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【9月10-11日】R语言生信数据分析及可视化作图班

七师兄 生信之家 2022-10-14

要点预览


R语言生信数据分析及可视化作图


(理论+实践课)



(两天网络授课 ,具体安排:9月10-11日)



课程可免费回放,专家微信群指导,确保你能学会!



学习班简介

    众所周知,R软件是用来做统计分析和作图的软件。本次学习通过手把手教学让学员掌握R软件下载安装、Rstudio用法、常用医学统计学算法模型R实现、R语言常用作图、R语言数据处理方法与编程技术、掌握R语言自主学习实践的方法与技巧,现场解答学员在实际工作中遇到的有关技术问题,让学员更好地掌握相关技术的应用。另外,课后学员有 感兴趣的图片,老师也可以提供相应的R代码。

    总体思路是根据生信相关的SCI文章为主题,完成里面所有的分析内容。该培训适用于对生信分析或者医学统计学分析感兴趣,编程零基础及以上的学员参加。


讲师简介

宋伟博士,中国精准医疗学会委员


成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。

研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。


培训经历:在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有:医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。


培训方向:《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》等



培训目的

通过2天的培训(半天理论课程+1天半实践操作),可以学会R语言基础(输入文件格式、输出文件格式、操作代码的参数调整)、统计学上各种算法的实现、SCI常用图片生成。


 

往期学员评价

     

课程安排

R语言生信数据分析及可视化作图日程

课程

  内容

第一天

上午

R语言——编程环境、数据结构、语法和练习

R软件的历史、简介、优缺点

R编程形式与资源

R软件的安装

Rstudio使用技巧及安装

R语言的数据结构(元素、向量、矩阵)

R语言的编程方法

一起练——R语言的编程练习

第一天

下午

生信参考文献解读

生信文献的流程解读

常用的生信分析流程

流程模块使用的R包及函数简介

案例展示

常用R函数

统计编程思想与流程

数据描述性分析R实现

统计分析R实现

实战操作演练——卡方检验、回归分析、方差分析、Fisher精确检验、相关性分析等

第一天

晚上

常用R包(1)

转录组、蛋白组、表观组、代谢组等不同组学数据差异基因筛选及可视化

R包的介绍——r-project 来源及 Bioconductor 来源

R包的安装——在线安装及本地安装方法

芯片数据预处理——标准化,归一化

差异分析——差异基因筛选,火山图

无监督聚类分析——PCA分析,聚类热图分析

第二天上午

常用R 包(2

基因、蛋白相关分析

R语言功能富集分析,包括KEGG pathway,以及GO BP, CC, MF分析,功能条形图,功能气泡图可视化

共表达分析——pearson法,相关性散点图

生存预后分析——KM曲线图,添加p值,HR

样本相关性及相关性热图分析

实操

第二天下午

常用R包(3)

常见思路

单细胞测序相关分析

RNA甲基化相关分析

时间序列分析——多组连续样本的基因表达聚类

实操

R语言学习的方法与技巧

算法思想、R包及函数用法、参数说明、范例程序

如何找到有用的R资源

R语言学习小窍门

互动环节与答疑

 

PS:必须携带电脑,最好是win10系统,苹果系统需自己安装好R和Rtudio软件会后主办方会统一提供全程录像作为复习资料。


图例展示


 

学习报名

会务费:3000元/位

可以开正规会务发票或者技术服务费发票。 提供邀请函!



           


报名请识别二维码添加小编微信

范老师:1530172151



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