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PAST:最简便易用的统计学分析软件教程(四十一)----稀疏曲线

红皇后学术 红皇后学术 2022-06-07

本系列教程基于windows版本的PAST 3.0软件进行。

软件下载地址:扫描下方二维码,提取码:i274。

下载后的软件无需安装,双击“Past3.exe”即可打开软件进行使用。


稀疏曲线

稀释曲线是从样本中随机抽取一定数量的个体,统计这些个体所代表的物种数目,并以个体数与物种数来构建曲线。

它可以用来比较测序数据量不同的样本中物种的丰富度,也可以用来说明样本的测序数据量是否合理

曲线趋向平坦时,说明测序数据量合理,更多的数据量只会产生少量新的 OTU,反之则表明继续测序还可能产生较多新的 OTU。

Diversity按钮中的Individual rarefaction选项用于绘制群落样品的稀疏曲线。

输入样品为行为物种,列为样品,数据为物种的丰度


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