影像组学常用的一些工具（软件）

Original 影像诊断与科研影像诊断与科研 2023-05-18

收录于合集 #影像组学 25个

本文结合“Computational resources for radiomics”一文和经验中对影像组学涉及的工具（软件）做了一下总结；后附本文原文。

一、查看工具（勾画ROI）：

1、3DSlicer(www.slicer.org) 如果没有购买商业软件或本人有代码基础，推荐使用，软件功能强大后续会整理相关使用手册。

2、MIM software(www.mimsoftware.com)。

3、AK GE公司提供。

4、Mazda软件 提供2D、3D感兴趣区划取，以及一些简单的特征筛选方法。

5、Other software（itk-SNAP (www.itksnap.org), Definiens Lung T umor Analysis (LuTA) tool (www.definiens.com)、and the Velocity

ROI delineation tool (www.velocitymedical.com)

二、Image feature extraction/特征提取工具：

1、MaZda(http://eletel.eu/mazda)：提供2D、3D感兴趣区划取，以及一些简单的特征筛选方法。

2、3D Slicer 配合插件使用。

3、Firevoxel 提供参数有限。

4、Chang-Gung Image Texture Analysis (CGITA)

5、TexRAD(www. texrad.com)

6、IBEX (Stand-aloneIBEX: http://bit.ly/IBEX_MDAnderson;Source-code version: http://bit.ly/IBEXSrc_MDAnderson)

7、In-house software（Many groups have written in-house software to extract features using MA TLAB (14,66). In many cases, this

in-house software builds on other software programs, such as CERR (18,67). Of particular note is the Insight Segmentation and Registration T oolkit, (ITK, itk.org). ITK is an open-source set of software tools for image analysis, including image pre-processing, segmentation, registration and texture calculation, which can be incorporated into

researchers’ own software.）

三、Modeling/statistical analysis/分析特征的工具：

1、R (www.r-project.org/). 应用广泛需代码

2、Python 应用广泛需代码

3、SPSS(www.ibm.com/software/analytics/spss).

4、Stata(www.stata.com).

5、MedCalc(www.medcalc.org).

6、Bioconductor(www.bioconductor.org).

7、Weka(www.cs.waikato.ac.nz/ml/weka/).（免费、入门简单）

1、头颅CT及MR解剖合集

头颅正常CT解剖图谱

脑MRI常用解剖