查看原文
其他

技能提升:多模态、肠道菌课程即将开课 !


01多模态

课程背景 


磁共振成像(MRI)技术是人脑成像的重要研究工具。MRI研究已成为脑疾病、认知神经科学等领域的重要研究手段之一,但是MRI数据分析技术的不足严重制约着许多临床医生和研究生高水平研究的开展。为此,我们拟举办磁共振脑成像数据处理分析基础实操培训班,本次课程适合于零基础学员,手把手教学。经过本次培训,所有学员能具备独立分析核磁共振常见三种模态(fMRI, T1-weighted MRI, DTI)数据的能力。希望帮助刚刚接触磁共振脑成像的临床医生如放射、精神、神经内外科、康复科、儿科等及心理、语言、管理类研究生快速了解本领域及初步掌握数据处理及分析的相关方法、提高国内磁共振研究的基础水平。
本班实行“一对一指导服务”,即如果报本班,不仅有同步回放视频,而且一对一指导服务,解决学完无法消化问题学不会免费继续学,直到学会为止
后期安排4个晚上一对一指导辅导解决学员问题,赠送视频供回放使用,以后线下可免费复听

主要内容


培训内容:resting-state fMR图像处理、task fMRI图像处理、T1-Weight 图像处理、PET图像处理、DTI图像处理,以及多模态数据联合分析,结果分析、作图等。

主要包括fMRI技术的基础知识,数据预处理,基于fMRI的功能连接/有效连接分析基本原理和matlab 程序实现,ALFF,ReHo等体素指标计算,任务相关fMRI数据处理,T1-Weighted图像预处理,脑体积计算,PET图像处理,DTI数据处理,纤维素追踪,多模态联合分析,Advanced统计&多重比较,结果呈现和科研作图等。


课程讲师  


李老师,熟悉 MRI,SPECT,PET 成像原理。精通 MATLAB 语言, 熟练掌握各种数据处理软件,SPM, FSL, Freesurfer, ExploreDTI,Rest, Dparsf, 以第一作者发表SCI论文多篇

课程设置



 
第一节
 
8:30-10:00
1、基本的软件安装
Matlab、SPM、dcm2niigui、Rest、DPARSF、cat12、Difussion Toolkit、TrackVis、Gretna、BrainNet、FITI等
第一天上午
休息20分钟

 
 
第二节
 
 
10:20-11:50
1、MRI成像原理
2、MRI图像格式转换
3、MRI图像查看
4、静息态fMRI图像的处理
5、实际操作
 
 
 
 
 
 
第一天下午
 
第一节
2:00-3:30
1、静息态fMRI图像的分析
2、实际操作
休息20分钟
 
 
第二节
 
3:50-5:20
1、 脑功能网络的构建
2、 实际操作
3、 脑功能网络分析及作图
4、 实际操作
晚上
第一节
 
7:00-8:30
1、block任务态fMRI图像的处理及分析
2、实际操作
休息10分钟
第二节
 
8:30-9:50
1、event任务态fMRI图像的处理及分析
2、实际操作

第一节
8:30-9:20
1、T1加权图像的处理与分析
2、实际操作
第二天上午
休息20分钟

 
第二节
 
10:00-11:40
1、DTI图像的预处理
2、实际操作
1、 纤维素追踪
2、 实际操作
 
 
 
 
第二天下午
 
第一节
 
2:00-3:30
1、DTI图像的分析
2、实际操作
休息20分钟
 
 
第二节
 
 
3:50:00-5:20
1、多模态联合分析方法
2、实际操作


02肠道菌

学习背景介绍

“肠道菌群”近年来“CNS”级别文章频发,同时也是国家自然科学基金资助的重点方向之一,其适用的研究领域也迅速扩展,从经典的中医、中药领域,到代谢性疾病、神经系统疾病、心脑血管疾病和免疫相关疾病,再到近年新的热点—“肠道菌群与肿瘤”,发展势头强劲。该方向的一大优点是可以通过高通量测序很快上手,实现“短、平、快”的发表文章,积攒研究基础。然而,我们在研究中面对的最大痛点是测序的文章发表后,后续的机制研究该怎么延伸,这一直是肠道菌群相关研究的重要难点。

这次的会议会详细给大家讲解“如何更高效的进行多组学测序搭配”和“测序之后的机制研究实验该如何开展”,在重点回答上述两个问题的基础上,对国自然课题的设计及研究进行梳理,搭建2021年国自然项目书的整体思路框架。


学习目的与预期

1.熟悉肠道菌与代谢研究的国内外动态,热点与趋势;

2.了解肠道研究课题设计思路与临床应用方法;

3.掌握高水平肠道菌课题研究思路与设计方法;

4.掌握基于16S rDNA测序的肠道菌数据分析报告内涵及基本的数据统计;

5.熟悉肠道菌群研究与其他研究思路结合的原则及方法;

6.掌握肠道菌研究样本收集、保管、储存及预处理方法及关键注意事项;

7.结合已有的工作基础,搭建2022年国自然项目书的整体思路框架


讲师介绍

刘博士,长期专注于肠道微生物菌群变化与疾病相关性等方面研究,经验丰富、课程内容为原创设计,对此领域的科研思路以及最新研究动态熟悉掌握。从事相关科研课题设计工作多年,发表论文20余篇,其中10分以上2篇。多次应邀为大学、医院、科研单位进行相关主题讲座指导,具有丰富的课题设计和执行经验。并多次受邀在国际大会上发言,对微生物多样性、宏基因组、宏转录组、代谢组学等相关方向有深刻了解,且具有丰富讲课经验表达能力,通过两天的课程一定能让您对肠道微生物方面的课题设计及研究执行有很好的理解。


会议安排




课程时间

(1)2022.4.9-10日(周末,2天)

(2)授课方式腾讯线上

(3)上午:8:30-11:30;下午:13:30-17:00


主办单位

玮瑜科研平台


承办单位
上海玮瑜生物科技有限公司

上海焦务科技服务中心


课程费用


(1)费用:3800元/人 ;两班连报(以上两门课程)6000元/人。

(2)发票名目:可开会务费、会议费、注册费、检测费、统计分析服务费等发票。


报名方式

添加小编琪琪微信咨询报名

添加小编琪琪:brainnews_11

您可能也对以下帖子感兴趣

文章有问题?点此查看未经处理的缓存