肠道溃疡、胃肠道出血、腹痛、消化不良、胃肠里急后重(下坠)或排便困难,胃肠道或结肠息肉或包块或发育不良或癌症,以及腹泻或传染性胃肠炎;

(8)药物治疗记录:含碱式水杨酸铋, Pepto-Bismol, Kaopectate, Maalox Total Relief, Bismatrol, Pink Bismuth, Stomach Relief, Stress, Walgreens Soothe 和其它类似的铋碱式水杨酸盐的药物成分的药物。

2.对于存在历史性胃肠道疾病患者执行简单临床检查:腹部压痛、疼痛及肛门疾病。






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