【9月10-11日】R语言生信数据分析及可视化作图班
要点预览
R语言生信数据分析及可视化作图
(理论+实践课)
(两天网络授课 ,具体安排:9月10-11日)
课程可免费回放,专家微信群指导,确保你能学会!
学习班简介
众所周知,R软件是用来做统计分析和作图的软件。本次学习通过手把手教学让学员掌握R软件下载安装、Rstudio用法、常用医学统计学算法模型R实现、R语言常用作图、R语言数据处理方法与编程技术、掌握R语言自主学习实践的方法与技巧,现场解答学员在实际工作中遇到的有关技术问题,让学员更好地掌握相关技术的应用。另外,课后学员有 感兴趣的图片,老师也可以提供相应的R代码。
总体思路是根据生信相关的SCI文章为主题,完成里面所有的分析内容。该培训适用于对生信分析或者医学统计学分析感兴趣,编程零基础及以上的学员参加。
讲师简介
宋伟博士,中国精准医疗学会委员
成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。
研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。
培训经历:在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有:医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。
培训方向:《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》等
培训目的
通过2天的培训(半天理论课程+1天半实践操作),可以学会R语言基础(输入文件格式、输出文件格式、操作代码的参数调整)、统计学上各种算法的实现、SCI常用图片生成。
往期学员评价
课程安排
R语言生信数据分析及可视化作图日程 | ||
课程 | 主 要 内容 | |
第一天 上午 | R语言——编程环境、数据结构、语法和练习 | R软件的历史、简介、优缺点 |
R编程形式与资源 | ||
R软件的安装 | ||
Rstudio使用技巧及安装 | ||
R语言的数据结构(元素、向量、矩阵) | ||
R语言的编程方法 | ||
一起练——R语言的编程练习 | ||
第一天 下午 | 生信参考文献解读 | 生信文献的流程解读 |
常用的生信分析流程 | ||
流程模块使用的R包及函数简介 | ||
案例展示 | ||
常用R函数 | 统计编程思想与流程 | |
数据描述性分析R实现 | ||
统计分析R实现 | ||
实战操作演练——卡方检验、回归分析、方差分析、Fisher精确检验、相关性分析等 | ||
第一天 晚上 | 常用R包(1) 转录组、蛋白组、表观组、代谢组等不同组学数据差异基因筛选及可视化 | R包的介绍——r-project 来源及 Bioconductor 来源 |
R包的安装——在线安装及本地安装方法 | ||
芯片数据预处理——标准化,归一化 | ||
差异分析——差异基因筛选,火山图 | ||
无监督聚类分析——PCA分析,聚类热图分析 | ||
第二天上午 | 常用R 包(2) 基因、蛋白相关分析 | R语言功能富集分析,包括KEGG pathway,以及GO BP, CC, MF分析,功能条形图,功能气泡图可视化 |
共表达分析——pearson法,相关性散点图 | ||
生存预后分析——KM曲线图,添加p值,HR值 | ||
样本相关性及相关性热图分析 | ||
实操 | ||
第二天下午 | 常用R包(3) 常见思路 | 单细胞测序相关分析 |
RNA甲基化相关分析 | ||
时间序列分析——多组连续样本的基因表达聚类 | ||
实操 | ||
R语言学习的方法与技巧 | 算法思想、R包及函数用法、参数说明、范例程序 | |
如何找到有用的R资源 | ||
R语言学习小窍门 | ||
互动环节与答疑 |
PS:必须携带电脑,最好是win10系统,苹果系统需自己安装好R和Rtudio软件。会后主办方会统一提供全程录像作为复习资料。
图例展示
学习报名
会务费:3000元/位
可以开正规会务发票或者技术服务费发票。 提供邀请函!
报名请识别二维码添加小编微信
范老师:1530172151