PAST：最简便易用的统计学分析软件教程（三十三）----ANOSIM
本系列教程基于windows版本的PAST 3.0软件进行。
软件下载地址：扫描下方二维码，提取码：i274。
下载后的软件无需安装，双击“Past3.exe”即可打开软件进行使用。
ANOSIM
Anosim分析是一种非参数检验，用来检验组间的差异是否显著大于组内差异，从而判断分组是否有意义。
R-value介于（-1，1）之间，R-value大于0，说明组间差异显著。
R-value小于0，说明组内差异大于组间差异。
统计分析的可信度用 P-value 表示，P< 0.05 表示统计具有显著性。
One-way ANOSIM
One-way ANOSIM用于比较不同组样品之间是否存在显著差异，此算法基于距离计算样品的相似性，输入数据横轴为样品，纵轴为变量，并且需要一个分组列。
选择待分析数据后，点击Multivariate按钮下Tests标签中的One-way ANOSIM选项进行分析。
当R值大于1并且p值小于0.05时，代表不同组样品之间存在显著的差异。
ANOSIM类似于MANOVA，同样可以选择不同的距离矩阵进行计算，在Similarity index中选择合适的距离矩阵。
Pairwise一栏中可以看到不同组之间两两比较的结果，其意义与MANOVA中一致。
Box plot一栏中以箱图形式展示了组内和组间不同样品的距离的差异，参数与plot选项中箱图一致。
Two-way ANOSIM
PAST除了提供One-way ANOSIM以外，类似于ANOVA，还可以根据两种不同的分组方式检验样品间的差异性，此时所用的方法为Two-way ANOSIM，该选项同样在Multivariate按钮下的Tests标签中。
Two-way ANOSIM选项计算方法与One-way ANOSIM一致，只是可以同时输入两个分组列，即可以同时对两个分组方式进行比较，但是此方法需要有重复，也就是每一个分组中要包含多个样品。
Two-way ANOSIM without replication选项与Two-way ANOSIM一致，只是每一个分组中只能包含一个样品。