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PAST:最简便易用的统计学分析软件教程(一)----软件基本信息介绍

红皇后学术 红皇后学术 2022-06-07

欢迎来到PAST的世界!

PAST的全称为PAleontological STatistics,是1995年由P.D. Ryan、D.A.T. Harper和J.S. Whalley开发的软件PALSTAT的升级版,软件最初开发的目的是为了进行古生物学数据的分析,但是随着软件的不断更新,目前已经成为了一个综合性的统计学分析软件,不仅仅适合于古生物学的研究,也同样适用于生命科学、地球科、工程学和经济学等领域的数据分析和处理。

该软件在科研领域免费使用,在发表文章时,如果使用了PAST,需要引用下面的文献:

Hammer, Ø., Harper, D.A.T., and P. D. Ryan, 2001. PAST: Paleontological Statistics Software Package for Education and Data Analysis. Palaeontologia Electronica 4(1): 9pp.

本系列教程基于windows版本的PAST 3.0软件进行。

软件下载地址:扫描下方二维码,,提取码:i274。

下载后的软件无需安装,双击“Past3.exe”即可打开软件进行使用。

打开PAST软件,其界面类似一个Excel表格,只需将数据输入或粘贴进入该表格,选中后点击相应分析标签,即可快速方便的得到各种统计学分析的结果。

PAST几乎可以进行所有的统计学分析,包括差异性检验、相关性分析、能效分析、生存分析、富集分析、排序分析、聚类分析、回归模型预测、生物群落多样性分析、时间序列统计学分析等等,同时PAST还能够绘制基本图形,如散点图、折线图、条形图、饼图、气泡图、三元相图等。


本教程并不是将PAST的所有功能均进行详细介绍,而只是挑选与生物、医学、微生物研究相关的统计学分析内容进行讲述。

根据PAST内各项分析的标签分类,将该教程具体设置如下

  • PAST软件介绍

    • PAST的基本信息

    • 数据的输入和修改

    • 数据的转换和标准化

  • 图像绘制 (Plot标签)

    • 点线图和直方图

    • 散点图

    • 条形图和箱须图

    • 饼图

    • 堆叠条形图

    • 三元相图

    • 气泡图

  • 单变量统计学分析 (Univariate标签)

    • 基本统计学参数计算

    • 正态分布检验

    • 差异性检验

      • 单样本与理论值之间的差异检验

      • 检验两组数据的差异性

      • 检验两个指定数据集的差异性

      • 两组配对数据的差异性检验

      • 单因素方差分析

      • 多因素方差分析

    • 相关性分析

      • 不同样本间的相关性检验

      • 组内相关分析 (ICC)

    • 医学相关统计方法

      • 富集分析

      • 风险评估

      • 能效分析

      • 生存分析

  • 多元数据统计学分析 (Multivariate标签)

    • 排序分析

      • PCA和PCoA

      • NMDS

      • CA、DCA和CCA

      • 序列化分析

      • LDA和PLS

    • 聚类分析

    • 差异性检验 (Tests标签

      • 多元数据正态分布检验

      • 多元数据单因素方差分析

      • 多元数据单因素协方差分析

      • ANOSIM和Adonis test

      • Mantel test

  • 模型预测 (Model标签)

    • 一元线性回归

    • 多元线性回归

    • 多项式回归

    • 非线性回归

    • 平滑曲线回归

  • 生物群落相关分析

    • Alpha多样性

      • Alpha多样性指数计算

      • 稀疏曲线

      • Alpha多样性指数差异性检验

      • 物种累积曲线

    • 分类学差异

    • 群落相关性或距离指数计算

    • 物种对群落差异的贡献程度

    • 群落相关模型建立

基本上能保持日更,整个教程更新完大概需要一个半月左右,学完以后保证你能得心应手的做出各种统计学分析,希望大家持续关注!


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