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苏州“最强大脑”赋能生物计算

柯轩 SISPARK发布 2023-09-27
作者:柯轩


在5月10日举行的首届中国生物计算大会上,苏州工业园区科技发展有限公司(以下简称“科技公司”)的全资子公司——苏州超级计算中心有限公司(以下简称“苏州超算中心”)总经理钱丰参加了国内知名生命科学平台公司——百图生科的生态联盟签约仪式,苏州超算中心正式成为百图生科的生态伙伴,为生物计算提供强大的算力以及技术服务支持。同时,该中心在即将落成的IT+BT融合创新中心将扮演重要的公共服务平台角色。

这也是苏州国际科技园自2020年全面启动“SISPARK生态计划”以来,在信息技术和生物技术融合创新领域的最新成果。苏州超算中心与百图生科的战略合作,将在苏州工业园区IT+BT产业创新领域写下新的一页。


▲苏州超算中心总经理钱丰(中)签约加入百图生科生态联盟


生命科学研究,包括药物研发、生物计算需要强大的算力、优化算法和数据支持。其中,算力已经成为生物创新中的刚性需求。
百图生科是百度创始人李彦宏和百度风投负责人刘维共同创立的一家医学服务企业,定位于生物计算技术驱动的生命科学平台公司,该公司致力于高性能生物计算和多组学数据技术加速创新药物和早筛早诊等精准生命科学产品的研发,李彦宏亲自出任公司董事长。
在当天上午举行的生态联盟签约仪式上,百图生科CEO刘维表示:各类技术合作伙伴,既有从事各种前沿组学的技术以及AI药物设计和抗体药物产业链的,也有从事合乎高通量的实验和底层算力支持和实验的,这些技术伙伴会与百图生科共建强大的挖掘引擎。


▲苏州超算中心机房

▲苏州超算中心与客户开展生物计算合作方面的交流

据介绍,自2020年3月投入运营以来,苏州超算中心立足强大的服务资源,为苏州的生物医药产业创新提供算力和技术支撑服务。
目前,该中心已经与苏州北京协和医学院苏州系统医学研究所展开全方位合作,为研究所高通量测序平台提供高性能计算服务,帮助苏州系统医学研究所完成了大量的基因样本库和信息分析工作,在双方的共同努力下,通过优化了高通量测序的流程,完善了高通量测序的步骤,算法和参数调优等工作,积极提高了高通量测序数据的分析和应用效率。借助苏州超算的大规模算力资源,目前双方正在加强沟通,聚焦生物信息学领域,面向遗传病、肿瘤、感染性疾病的样本库和大数据分析等方面开展更加紧密的合作。
苏州超算中心是苏州工业园区和苏州国际科技园为生物医药、纳米技术应用以及人工智能等三大战略新兴产业打造的一个“智慧技术服务平台”。平台搭载国际顶尖芯片及处理器,拥有国际一流的超级计算机,在智能计算领域位于国内领先水平,可支持人工智能时代的各项新型业务。依托超算平台在机器学习、深度学习、强化学习等领域的硬件、软件和应用场景的丰富生态,构建智能计算服务能力,提供智能计算服务。通过“超算专业平台服务”,助力政府构建智慧城市的技术平台生态圈,改善苏州市的营商环境,提高苏州承建重大科热能创新和战略性项目的能力,聚集高技术科研单位和人才力量,为苏州经济的发展提供强大的科技引擎。 
与国内一些超算中心以CPU资源为主不同,苏州超算中心投入资源以GPU资源为主。相比于CPU计算,GPU 加速计算可以提供非凡的应用程序性能,能将应用程序计算密集部分的工作负载转移到 GPU,同时仍由 CPU 运行其余程序代码。从用户的角度来看,应用程序的运行速度明显加快.GPU 和 CPU 之间区别的一种简单方式是比较它们如何处理任务。CPU 由专为顺序串行处理而优化的几个核心组成,而 GPU 则拥有一个由数以千计的更小、更高效的核心(专为同时处理多重任务而设计)组成的大规模并行计算架构。苏州超算中心可以提供320块V100GPU计算资源,NVIDIA® V100 是有史以来极其先进的数据中心 GPU,能加快 人工智能(AI)、高性能计算 (HPC) 和图形技术的发展。
苏州超算中心总经理钱丰表示:中心将努力为生物医药产业服务,形成交叉学科和领域的具体解决方案,而不仅仅满足于做提供算力的基础支撑,我们的目标是共同打造一个支撑产业发展的创新生态圈,使公共技术平台更具活力。

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