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偷偷领!高分 SCI 密码「组学研究」入门秘籍

丁香学术 2023-03-28

博士生 A

听说师兄的那项组学研究工作已经被我们领域的顶刊接收了。可喜可贺!

博士生 C

师兄分享下组学实验经验呗,为什么我的组学实验问题频出?我都快失去信心了......

博士生 D

是啊师兄,快快传授下经验,我打算用冻存的血样提外泌体做蛋白组学,你说冻存的血样可以吗?

师兄

都说组学研究进阶难,掌握了关键点其实很容易。整体而言,样本制备处理和后期的数据挖掘验证是最重要的两环。接下来我就拿出我总结的《组学样本制备宝典》实验手册,展开说说……



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样本制备处理堪称组学研究的基石,第一步总是问题百出,比如:


冻存久了的血清、血浆抽提外泌体可以做蛋白质组学吗?

血浆和血清哪个做蛋白质组学比较好?

非常规的石蜡样本(FFPE)是否可以进行蛋白质组学?


不用担心,这些问题,实验手册里全都有解答。正可谓有它在手,实验不愁!除了常见问题分析,《组学样本制备宝典》手册还从样本制备处理和后期的数据挖掘验证两大方面进行系统梳理,从根本上为组学实验保驾护航。以下内容来自《组学样本制备宝典》手册。



组学研究开头难

三步法确定实验目的


1)明确研究类型


蛋白组学:定量蛋白组学、修饰蛋白组学、靶向蛋白组学;


代谢组学:非靶向代谢组学、靶向代谢组学。


2)确定样本类别:


组织类、体液类、细胞类、粪便(内容物)或非常规样本等。


3)选择合适的组学项目:


TMT 蛋白质组学、4D/480 label free 蛋白质组学、普通 label free 蛋白质组学、大样本 4D-DIA 蛋白质组学、4D 磷酸化蛋白质组学、4D-PRM 靶向蛋白质组学等等


针对不同的实验目的,制备相应样本量,以血清/血浆样本为例:


表 1. 血液样本蛋白质组学样本量要求


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内容策划:那雪妍
内容审核:邱天天

题图来源:图虫创意

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