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蛋白组学样本制备,数据处理 protocol 免费领!

丁香学术 2023-04-30

师姐

师姐,我做的血清蛋白组学实验,竟然没有检测到生物标记物,这是为什么啊?

大概率样品制备失败了。去除高丰度蛋白了吗?

师姐

师妹

一时疏忽忘记了,不过怎么判断是否需要去除高丰度蛋白?

组学实验的注意点多着呢,这本宝典你一定要看看!

师姐


《组学样本制备宝典》手册来袭

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样本制备处理堪称组学研究的基石,第一步总是问题百出,比如:


冻存久了的血清、血浆抽提外泌体可以做蛋白质组学吗?

血浆和血清哪个做蛋白质组学比较好?

非常规的石蜡样本(FFPE)是否可以进行蛋白质组学?


不用担心,这些问题,实验手册里全都有解答。正可谓有它在手,实验不愁!除了常见问题分析,《组学样本制备宝典》手册还从样本制备处理和后期的数据挖掘验证两大方面进行系统梳理,从根本上为组学实验保驾护航。以下内容来自《组学样本制备宝典》手册。



组学研究开头难

三步法确定实验目的


1)明确研究类型


蛋白组学:定量蛋白组学、修饰蛋白组学、靶向蛋白组学;


代谢组学:非靶向代谢组学、靶向代谢组学。


2)确定样本类别:


组织类、体液类、细胞类、粪便(内容物)或非常规样本等。


3)选择合适的组学项目:


TMT 蛋白质组学、4D/480 label free 蛋白质组学、普通 label free 蛋白质组学、大样本 4D-DIA 蛋白质组学、4D 磷酸化蛋白质组学、4D-PRM 靶向蛋白质组学等等。针对不同的实验目的,制备相应样本量,以血清/血浆样本为例:


表 1. 血液样本蛋白质组学样本量要求


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数据挖掘

为组学研究插上翅膀


仅仅成功制备样品,获得组学数据还不够。面对庞大的组学数据,如何挖掘关键信息,探索更深的机制,才是冲击文章顶刊的关键。机不可失,全方位、手把手视频教学来喽!


无论是数据挖掘和验证、多组学整合分析,还是 4D 蛋白组学的应用解析……你想知道的都在手册里,全面助力科研登峰。订阅领取方式如下!有了它,顶刊还会远吗!


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内容策划:邹礼平
内容审核:邱天天

题图来源:图虫创意

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