【悦读365·第72天】使用MAXENT的只存在建模：我们什么时候可以相信推论？

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文章类型：综述（WOS高被引论文）

基于Maxent是现今分析只存在数据的最流行方法之一，本文对2008～2012年发表的108篇Maxent模型设计文章进行了回顾。分析的重点是，这些模型是否满足仅存在数据分析的关键假设：随机抽样，样本在研究区内具有代表性。此外，还对模型输出结果的解释以及是否提供了允许读者进行模型批判性评估的信息进行了相关分析。

表1 基于108篇maxent模型设计文章的相关问答总结

主要结论：

1. 仅存在建模的随机抽样建模很少得到满足。在108篇论文中，76篇是基于不可能来自随机抽样的数据，21篇没有提供足够的信息来判断，11篇似乎来自适当的抽样方法；

2. MAXENT的逻辑输出经常(54%的文章)被错误地解释为发生概率；

3. 很少（16.7%）有文章给明了建模的任何细节。

建议：

1. 仅存在数据集的常见来源是标本馆、博物馆数据库，但此类型数据很少来自系统随机抽样（这与馆藏标本的采集方法与目的的不透明及采集点多为被采物种预期出现的地方或易获取的地方有关），因此需要对这些数据进行一定的筛选或建模解释，以纠正数据集中的取样偏差。

2. MAXENT的输出结果为存在的可能性。而只有在少数情况下才能从仅存在数据中无偏地估计发生概率，今后的研究应当给出maxent的原始输出，而不要将逻辑输出称为发生概率。

3. 为便于对结果进行批判性评估，提高研究的透明度和有用性，应向读者提供必要的具体建模信息。

编       辑 | 昌维

文章来源 | Yackulic, C.B., Chandler, R., Zipkin, E.F., Royle, J.A., Nichols, J.D., Campbell Grant, E.H. and Veran, S. (2013), Presence‐only modelling using MAXENT: when can we trust the inferences?. Methods in Ecology and Evolution, 4: 236-243. https://doi.org/10.1111/2041-210x.12004

文内图表来源于原作者

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