纸刊大放送！Cell Genomics创刊号编辑精选
生命科学
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感谢您对Cell Genomics的关注，Cell Genomics首期将于下月正式发布，诚邀您与我们一起，抢先关注首刊的编辑精选研究。
为贺Cell Genomics首发，我们举办了“Cell Genomics home delivery”活动，只要您告知地址等信息，我们就会将Cell Genomics第1、2期纸质版杂志、活动限定特别内容（additional journal content）以及小礼物寄到您的身边，整个过程完全免费。
过去的十年里，遗传学、基因组学和基因组技术迅速发展，基础、分子、生物医学、临床和社会科学等领域都能见其身影。Cell Genomics致力于和不同领域研究者一道，推进基因组学发展，造福科学与社会。这是一次激动人心的旅程，我们在遗传学、基因组学及基因技术的最前沿，通过开放获取、开放科学和合作，为开创性研究保驾护航。
Cell Genomics主编
Orli Bahcall
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“Cell Genomics home delivery”活动
编辑精选研究
面向模式生物和病毒性RNA病原体的转录组Cas13向导RNA设计
近年来对靶向RNA的CRISPR核酸酶特性的相关研究实现了多样化转录组工程和筛选，而CRISPR筛选中向导RNA（gRNA）的预测与优化是其成功与否的关键。纽约大学Neville E. Sanjana曾开发了一个计算模型，用于预测人类蛋白质编码基因的RfxCas13d gRNA活性。在本研究中Sanjana团队又将这一模型应用范围扩展到六种模型生物（人类、小鼠、斑马鱼、苍蝇、线虫和开花植物）和四种RNA病毒家族（SARS-CoV-2、HIV-1、H1N1和MERS）的蛋白质编码基因以及非编码RNA（ncRNA）。并在人类细胞与小鼠细胞中对多个ncRNA（MALAT1、HOTAIRM1、Gas5和Pvt1）的预测结果进行实验验证。研究人员同时开发了免费网络平台“cas13design”，该平台提供了用于在几种生物体中转录组靶向筛选的gRNA预评分数据，以及一个用于预测特定RNA靶向最佳gRNA的交互式设计工具。这一资源将促进CRISPR-Cas13系统在模式生物以及人类新发病毒中的RNA靶向筛选。
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遗传多样性小鼠种群中蛋白质丰度的调节
遗传多样性小鼠种群是探究蛋白质组调节特征及其与整个机体表型关系的有力工具。美国杰克森实验室（JAX）Gary A. Churchill团队使用质谱分析法对58个合作杂交（CC）近交品系的雌雄小鼠肝脏组织中6798种蛋白质的丰度进行了分析和量化。以前从相关的多样性外源性（DO）小鼠及其原始品系中收集了肝脏蛋白质组学数据。尽管这些蛋白质组学数据集来源于不同的实验，但其一致性良好，允许进行比较分析。研究者通过蛋白质丰度QTL定位（pQTL），在CC小鼠中确定了1087个局部标记和285个远端标记，在DO小鼠中确定了1706个局部标记和414个远端标记。研究表明，在所有小鼠种群中，单一蛋白质的调控作用较为保守，对其局部遗传变异和性别差异而言尤为如此。而蛋白质复合物往往会共同调控，表现出不同的遗传结构，总体遗传性较低，pQTL标记也较少。研究者公开了这一资源，以便未来能够对蛋白质组调控进行进一步定量分析。
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极度濒危物种鸮鹦鹉的种群基因组学
鸮鹦鹉（kākāpō）是新西兰特有的一种不会飞的鹦鹉。它曾是群岛上的常见物种，但目前仅存201只，大部分为同一孤岛种群的后代。瑞典斯德哥尔摩古遗传学中心Nicolas Dussex团队报告了该物种的第一个全基因组分析，包括一个高质量鸮鹦鹉基因组组装，这也是脊椎动物基因组计划（Vertebrate Genomes Project）测序的第一批染色体水平参考基因组。研究者还对唯一幸存的岛屿种群的35个现代基因组和已灭绝的大陆种群的14个基因组进行了测序和分析。结果表明，虽然理论上如此小的种群很可能通过遗传漂变积累了有害突变，但现今岛屿种群较已灭绝的大陆种群而言，有害突变数量减少。研究人员曾合理推测，岛屿种群自1万年前与大陆隔离以来，在遗传漂变和有害突变清除的双重影响下，其近亲繁殖和自然净化选择共同造成了这一现象。本研究结果证明了这一假设，即小种群隔离了几百代后也能生存。这项工作对鸮鹦鹉的繁殖和种群恢复具有重要价值，也为濒危物种保护中遗传工具的应用提供了借鉴。
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