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0.052秒打开100GB数据!这个Python开源库牛X了
来源丨开源最前线(ID:OpenSourceTop) 猿妹综合整理
链接:https://towardsdatascience.com/vaex-out-of-core-dataframes-for-python-and-fast-visualization-12c102db044a
什么是Vaex?
Vaex是一个高性能Python库,可以可视化和探索大型表格数据集,它可以在 N 维网格上计算每秒超过十亿(10^9)个对象 / 行的统计信息,例如均值、总和、计数、标准差等, 磁盘上大小超过100GB的数据,用Vaex只需要0.052秒就可以打开。
使用直方图、密度图和三维体绘制完成可视化,从而可以交互式探索大数据。Vaex 使用内存映射、零内存复制策略获得最佳性能(不浪费内存)。
Vaex具有以下功能特性:
基于Python数据科学站(例如Panda、Scikit-Learn、arrow、xgboost、lightgbm),标准API易于采用。为Jupyter环境量身定制。
电脑运算,结合了内存映射,复杂的表达系统和快速核外算法。有效地可视化和探索大型数据集,并在一台机器上构建机器学习模型。
基准测试,每秒可视化10亿个样本。与标准实现相比,PCA转换速度提高了10倍,可在2分钟内处理10亿个样本。完全超出核心。
高效
Vaex不仅仅是Panda的替代品。尽管在执行诸如的表达式时,它具有类似于panda的API用于列访问np.sqrt(ds.x**2 + ds.y**2),但不会进行任何计算。而是创建一个vaex表达式对象,并在打印输出时显示一些预览值。
虚拟列
我们还可以将表达式添加到DataFrame中,从而生成虚拟列。虚拟列的行为类似于常规列,但不占用任何内存。Vaex在实列和虚列之间没有区别,
可视化
进行有意义的绘图和可视化是了解数据的最佳方法。。但是,当你的DataFrame包含10亿行时,制作标准散点图不仅会花费很长时间,而且会导致毫无意义且难以理解的可视化。
让我们看看这些想法的一些实际例子。我们可以使用直方图可视化单个列的内容。
可以将其扩展为两个维度,从而生成热图。我们可以像典型的热图那样简单地计算落入每个样本中,而不是计算平均值,取总和的对数或几乎任何自定义统计量。
我们甚至可以使用ipyvolume进行3维体积渲染。
Vaex 官方网站:https://vaex.io/
文档:https://docs.vaex.io/
GitHub:https : //github.com/vaexio/vaex
PyPi:https://pypi.python.org/pypi/vaex/
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