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破次元壁|酵母单细胞转录组建库试剂盒上市预告

新格元 2022-08-20

持续的产品创新是新格元发展单细胞多组学技术的重要途径,2021年收官之际,新格元又为大家带来好消息:

酵母单细胞转录组建库试剂盒即将上市啦!


酵母是一种单细胞真菌,是分子生物学研究中常用的真核生物。酵母菌的细胞宽度(直径)约2-6um,长度5-30um,有的则更长,个体形态有球状、卵圆、柱状和香肠状等。酵母由于其清晰的遗传背景,较短的分裂周期,一直是生命科学研究中热门的模式生物。

图片来源于网络

由于酵母体积小、细胞内的RNA含量低,同时细胞壁裂解困难等原因,高通量单细胞测序这项科研利器,迟迟未能打开酵母研究领域的大门。


新格元即将发布的GEXSCOPE®微生物单细胞转录组试剂盒(酵母版),可实现酵母细胞的高通量单细胞RNA-Seq,用于解析酵母单细胞水平的异质性。


GEXSCOPE®微生物单细胞转录组建库试剂盒 (酵母版)简介


GEXSCOPE®微生物单细胞RNA文库试剂盒(酵母版)包含新格元微流控微孔芯片、带有独特细胞条形码的AccuraCell Beads、用于酵母细胞壁消化的消化液,以及用于合成cDNA和测序文库的相关试剂。借助GEXSCOPE®微生物单细胞RNA文库试剂盒(酵母版)可以在一天内,以固定或新鲜酵母为起始材料,完成酵母单细胞转录组测序文库的构建。

工作流程


产品优势

便捷:一体化,涵盖裂解酵母细胞壁到构建测序文库的完整解决方案

高通量:单张芯片可捕获500-30,000个酵母细胞

高效:一个工作日内可完成从样品前处理到测序文库构建全流程

广泛的应用领域:适用于基础到定制化研究


酵母单细胞测序应用示例


单细胞测序技术揭示出芽酿酒酵母衰老过程中的早期异质性

出芽酿酒酵母生命周期较短且易于进行分子遗传操作,因此是衰老研究中被广泛使用的模式生物。通过分析不同老龄状态的出芽酿酒酵母的单细胞转录组,研究者得出如下结论:

•随着老龄化的加深,出芽酿酒酵母细胞间转录差异性会增加。

老龄酵母中氧化还原过程、氧化应激反应(OSR)相关基因的转录水平更高。而幼龄酵母中与翻译、核糖体合成相关基因的转录水平更高。

图片来源于文献:Single-cell RNA-seq reveals early heterogeneity during ageing in yeast 

•FIT3和HAC1(FIT3在缺少铁离子和线粒体DNA丢失时被诱导,HAC1是FIT3的转录调节因子之一)的转录丰度与酵母衰老呈负相关性,FIT3可作为酵母衰老早期的标志物之一。

图片来源于文献:Single-cell RNA-seq reveals early heterogeneity during ageing in yeast


GEXSCOPE®微生物单细胞转录组试剂盒(酵母版)预计将在2022年一季度上线,敬请赐候!


相关文献

1.Single-cell RNA-seq reveals early heterogeneity during ageing in yeast  

2.A yeast-optimized single-cell transcriptomics platform elucidates how mycophenolic acid and guanine alter global mRNA levels   

3.Single-cell RNA sequencing reveals intrinsic and extrinsic regulatory heterogeneity in yeast responding to stress  


- THE END -


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