新格元 sc-RNA plus 非因生物 GeoMx DSP “顶流”技术联合--解析更多生命信息

近年来随着生命科技的发展以及日益增长的对精准医疗的需求，基于单细胞分辨率和空间位置的多组学研究在肿瘤微环境和免疫微环境中应用日新月异。新格元生物科技有限公司与非因生物科技有限公司开展战略合作，双方将利用新格元平台自主开发的GEXSCOPE^®海量单细胞转录组测序、单细胞免疫组库测序及Focuseq™单细胞靶向基因检测技术，结合非因生物NanoString GeoMx DSP空间组学技术，多层次、多角度、多组学研究肿瘤微环境及免疫微环境，可以同时获悉胞间联系、基因空间变化等信息，同时赋予关键基因的细胞分布信息和组织分布信息，甚至是时空动态分布变化信息，从而更加精准的研究疾病相关分子机制并探索潜在的治疗靶点。

非因生物GeoMx DSP是NanoString最新发布的空间生物学技术平台，是目前市面上唯一同时实现高参数，多组学，高精度并且同时兼容石蜡样本，新鲜冷冻样本，组织微阵列等不同样本类型的平台。通过颠覆性的空间组学技术，可以在单张FFPE或者新鲜冷冻组织样本上一次性测定多达96个蛋白靶标和1,800个RNA靶标，并于一天之内可以处理多达20个样本，实验操作周期短，样本无损伤，可后续进行可续验证实验，有利于珍贵样本的保存及数据验证的可靠性。

图1 GeoMx DSP 数字化空间分析

GEXSCOPE^®海量单细胞转录组测序技术可揭示单个细胞独特的基因表达特征，精细区分细胞类型，深入研究细胞之间的相互关系，目前已经广泛应用于各种肿瘤的研究，在了解疾病的发病机理并指导疾病治疗方面具有独特的优势。GEXSCOPE^®海量单细胞免疫组库测序可特异性检测单个T/B细胞的TCR/BCR序列，结合单细胞转录组测序可以将细胞类型、TCR/BCR的V(D)J序列多样性及丰度相关联，研究样本间TCR/BCR克隆型的动态分布，迁移性及状态变化，分析克隆型与免疫细胞亚型的关系，揭示组织免疫细胞异质性和转录特征，有助于理解免疫组库的多样性、TCR/BCR介导的抗原特异性识别，以及适应性免疫的相关机制。Focuseq™单细胞靶向基因检测是对来自单个细胞的一组筛选的重要基因进行更高覆盖深度的测序，以期对靶向基因进行更全面、深入的研究。在病毒导致的疾病研究中，可同时捕获单细胞水平上病毒的基因表达情况及患者的转录本信息，从而找到病毒侵染程度、类型等信息与患者基因转录调控之间的联系，进一步获得与疾病靶点及有效生物标志物相关的信息。

图2  GEXSCOPE^®单细胞转录组测序

由于GEXSCOPE^®海量单细胞转录组测序技术的高分辨率，可将研究精确定位到细胞亚群或组织结构。借助GeoMx DSP技术进一步在空间上实现RNA和蛋白多组学层面的相互印证。GeoMx DSP借助特殊光学技术，可在展示全局组织结构的基础上，进一步实现从复杂组织中对细胞亚群或特定组织结构的纯化分析，不仅能获得清晰的样本空间信息，而且可以在连续切片上做到多重蛋白和RNA靶标的共检测，基于此可以针对性的选取目的细胞亚群或精细组织结构进一步分析及验证，从而更好的监测肿瘤微环境，挖掘疾病相关生物标志物和药物靶点。在不断提高靶标检测上限的同时，解决了定量准确性的问题；此外还避免了类似流式或磁珠分选技术对样本的高要求，用常规的FFPE或鲜冻组织样本实现对特定细胞亚群的特征分析。

GEXSCOPE^®海量单细胞转录组测序可以精准的解析组织微环境，GeoMx DSP可以通过形态学指导更好地还原组织微环境，目前两项“顶流”技术的联合应用也在Nature, Nature Medicine等顶级期刊上发文。GEXSCOPE^®海量单细胞转录组测序与GeoMx DSP技术强强联合，将极大的帮助科研工作者解读肿瘤异质性及其复杂的微环境，也将为肿瘤免疫学，神经生物学等重要转化医学课题带来革命性的创新！

图3  单细胞转录组联合DSP技术用于黑色素瘤患者免疫治疗研究^[1]

关于新格元生物科技有限公司

新格元生物成立于2018年，专注高通量单细胞多组学平台产品的自主开发及临床转化。公司成立后发展迅速，现已拥有国际领先的一站式高通量单细胞测序平台，提供从组织样本处理，高通量单细胞分离及测序文库构建，到数据分析和临床意义挖掘的全面解决方案。现有产品包括自主开发生产的Singleron Matrix™自动化单细胞测序文库构建仪器，GEXSCOPE^®高通量单细胞测序试剂盒，FocuSeq™靶向高通量单细胞测序产品，CeleScope™生信分析软件，及SynEcoSys™单细胞数据库，并已服务300多家知名医院，药企，及科研院所。

Singleron单细胞系统

关于非因生物科技有限公司

非因生物是一家以新型癌症蛋白组学和空间多组学为核心技术的、以癌症精准医疗研究与临床服务为核心业务的创新型生物医学公司。

非因生物拥有多项全国唯一、全球领先的核心技术平台，包括反相蛋白微阵列RPPA（Reverse Phase Protein Array），数字空间多组学分析DSP（Digital Spatial Profiler），以及基于平面光导技术PWG（Planar Wave Guide）的蛋白微阵列检测技术。公司以多种新型蛋白组学和空间多组学技术为核心，在癌症的基础研究、转化医学、临床研究、药物开发、临床诊疗等各方面开展自主及合作研究，并提供全方位高水准的科研及临床服务。

非因生物以技术为本，致力于打造中国最全面的新型蛋白组学和空间多组学高端技术平台，推动癌症转化医学研究和个体化诊疗的发展。

参考文献

Cabrita R, Lauss M, Sanna A, Donia M, Skaarup Larsen M, Mitra S, Johansson I, Phung B, Harbst K, Vallon-Christersson J, van Schoiack A, Lövgren K, Warren S, Jirström K, Olsson H, Pietras K, Ingvar C, Isaksson K, Schadendorf D, Schmidt H, Bastholt L, Carneiro A, Wargo JA, Svane IM, Jönsson G. Tertiary lymphoid structures improve immunotherapy and survival in melanoma. Nature. 2020 Jan;577(7791):561-565.

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新格元秉持“格物致知，识微通元”的创新性理念，致力于发展简便可靠的单细胞组学技术，使之成为新一代细胞病理及血液检测手段，让单细胞组学以传统方法无法比拟的精确度、灵敏度和分辨率服务于精准医疗和健康管理等领域。

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