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经典 ! PCR 条带弱 4 步排查法(看到就是赚到)
从 PCR 反应的关键环节入手,我们可以发现 PCR 经常会在「酶的质量」「引物」「mix」「反应体系与温度」上出现错误,因此原因也应该在这些环节基础上,进行分析排查。本篇内容来自「PCR 常见问题专题」,提前订阅专题好内容不错过!
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PCR 常见问题全解析
酶失活的原因
需要更新酶,或者新旧两种酶同时使用,分析是否因酶的活性丧失或不够二导致的假阴性。需注意,有可能是忘记加 Taq 酶或溴乙锭。
引物出现问题
引物质量、引物的浓度、两条引物的浓度是否对称,是PCR失败或扩增的条带不理想、容易弥散的常见原因。有些批号的引物合成质量有问题,两条引物一条浓度高,一条浓度低,造成低效率的不对称扩增。
mix 与镁离子浓度
镁离子浓度对 PCR 扩增效率影响很大,浓度过高可降低 PCR 扩增的特异性,浓度过低则影响 PCR 扩增产量甚至使 PCR 扩增失败而不出扩增条带。
反应体系与温度设置
通常进行 PCR 扩增采用的体积为 20μL、30μL、50μL 或 100μL,应用多大体积进行 PCR 扩增,是根据科研和临床检测不同目的而设定,在做小体积如 20μL 后,再做大体积时,一定要摸索条件,否则容易失败。
变性对 PCR 扩增来说,也相当重要。如变性温度低,变性时间短,极有可能出现假阴性;退火温度过低,可致非特异性扩增而降低特异性扩增效率,退火温度过高,影响引物与模板的结合而降低 PCR 扩增效率。
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