PAST：最简便易用的统计学分析软件教程（三十四）----Adonis

原创红皇后学术红皇后学术 2022-06-07

收录于合集 #PAST：最简便易用的统计学软件 28个

本系列教程基于windows版本的PAST 3.0软件进行。

软件下载地址：扫描下方二维码，提取码：i274。

下载后的软件无需安装，双击“Past3.exe”即可打开软件进行使用。

Adonis

Adonis又称置换多因素方差分析 (permutational MANOVA，PERMANOVA) 或非参数多因素方差分析 (nonparametric MANOVA)。

它利用半度量 (如Bray-Curtis) 或度量距离矩阵 (如Euclidean) 对总方差进行分解，分析不同分组因素对样品差异的解释度，并使用置换检验对划分的统计学意义进行显著性分析。

以R2和P值表示结果，R2越大表示分组对差异的解释度越高，P＜0.05表示统计具有显著性。

Adonis分析的输入数据行为样品，列为变量，并且需要一个分组列，选择待分析数据后，点击Multivariate按钮下Tests标签中的One-way PERMANOVA选项进行分析。

当p值小于0.05时，代表多组样品间存在显著差异。

其余参数于ANOSIM一致。

Adonis可以比较两种不同的分组方式对于样品差异的贡献比例及大小，此时需要两个分组方式列，并且采用Two-way PERMANOVA进行分析。

Two-way PERMANOVA选项计算方法与One-way PERMANOVA一致，通过比较不同分组方式的R2值判断两种分组方式对于样品差异的贡献及大小。