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【9月2-4日】生信小白如何利用TCGA/GEO数据库发文章。

七师弟 生信之家 2022-10-14
要点预览


全国TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班



(2天2晚精讲班,时间:2022.9.2-4号)



培训简介


2019年度国家自然基金医学科学部共批资助10138项目,批助金额总计441310万元。其中面上项目数量占45%,金额占57%;青年科学基金项目数量占43%,金额占20%。


初步统计,这些项目中大部分都与编码基因有直接或间接的关联。其中,与通路(pathway)关联的有1349项,金额4.89亿;与miRNA相关的有630项,金额2.3亿;与lncRNA相关的有395项,金额1.45亿; 


如何获得有创新意义的疾病靶标基因(mRNA,Protein,lncRNA,circRNA,miRNA,Mutation等)是项目申请及文章写作时最常见的问题。基于这个目的,我们开展了该培训班:TCGA&GEO高通量数据挖掘。


癌症是临床医学中非常重要的疾病方向。TCGA数据库中包含了常见了40种癌症方向(含30000个样本)的高通量数据及临床信息。大家对TCGA数据库的使用近几年也在逐渐增加!另外,其他疾病的研究可以通过GEO数据库进行。


项目类型

题目

金额/万元

重点项目

FXYD3介导的信号网络对肠道黏膜免疫稳态的调控研究

300

重点项目

基于蛋白-蛋白相互作用精准调节转录因子Nrf2活性及探索其作为肝细胞癌治疗的新靶标

298

重点项目

miR-23b/24-1簇防治烧伤后脓毒症所致MODS的系统研究

297

面上项目

LZTR1基因突变导致的RAS/MAPK通路过度激活以及Noonan综合征相关肥厚型心肌病的机制研究

60

面上项目

SUGP2基因及其突变在遗传性血色病中的致病作用及其机制研究

60

面上项目

WDR73基因突变在Galloway-Mowat综合征中的致病机制研究

60

面上项目

STAG2通过ERK/AKT/GSK3β/c-Myc反馈通路调节甲状腺癌谷氨酰胺代谢的机制研究

60

面上项目

LncRNA FOXF1靶向调控动力相关蛋白1表达在缺氧诱发肺动脉内皮细胞焦亡中的作用及分子机制

55


讲师简介

宋伟博士

研究成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。

研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。

培训经历:在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有:医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。

培训方向:《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》等



课程安排


分析示例图



学习费用

网络课程3200元/每位。


优惠政策:

1. 提前报名并付款的可以预先拿到学习资料

2. 三人组团报名,每人可优惠100元

3. 四人组团报名,每人可优惠200元,

4. 五人组团报名缴费,额外带一人免费注册学习同等级学习班! 

5. 疫情过后,可补差价参加医药加线下同名班。

6.  参加过医药加同名线下班的学员,只要500元复听费用(推荐新学员的,免收复听费用)。

7. 办理了VIP年卡的学员是免费参加的。

报名付费成功后,提前发培训需要应用到的软件与课件,并且指导安装。

参加培训的学员课后可通过微信群继续和老师交流,长期获得答疑机会。


可以开正规会务发票或者技术服务费发票。 


报名电话:15301721511 (微信同号)范老师

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