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第二届研之成理单晶结构解析与晶体结构可视化讲习班圆满成功

研之成理 研之成理 2021-12-21

研之成理科研平台于 2019 年 04 月 25 日 – 2019 年 04 月 28 日在杭州成功举办 「第二届单晶结构解析与晶体可视化讲习班」。本次培训的主讲人是中科院大连化物所张江威老师。


单晶结构解析是表征物质结构最直观,也是最有效的手段之一。通过单晶结构解析可获得化合物的原子三维坐标以及键合排列堆积信息,能很好地揭示材料深层的结构与性能之间的关系,从而有助于获得重要的学术研究成果,发表高水平的学术论文。目前许多研究工作者,尤其是从事药物合成,药物晶型,MOF, COF,金属纳米团簇,钙钛矿等功能材料设计合成,光电磁新型晶态化合物等研究领域的,对晶体结构解析有重要需求。特别是对一些非常规条件测试下,微小晶体,空间群需要变换而难以确定、复杂超大结构、无序、孪晶、手性绝对构型,矿物置换无序确定等较难解析的晶体结构束手无策。


本次培训在介绍单晶解析理论基础上,应用目前最新的图形界面化(GUI)程序 Olex2 为平台,加载包括最新 Shelxl2018、supperFlip、Sir2014 等单晶结构解析程序解析单晶结构。


运用包括最通用和经典的 Direct Methods,Patterson Method 两种算法以外,还包括最新发展的 Charge Flipping,Intrinsic Phasing,Structure Expansion 和 Dual Space 算法,展示最新算法在解析结构方面的优势。并进一步提供同步辐射测试数据以及不同衍射仪原始图片数据还原的处理方法


介绍最新基于 olex2 最新插件包括 drawplus,reportplus等的使用,逐步实现晶体的解析各种晶体学信息的提取及自动生成发表文章所需要的各种表格及数据。


提供实例讲解解析晶体结构的完整过程。如何处理晶体无序、孪晶?如何利用 WinGX、Platon、Sir等程序辅助确定空间群、寻找栾晶矩阵、去除无法确定的溶剂衍射贡献等,以及如何进一步精修,利用Encifer完善CIF文件信息编辑,获得尽可能消除A、B类警告的checkcif报告,申请CCDC编号等满足文章发表的要求。

 

最后讲解 diamond, XP, Mercurry 绘制晶体相关作图,包括晶胞图、画ORTEP图、堆积图,氢键堆积,简单的拓扑分析等等,结合晶体学数据库包括CCDC、ICSD、Crystallography Open Database、Springer Materials,Materials Project的检索使用,对CIF结构信息进行有效的提取、分析与利用,晶体学各种数据格式之间的相互转化。


通过本次培训,学员掌握了晶体结构解析技术,处理一些常见的晶体结构解析问题,满足日常的晶体结构解析需要,学会绘制晶体图,检索晶体数据库,对晶体结构信息进行有效利用与提取。


这次培训共有近 30 人参加,学员来自全国各地,既有高校从事专门从事单晶测试与分析的老师,也有需要使用单晶结构解析的研究生,还有来自相关企业的研发人员。培训期间剪影如下:


▲ 合影、培训现场剪影


培训间隙,讲师认真、细心的帮学员答疑解惑,并结合学员在实际 SCI 论文写作中碰到的问题进行深入沟通和现场润色、修改。无论是基础的语法、句型问题,还是写作逻辑、投稿经验,讲师都一一解答,倾囊相授。针对培训,我们创建专门的微信群。课程结束后,讲师还在不断提供答疑解惑和沟通。


更多科研培训课程,请前往公众号栏目:「往期整理」- 「培训中心」查看。

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