科研思路｜JP：蛋白质组揭示alpha-5-collagen和ATP5B在仿刺参腐皮综合症中的作用

论文信息

论文题目：Proteomics analysis reveals the important roles of alpha-5-collagen and ATP5β during skin ulceration syndrome progression of sea cucumber Apostichopus japonicus

期刊：Journal of Proteomics

IF：3.537

发表时间：2018

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本研究针对我国重要的水产养殖物种“仿刺参”，针对其主要疾病腐皮综合症，利用蛋白质组学技术测定疾病不同阶段差异表达的蛋白质，利用Venn和PPI分析，识别在不同疾病阶段均发挥重要作用的关键蛋白质，从而解析仿刺参腐皮综合症发病机制。

研究背景

仿刺参是我国重要的水产养殖物种之一，腐皮综合征是仿刺参养殖过程中的一种常见疾病，严重影响仿刺参养殖产业的发展。

为了更好的理解仿刺参腐皮综合征的分子机制，应用基于iTRAQ的蛋白质组学技术分析了仿刺参腐皮综合征不同阶段体壁组织中蛋白质的变化。

技术路线

研究结果

1、在化皮的仿刺参体壁组织中共鉴定到1449个蛋白质，其中145个蛋白质与健康仿刺参的体壁组织相比具有明显的表达差异。

2、这些差异表达的蛋白质涉及多种不同的功能，包括免疫、转录后修饰、mRNA稳定性、物质和能量代谢以及发育等。

3、通过比较化皮不同阶段仿刺参体壁组织的蛋白质结构，发现不同化皮阶段体壁组织中的蛋白质图谱具有明显的差别。

4、在所有的差异表达蛋白中，只有2个蛋白 (alpha-5-collagen和一个未知功能的蛋白) 在仿刺参化皮的全过程中的表达均与健康仿刺参具有明显差异。

5、在仿刺参化皮的全过程中，体壁组织中alpha-5-collagen的表达与健康仿刺参相比均显著下调，该蛋白可能是致病菌攻击仿刺参的靶标蛋白，可以作为治愈仿刺参化皮的宿主靶标物质。

6、蛋白质相互作用分析表明，ATP5β蛋白在仿刺参化皮的过程中与多种核糖体蛋白、免疫相关蛋白和分子伴侣相互作用，是仿刺参化皮响应机制中的关键蛋白，该结论表明在能量的产生和消耗在仿刺参化皮形成和抵抗致病菌中发挥重要作用。

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