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8分SCI零代码复现步骤免费领取!

点击关注 医学学霸帮 2022-11-30

据2020年统计,2020年发表生信SCI共4165篇,其中纯生信(或仅含少量表达检测)文章3194篇,剩下的971篇生信实验类文章,其包含实验占比>30%。利用生物医学数据挖掘,高效发表高分SCI!


系统化的学习的话,发SCI就比较容易了,任何一套视频都能发一篇 3、5分的SCI论文。今天我们就给大家免费分享:


“6套生信分析数据挖掘视频教程”


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这6套资源如下:


一、3-8分经典范文零代码复现套路

3分复现:简单又实用!铁死亡+免疫浸润3分+套路,零代码复现!

3分复现:最新3+ceRNA生信研究套路复现

3分复现:2020年最新发表3分+非肿瘤零代码数据挖掘复现

3分复现:近4分的非肿瘤套路,用一刻钟零代码就可以复现!
4分复现:纯生信无代码的4分+文章,通过在线数据库完成所有分析
4分复现:从“预后价值和免疫浸润”角度做4分+单基因分析生信文章复现
5分复现:零代码复现近5分单基因生信文章
6分复现:最新6分+泛癌文章,套路设计太赞!
8分复现:8+纯生信文章,15分钟零代码教你复现!

下面以4分+单基因分析生信文章复现为例:

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题目:

Prognostic and Immunological Role of FUN14 Domain Containing 1 in  Pan-Cancer: Friend or Foe?


这篇生信论文是单基因分析的生信论文。单纯生信数据库的数据分析,没有湿实验验证,发表在接近4分+的期刊上。


摘要写作清晰明了。背景中一句话介绍基因功能,提出科学问题和研究目的。方法中,所有的数据库都是大家熟悉的技能。结果是总结式写作,没有具体的数值;结论还是蛮清楚的。


差异表达部分,作者采用oncomine+TIMER双验证,三线表放在补充数据里。前面说过,对于单基因的差异分析,尤其是与肿瘤浸润免疫细胞表型相关的分析,芒果建议采用这种方法,确实做到统筹兼顾,有局部聚焦(oncomine)和全局通览(TIMER)的神奇效果。


这里作者应该是用PrognoScan数据库(km plotter数据库应该是写错了)做生存分析。但是作者在作图过程中,信息更全面,肿瘤+GSE序号+OS或DFS+HR+Cox p详细列出,这种细节往往更体现严谨的科学态度。作者采用PrognoScan数据库和km plotter数据库(prognoscan+km plotter)双验证的模式,增加数据的可信度和说服力。


prognoscan网址:

http://dna00.bio.kyutech.ac.jp/PrognoScan/index.html.



km plotter数据库做生存分析的验证,双确认模式找出具有临床意义的差异表达,比单一数据库的分析更有说服力。


临床特征的差异统计,可以点线图,也可以三线表,个人认为放在补充数据里更合适。

在差异分析和临床意义的基础上,作者探究机制——肿瘤浸润免疫细胞。


然后,用GEPIA做免疫分子与兴趣基因的相关性分析。


深入分析B细胞浸润和单核细胞极化表型之间特征。

GEPIA分析B细胞和单核细胞免疫分子与兴趣基因的相关性。


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二、实操教学:生信挖掘发表SCI全套视频

1、实操-手把手教你从GEO下载数据进行分析
2、实操-手把手教你从GEO下载数据后进行数据转换
3、实操-手把手教你从GEO下载后进行差异分析得到差异基因
4、实操-手把手教你从GEO下载绘制基因热图(使用的都是万能代码)


三、必看讲座:手把手教你数据挖掘

生物信息学讲座-第1讲-vmware安装
生物信息学讲座-第2讲linux安装( vmware版 生物信息学讲座-第3讲-centos6.2下编译安装R全记录生物信息学讲座-第4讲-cufflinks安装(包括samtools ) 生物信息学讲座-第5讲-tophat2安装(包括bowtie2 )生物信息学讲座-第6讲-bioconductor安装(包括ShortRead , DESeq生物信息学讲座-第7讲-SRA车转专FASTQ格式生物信息学讲座-第8讲-ShortRead使用(重新编译R-2.15.2版) 生物信息学讲座-第10讲-numpy,scipy,matplotlib yum安装生物信息学讲座-第11讲-numpy,scipy等编译安装( python2.7 ) 生物信息学讲座-第12讲-bowtie2建索引,用fastq文件比对生物信息学讲座-第13讲-tophat2比对生物信息学讲座-第14讲-IGV可视化BAM文件生物信息学讲座-第15讲-Cytoscape插件3DScapeCS ( 2D图转成3D图)



四、含整套代码:20节生信数据挖掘视频课程

1、课程介绍.mp4
2、IncRNA数据下载.mp4
3、IncRNA的ID转换.mp4
4、为lncRNA添加基因属性.mp4
5、IncRNA差异表达分析.mp46、差异表达的IncRNA的热图的绘制.mp47、GPL车专fasta.mp48、重注释比对结果.mp49、比对结果ID转换.mp410、基因属性.mp411、mRNA表达和火山图的绘制.mp4
12.mRNA数据绘制热图.mp413、IncRNA结合的miRNA.mp414、miRNA靶基因的预测mp4.mp415、Cytoscape输入文件准备.mp416、CeRNA网络构建.mp417.mRNA名称转换为基因ID.mp418、ceRNA的GO分析.mp419、ceRNA白的KEGG分析.mp4



五、高分套路:从0做到8的200+纯生信文献套路

1、最全单基因研究套路(29篇)

2、“一看就懂”的单细胞测序文章(13篇)

3、最值得收藏的多组学综合分析相关文献解读(18篇)

4、超详细泛癌研究文献解读(19篇)

5、“年度突破”外显子测序研究(16篇)

6、“纯生信热点”预后模型、biomarker筛选(29篇)7、免疫治疗、免疫浸润分析高分套路(14篇)8、“网红热点”非编码RNA(22篇)9、非肿瘤领域研究套路(37篇)10、结合生信数据库挖掘相关文献套路(10篇)11、生信方法开发研究套路(15篇)👇向下滑动查看纯生信文献套路

1、单基因研究:


2、单细胞测序


3、多组学综合分析


4、泛癌研究


5、外显子测序研究


6、预后模型,biomarker筛选


7、免疫治疗,免疫浸润分析


8、非编码RNA

......



六、数据库分析:生信数据库联合分析—共46课

1、序列比对
2、GEO在线分析3、差异表达分析4、转录组数据分析5、主成分分析6、功能富集分析7、基因组分析8、蛋白互作



七、效率神器:生信小白做数据挖掘效率神器

1、利用R语言做数据分析视频(共12节)

2、基于实例的R语言数据分析与展现(15课)3、R语言数据处理Rstudio操作演练 (6课)4、R语言七种武器之shiny动态图5、SPSS数据挖掘方法概述(13课)6、SPSS统计分析与数据挖掘+实例分析视频教程7、SPSS统计分析实战教程+案例分析



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