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生物信息学个性化分析、TCGA/GEO数据库挖掘分析等服务

七师兄 生信之家 2022-04-16


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   如您看了某篇最新发表的高分文章的创新思路与漂亮图表,让你心里很痒痒,想模仿这篇文章的生信分析的套路, 如何来学呢?


医药加三门金牌生信课程的区别与联系


针对学员提出的医药加的三门生信课程之间有什么区别与联系,宋老师用语音来回答您:



  1.  第4/5期TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班通知(理论+实操+课后复习视频)


  2. 第十三期测序与芯片的高通量数据挖掘与分析学习班(理论+实操+课后复习视频)


  3. 第7期全国R语言数据分析实战技术学习班(理论+实践课

如果您看到是已经开过的班,可以加学习班秘书yiyaojia01, 咨询我们下期的开班时间。


宋伟老师简介

个人成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。


研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。


培训经历:在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有:医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。


培训方向:《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》等。

医药加平台推出生信高级分析服务 (由医药加生信班专家讲师-宋伟博士团队提供服务)

强强联合

      生物信息是一种综合性的学科,也是一门工具。它与临床医学、动植物学、微生物学等方向有这密切的联系,通过生信分析可以——获得理论或基础的结论、指导实验方向和丰富文章内容


我们需要“强强联合”,把各自擅长的领域联合——研究方向领域基础+生信高级分析。个性的分析服务,可以节省时间、提高质量。


高级分析特点:不同项目方向做高级生信分析,设计不同的创新思路,达到课题研究目的,获得结果(图表)及结论。


定制化数据分析内容展示:

类别

分析项目

分析内容

单组学高通量高级分析

(基于已有的标准分析结果,添加高级分析)

转录组学:lncRNA、miRNA、mRNA、circRNA测序/芯片数据。

基因组学:全基因组测序、外显子测序/芯片数据。

表观组学:DNA或RNA甲基化测序/芯片数据。

蛋白组学:ITRAQ质谱数据。

代谢组学:GC-MS,LC-MS,NMR

宏基因组学:16s测序、宏全基因组测序数据。

差异表达基因筛选;

无监督聚类的PCA或HeatMap分析;

有监督聚类的OPLS-DA分析;

基因上下游调控预测(miRNA,TF);

VENN图分析;

蛋白与蛋白互作网络分析;

WGCNA模块分析;

基因相关性分析;

lncRNA(circRNA)与mRNA共表达分析及网络构建;

关键lncRNA(circRNA)或miRNA功能分析;

竞争内源RNA(ceRNA)预测;

多组样本不同时间(浓度)递增数据分析;

筛选关键基因(lncRNA、circRNA或mRNA);

GSEA富集分析;

生存预后分析;





基于公共数据库的高级分析。

基于TCGA/GEO/SRA/EBI数据库做癌症靶标预测(miRNA, lncRNA, mRNA)和通路功能筛选。

多套数据整合分析.

多组学整合分析(基于标准分析结果,添加高级分析)

全转录组整合分析;

转录组与蛋白组整合分析;

蛋白组与代谢组整合分析;

基因组与转录组整合分析;

表观组与转录组整合分析;

个性化定制分析(想法帮你实现)

根据需求做图、做表;

基于参考文献思路进行生信分析;

基于客户制定的分析思路进行生信分析。

中药/单体网络药理学分析

中草药单体成分分析及有效成分预测

药物单体靶标蛋白预测及功能分析

药物功能网络药理学分析


结果图例展示:

示例图 调控网络图,例如ceRNA网络或PPI网络

示例图 GSEA富集分析

示例图 基因功能富集分析(GO和PATHWAY)

示例图 非编码RNA的功能富集分析(pathway)

示例图 WGCNA权重共表达分析


示例图 基因在疾病中的生存预后分析(KM曲线)

示例图 时间(浓度)递增序列数据分析

示例图 网络药理学分析


关于我们

宋伟博士服务团队

成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发,每年为科研院所的几百个生信分析项目提供高级分析服务。


研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。

生信高级分析服务评估咨询:医药加范老师, 15301721511 (手机,微信号)






2017-2018年,医药加金牌学习班已经培训出4000+学员,许多学员通过医药加精品课程的学习,快速发表了sci文章或者拿到了国自然、省自然等项目基金。现医药加平台为了让更多的医药加学员们可以全年获得优质的线下精品课程;让学员们的SCI文章能更快发表;同时最大限度帮助广大医药加的学员提高科研创新能力,

现特意推出:【必发SCI文章VIP年卡会员服务套餐】

希望能给更多的学员带去更多的福利。


必发SCI文章vip年卡会员福利


1. 购卡一年内,持卡人可以享有选择参加所有医药加线下学习班(除了国自然撰写与冲刺班)的权利。

2. 本年卡,可指定三人在一年内轮流使用,每次开班来一人参加。

3. 为SCI文章的发表,享有一次价值5000元生信高级分析服务的权利。

4. 为SCI文章的发表,享有一次价值1000元SCI文章评估服务。

5. 相关学习班的讲师可提供在线咨询指导。



咨询报名:请加微信yiyaojia05


5月份医药加课程安排


5.11-12广州南洋长胜酒店第9期中药网络药理学的研究策略与实用技能研讨班
5.11-12广州南洋长胜酒店TCGA/GEO高通量公共数据库挖掘学习班
5.11-12广州南洋长胜酒店2019全国科研作图高级学习班
5.11-12广州南洋长胜酒店第6期肠道菌群与代谢组学课题设计及研究策略专题学习班
5.18-19上海中兴和泰酒店第12期实用医学统计与GraphPad作图学习班 
5.31-6.2上海中兴和泰酒店第42期循证医学与meta分析(含网状meta分析)三天精讲学习班
5.25-27上海中兴和泰酒店第13期基因编辑技术学习班
5.25-26上海中兴和泰酒店蛋白质组学实验设计与数据分析学习班
5.25-26上海中兴和泰酒店全国非编码RNA数据分析与设计学习班


5.25-26上海中兴和泰酒店第4期全国临床预测模型构建与基于R语言统计分析学习班
6.1-2号上海中兴和泰酒店非编码RNA如何学才能避免走很多弯路? 这里有答案!

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