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CP2K课程圈子开课啦 | 免费的理论计算软件,没有废话的干货课程!

研之成理 研之成理 2022-04-16
加入CP2K圈子,永久回放课程内容,永久参与专题直播讨论课,永久享受课程答疑群。报名费会随着专题讨论课的增多而上升,上车要趁早。此次培训不仅会使用CP2K,也会涉及其他主流AIMD计算程序。

01问:什么是AIMD和CP2K?
答:AIMD全称ab initio molecular dynamics,用DFT等方法计算原子受力,用于跑分子动力学模拟。CP2K是目前最为强大的AIMD计算程序。




02问:为什么要学习AIMD?
答:简单讲AIMD=顶刊。传统计算能量+过渡态+电子结构的方式分析非常普通,很难吸引审稿人。但是AIMD提供的轨迹和极为丰富的后处理分析往往能够成为文章亮点核心。



03问:为什么要参加培训?
答:CP2K是开源免费程序,网上的系统性学习资料很少,巨坑无数,入门无从下手。此培训是最为全面详细专业的CP2K与AIMD计算课,是学习CP2K的最佳途径,而且还请了cp2k开发专家来讲专题讲座。



课程内容

第一部分 AIMD


复杂体系的建模,异质结建模,水盒子建模,负载催化剂团簇模型,CP2K计算需要的结构文件生成。

AIMD 计算,基本流程,相空间,系综,宏观量的计算,牛顿运动方程,速度形式的 Verlet 算法,AIMD模拟的关键参数,AIMD模拟时间步长的选择,AIMD 模拟参数测试,AIMD 的可重复性问题,Energy drift 问题,周期性边界条件,动能与温度,控温技术与热浴,速度调节法,Anderson 热浴,Nosé–Hoover 热浴,模拟退火, AIMD 的计算参数详解。轨迹文件的简化和可视化,VMD 的简单使用,AIMD 的后处理,键长键角跟踪,能量与温度涨落,径向分布函数,亥姆霍兹自由能路径计算,均方位移,扩散常数,速度自相关函数,红外光谱,固液界面平均静电势计算,引入电极电势对固液界面的影响。锂离子电池的动力学模拟,倍率性能的测试模拟。

自由能势能面的计算限制性constrained AIMD模拟,Potential of mean force,blue-moon/Slow-growth 方法计算自由能势能面。Metadynamics 方法。高斯势函数的参数技巧,数据后处理,一维二维自由能势能面绘制方法。

第二部分 CP2K

CP2K 编译:使用intel mkl库和openmpi的高速/tools/toolchain编译方法,预编译版本。
CP2K 简介:CP2K 的优缺点,CP2K 经典文章介绍。

基本参数设定
K点的设定, CP2K 输入文件.inp文件格式,CP2K计算原理和重要关键词详解,CP2K输出文件,CP2K 基组赝势的选择和设定,坐标读入,基组重叠误差,OT 和 Diag 对比,结构优化和实例练习。范德华校正方法,DFT-D3的设定,SCAN+rVV10设定,DFT+U处理强相关体系,HSE06杂化泛函的计算。铁磁,反铁磁,亚铁磁等磁性体系初始磁矩的设定。

晶胞优化,几何结构优化,频率计算
CELL_OPT和GEO_OPT设置与计算技巧,分子体系优化,固体和表面体系结构优化,吸附分子体系的优化,静态频率计算,自由能等热力学量的校正。非周期性体系的计算参数设定。

过渡态计算
过渡态判据,无过渡态反应类型,寻找过渡态方法综述,chain-of-states 搜索方法和原理,传统 PEB 方法(plainelastic band)方法遇到的问题,NEB 中 nudge 过程原理,Climbing Image 原理,判断插点个数,插点方法,CI-NEB方法计算过渡态。DIMER方法计算过渡态。反应速率常数计算,AIMD模拟时间预估方法。

态密度
态密度和能带形成的基本理论,案例分析(单原子催化剂,表面离子缺陷态,表面态,d带中心,催化吸附的轨道相互作用模型),CP2K的DOS后处理和pDOS计算分析。

分子轨道,电荷密度和原子电荷
CP2K计算电荷密度,自旋密度,HOMO/LUMO分子轨道,电荷密度差分,平面平均的电荷密度,Bader 电荷,Mulliken电荷,HIRSHFELD电荷,LOWDIN电荷等。

ELF、静电势和功函
CP2K计算静电势/功函数概念和计算方法,cube文件的可视化分析,与平面内积分方法,异质结静电势,静电势分析表面负载团簇的电子流向,分子表面或载体表面静电势分布,受阻路易斯酸碱对。电子定域化函数(ELF),ELF 研究表面催化反应过渡态、电子化合物、缺陷态、分子团簇、吸附分子。

AIMD计算
CP2K的AIMD输入文件,轨迹图的制作,结构数据的后处理分析,径向分布函数RDF,均方位移MSD,模拟退火,键长键角跟踪,能量与温度涨落。自由能势能面的模拟。

第三部分 CP2K专题讲座

后续预计专题讲座(每个讲座1-2h):
(2020年)使用TRAVIS和CP2K联用计算振动光谱
(2020年)CP2K赝势与基组的开发和选择
(2020年)用Gromacs分析cp2k和vasp的计算结果
(2020年-2021年)PLUMED和CP2K连用计算AIMD
(2020年-2021年)SCCS隐式溶剂化方法计算
(2020年-2021年)CP2K能带结构计算
(2020年-2021年)CP2K计算模拟STM图
(2020年-2021年)第二代CPMD计算方法
(2020年-2021年)CP2K的QMMM计算方法
(2020年-2021年)LS_SCF超大体系解决之道
(2020年-2021年)ADMM加速杂化泛函计算
(2020年-2021年)xtb超大体系解决之道

时间安排
2020年9月26-27日
第一部分 AIMD (2天,每天2-3h)
2020年9月或10月
第二部分 CP2K (3天,每天2-3h)
2020年到2021年
第三部分 专题讲座(每次约1h)

讲师介绍

刘博士,清华大学博士,长期从事表面催化和材料计算研究,对量化计算,第一性原理计算,分子动力学模拟有六年研究经验,精通 VASP,CP2K,Gaussian,ORCA 熟练使用 JDFTx,Gromacs,ADF 等计算程序。近三年在表面催化,电催化,电池材料,过渡金属配合物等领域发表多篇文章。在 JACSNat. Commun. ,ACS Catal.Nano Energy, Natl. Sci. Rev. 等期刊上以第一作者发表纯理论计算文章,并与实验科学家合作在 Nat. Nanotech., Nat. Commun., PNAS,Adv. Mater., JACS  等期刊上发表多篇合作文章。
Google Scholar:
https://scholar.google.com/citations?user=hAkSR2wAAAAJ&hl=en

报名相关

报名流程:
● 首先请认真阅读课程内容介绍,如果需要咨询或者购买课程,请扫描下方二维码,添加工作人员微信(请注明「CP2K课程」)。
● 成功添加微信后,工作人员会告知具体缴费方式。缴费完成后,工作人员会拉你进入钉钉直播群和微信交流群(每晚统一回复,请耐心等待)。

● 报名费:自费:1500 元/人(不开票);公费:1700 元/人(可开发票)。此价格会随着专题课开课而提高。费用包含全5天的听课费和后续专题讲座听课费、电子版讲义费、视频回放。

听课方式:钉钉群直播,直播完成后,学员可以在交流群内不限次观看和提问(视频内容不支持下载)。

培训须知

1. 培训结束后提供电子版盖有公章的会议通知函。若当前会议通知不方便报销,我们也可以按照报名者的要求进行调整,请通过微信联系我们。
2.   培训内容包含大量练习和演示,故强烈建议参加者自备电脑(Windows 系统 64 位,对配置无要求)。

FAQ

1、课程通过什么平台观看,永久有效吗?课程通过钉钉平台观看,缴费后,运营人员会拉你进入钉钉群,钉钉群内可以永久回看。另外,我们建有课程交流微信群,讲师会在群内与大家交流互动。
2、可以开票吗?可以开具发票。
3、有优惠吗?暂无优惠,并且未来随着专题课增多会提价。

声明

本视频仅限参加研之成理培训班的学员个人学习使用,版权归属于研之成理(杭州)网络科技有限公司。不得以任何方式擅自翻录、复制、传播、出售,或将其中内容挪作它用,否则将追究法律责任。如果有人发现盗版和侵权行为,请保留犯罪者的聊天记录和收款转账记录等。经核实后,我们给予举报者免费报名听课机会和现金奖励。

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