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每天学习一点R:3.R软件和扩展包的升级

红皇后学术 红皇后学术 2022-06-07

在上一期的内容中,我们详细的介绍了R语言扩展包的安装。

R语言每个一段时间就会跟新一个新的版本,其中会增加一些新的语法、修改一些语法的用法并修复一些bug,因此,相应的扩展包也会进行一些更新以适应新的R版本。

这就使得用户在使用的过程中有时会面临软件与扩展包版本不匹配的情况,此时就需要对R语言和扩展包进行更新。

R软件的更新

在RStudio中使用如下简单的命令即可自动将R语言更新为最新的版本。

install.packages("installr")
require(installr)
updateR()

注:更新完成后需要将旧版本R的library文件夹复制到新版本中,不然还要重新下载所有的扩展包。

扩展包的更新

在RStudio右下界面中,选择Packages选项进入扩展包管理页面。

点击update按钮即会打开扩展包更新界面,点击Select All选中需要更新的扩展包,点击Install Updates即开始扩展包的更新。

对于通过Bioconductor安装的扩展包,我们需要使用下方命令对其进行单独更新。

BiocManager::install()


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