JIA | 我国第一例动物源ST602型广泛耐药大肠杆菌报道

微生物耐药性是全世界农业、环境、公众健康面临的最紧迫威胁之一，危及食品安全、国际贸易和经济发展，并阻碍可持续发展目标的实现，被视为“一种慢性的大流行病”，“应对微生物耐药”亦成为我国生物安全领域重大需求之一。另一方面，由于微生物耐药性形成机制复杂，传播途径具有多样性、复杂性和隐蔽性，应对微生物耐药性已从过度依赖疫苗/药物等单一手段，发展为“外防输入、内防扩散”，侧重监测、预警、溯源、消杀等领域。

我国是畜禽养殖大国，兽药是其疫病主要防控手段之一，长期过量、超范围使用兽药，使得畜禽养殖业演变成微生物耐药株和耐药基因巨大储存库；另一方面，大多数动物源耐药微生物/耐药基因可通过生态环境，在动物/植物、环境和人类之间自由移动，因此必须加强畜禽动物源微生物耐药性相关研究。

近期，中国农业科学院上海兽医研究所动物生物安全共性技术团队李涛研究员与南华大学涂剑教授、扬州大学李瑞超教授合作，报道了我国第一例动物源ST602型广泛耐药大肠杆菌。研究结果以“Characterization of a bla_CTX-M-3, bla_KPC-2 and bla_TEM-1B co-producing IncN plasmid in Escherichia coli of chicken origin”为题在Journal of Integrative Agriculture (《农业科学学报》(英文)，JIA) 2023年1期正式发表。

该研究从规模化养鸡场棉拭子泄殖腔取样，分离鉴定出一株广泛耐药（An extensively drug-resistant, XDR）大肠杆菌（命名为258E）。MLST分析结果表明，大肠杆菌258E属于ST602型，该分型目前仅见于国外文献报道。全基因组测序结果表明，大肠杆菌258E含有三个质粒（pEC258-1、pEC258-2、pEC258-3），其中pEC258-1和pEC258-2不含有常见耐药基因，而pEC258-3除了含有常见耐药基因，如qnrS1、dfrA14、arr-3、acc (6')-Ib等，还含有bla_CTX-M-3、bla_KPC-2、bla_TEM-1B三个重要的耐药基因。同源性分析结果显示pEC258-3序列与人源肺炎克雷伯菌质粒pCRKP-1-KPC同源性高达99.96%。同时，流行病学溯源分析结果显示，大肠杆菌258E与英国菌株具有相近的亲缘关系。

该研究第一次报道了一株动物源ST602型广泛耐药大肠杆菌，其所含有的质粒可介导宿主菌对多种抗生素产生耐药性，暗示其潜在的耐药性水平扩散风险，也间接证明动物源细菌是耐药性基因的重要储存库和风险传播源头之一。丰富和充实了“同一健康” 框架下细菌耐药性对人类公共健康的风险研究。

动物源菌株质粒与人类临床菌株质粒重要耐药基因bla_KPC-2环境对比图

南华大学王文敬、王益富硕士生为本文共同第一作者，李涛研究员、涂剑教授和李瑞超教授为论文通讯作者。本研究受到了国家重点研发计划、上海市科技兴农、中国农业科学院创新工程重大任务资助。 

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https://doi.org/10.1016/j.jia.2022.08.075

Cite the article:

WANG Wen-jing, WANG Yi-fu, JIN Ya-jie, SONG Wu-qiang, LIN Jia-meng, ZHANG Yan, TONG Xin-ru, TU Jian, LI Rui-chao, LI Tao. 2023. Characterization of a bla_CTX-M-3, bla_KPC-2 and bla_TEM-1B co-producing IncN plasmid in Escherichia coli of chicken origin. Journal of Integrative Agriculture, 22(1): 320-324.

Journal of Integrative Agriculture (《农业科学学报》(英文), JIA) 由中华人民共和国农业农村部主管，中国农业科学院与中国农学会主办，中国农业科学院农业信息研究所承办。综合性英文学术期刊，月刊。创刊于2002年，现任主编为中国工程院院士、中国农业科学院副院长王汉中。JIA主要栏目有作物科学、园艺、植物保护、动物科学、动物医学、农业生态环境、食品科学、农业经济与管理等。刊稿类型有综述、研究论文、简报以及评述等。全部论文在Elsevier-ScienceDirect (SD) 平台OA出版。最新SCI影响因子4.384，位于SCI-JCR农业综合学科Q1区。中科院分区农林科学1区。2016年以来先后获得中国科协等部委 “提升计划”“登峰计划”“卓越计划”项目支持。

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