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《科研图像处理与作图》线下班,上海、北京

科汇堂 逻辑神经科学 2023-03-10



来源︱科汇堂

编辑逻辑神经科学



  • 包会:照顾到每一位学生,理论+操作+课后材料

  • 深度广度两不误:图像+示意图+排版

  • 全新升级:优化课上案例、新增3D作图

  • 不怕忘:不限次免费参加


往期学员作品 ↓↓



扫码报名 ↓↓↓

2021年6月26-27日,上海

2021年7月10-11日,北京



课程介绍



【主讲老师】李 凯    博士  

科汇堂创始人、视觉总监

博士毕业于复旦大学生物医学研究院,曾任中科院上海药物所影像平台主任,在生物医学成像与图像领域有10年以上经验。于2016年,发起成立科研智库平台“科汇堂”,其代表课程《科研图像处理与论文作图》全国学员累计数千人。李博士目前重点负责科汇堂的科学可视化版块,已为国内外科研工作者提供期刊封面绘制、论文示意图绘制和医学动画制作等服务上千例。


第1天  科研图像处理

【内容简介】准确、高效、美观的图像数据往往直接提升论文的档次,然而图像处理一直是科研工作者犯错失误的重灾区。本部分课程主要讲解科研图像知识、图像处理软件操作。软件包括全能型图像软件Photoshop,以及学术界使用最广的ImageJ。课程目的是让学员做到:1-不犯图像错误;2-提升日常图像处理效率、准确度;3-具备部分高级图像分析能力。


第2天  论文作图与排版

【主讲老师】科汇堂视觉团队(根据班次和城市安排老师)

【内容简介】高影响因子杂志对示意图、图表排版的要求极高,比如Nature、JACS有专门的图表格式要求文档。而大部分科研工作者对此类概念比较模糊。同时,一个专业美观的示意图,既可以增加论文的被引,也可以极大提升课题组的成果传播。本部分课程介绍论文配图绘制、3D示意图绘制、大图排版、图表美化和会议展报制作的实现。软件主要包括Adobe Illustrator 和C4D等。教学中强调实际操作,以保证学员通过两天的系统学习,即可轻松实现《Nature》级的图表绘制。




课程大纲



第1天:科研图像处理

本部分课程从图像的基础知识讲起,过渡到软件操作和应用案例实现。ImageJ是学术界使用最广、最权威的开源图像处理软件,且不存在收费和版权问题,遗憾的是在国内不够普及。Photoshop功能强大,适用于科研工作中的多种场景。

1.1 科研图像基础

分辨率/图像尺寸计算、灰度/RGB/CMYK/HSB/Lab色彩模式及其应用、直方图、调色:黑场/白场/中间色调(gama值)、白平衡、图像格式:tiff/gif/jpg/png

1.2 常用成像仪器采图要点

激光共聚焦显微镜等成像设备的采图原理、及其数据处理差异、采图参数要求

1.3 图像软件

Photoshop:核心概念:图层/蒙版/曲线、调色:曲线/色阶、图像裁剪、像素/尺寸修改、自动拼接、测量、TEM照片上色、制作展示视频

ImageJ:基础操作、通道融合/拆分、图像调节深析、伪彩、去噪、图像运算、光照不均校正、加标尺批处理

1.4 案例解析:

病理切片分析、纳米球尺寸/粒径分布测量、光照不均校正/物镜污渍去除、白平衡、荧光强度定量分析、Western  blotting条带分析、细胞面积/体积测量、计数、共定位、大图拼接、3D展示、制作视频

1.5 SCI杂志对图像的要求

尺寸要求、采图原则、后处理注意事项

1.6 科研图像伦理

不能有的操作、必须有的操作;提升质量的操作。


示例:共聚焦采图标准

示例:白平衡校正

示例:多通道荧光图像处理


示例:不同种类噪点及去除


示例:荧光定量



示例:病理切片分析


示例:显微镜光照不均校正


示例:移除图像中的外源污渍


示例:Western Blot条带分析



示例:面积计算


示例:SEM照片上色


第2天:AI绘图与排版

本部分课程围绕Adobe Illustrator(AI)在科研中的应用展开,包含:示意图绘制、配色入门、Graphpad与AI联用美化图表、论文大图排版、会议展报制作等。本部分侧重操作,学员在老师的带领下练习由简单到复杂的案例。课程结束后学员有能力自己制作《Nature》级的图表。

2.1 绘图/设计基础

矢量绘图原理、常见效果及其实现、配色/字体/排版、论文配图要点及、SCI高分论文示例、两色/三色搭配、主色/辅助色/点缀色、相近色/对比色、论文配色思路

2.2 AI

基础操作、画板/图层、锚点/钢笔工具;基本形状绘制、形状变换、旋转、各种对齐操作;创造复杂图形;渐变实现3D效果、用笔刷快速绘制重复单元(细胞膜、DNA等);符合SCI论文要求的导出

2.3 配图案例

绘制基本形状、复杂形状

细胞器、纳米材料

信号通路、实验模式图等完整案例练习

跨软件协作:图像、图形、图表综合应用

2.4 图表优化

Graphpad/Origin图表与AI的联用、矢量图的导出和格式

2.5 排版案例

论文大图排版

学术会议展报制作

2.6 3D作图入门

C4D软件基础操作

常见元素绘制



示例:基本图形的绘制

示例:细胞膜的画法


示例:示意图绘制






示例:数据图表美化


示例:多图组合排版


FAQ:


没有软件怎么办软件?

课前我们会协助安装最新版软件,可长期使用。


教学方式是怎样的?

三段式:讲解、跟随操作、练习;


两天课程能学到什么水平?

所有学员掌握绘制常用图像处理/示意图,足以应付日常应用场景;并具备以后自我提升的方法能力。


课后遗忘怎么办?

本课程学员可不限次免费参加科汇堂同种课程,以达到复习巩固的目的。(第一次复习全额免费,之后若继续参加每次支付100元座位及餐饮费用即可)


报名信息:


上课时间:

周六:09:00~21:00

周日:09:00~17:30


报名方式:

以下任选其一:a)点击文末阅读原文报名;b)扫码报名


扫码报名 ↓↓↓

2021年6月26-27日,上海

2021年7月10-11日,北京


注册费用:

学员类型注册费
教职工博后3200元/人
在读学生2900元/人

(提供正规发票;报名成功以到款为准;座位按到款顺序排列。)


汇款方式:

A:银行转账 
账户名称:上海合知堂信息科技有限公司  

账户号:03485500040015753
开 户 行:中国农业银行股份有限公司上海复旦支行
B:支付宝转账 
支付宝账号:service@kehuitang.com  

支付宝户名:上海合知堂信息科技有限公司


报名咨询:

电话:400-119-1986



学员作品 / 往期掠影:


2020线上课- 南方医科大学- L同学



2020线上课- 遵义医科大学- Z同学




2019四季度课后作业节选


▋  上海班学员作品: 


▋  重庆班学员作品: 



▋  北京班学员作品: 




2016年线上课




2019- 成都中药研究所- 张复中


2019- 武汉大学- 黄世佳 




2019- 清华大学- 乔同学 





2017- 线上3D课


Cecilia:


一半先生:


线下课场景



制版︱王思珍


本文完

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