PAST：最简便易用的统计学分析软件教程（二十八）----CCA

红皇后学术红皇后学术 2022-06-07

本系列教程基于windows版本的PAST 3.0软件进行。

软件下载地址：扫描下方二维码，提取码：i274。

下载后的软件无需安装，双击“Past3.exe”即可打开软件进行使用。

CCA

Canonical correspondence Analysis (CCA) 用于对样品/物种矩阵根据提供的环境变量进行对应分析，坐标轴为环境变量的线性组合，因此反应了环境梯度对于物种丰度的响应。

选择数据后，点击Multivariate按钮下Ordination标签中的Canonical correspondence (CCA) 选项进行分析。

输入数据要求行为样品，前n列为环境变量，后m列为物种丰度，点击分析之后，会弹出环境因子选择窗口，输入环境因子的数目。

在结果的Scatter plot一栏中，点击Triplot选项，可以以直线形式显示环境变量。

CCA分析有两种图形标尺，Scaling1强调样品相关性，而Scaling2强调物种相关性。

Permutation一栏可以计算坐标轴的Eigenvalues是否有意义，Trace值越大越好，p值表示是否有显著性。