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【直播预告】2019新型冠状病毒介绍与抗病毒药物设计

KouShare 蔻享学术 2021-04-25



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自2019年12月新型冠状病毒疫情发生以来,牵动着全国乃至全世界的心,社会各界纷纷从各个方面,利用各种手段理解病毒感染机理,尽快找到有效的治疗药物。鉴于大家对病毒的病理,以及药物开发都感兴趣,但苦于没有介绍。所以本期直播邀请到了相关领域人士,从物理,计算的角度来介绍这些问题向大家科普新型冠状病毒基本知识、DFT算以及机器学习在针对病毒药物设计方面的应用。


此次报告授权蔻享学术进行网络直播和录播。广大科研工作者可以关注“蔻享学术”公众号,通过“视频”»“学术直播间”栏目免费观看。




直播题目:2019新型冠状病毒介绍与抗病毒药物设计

报告人:郑克孝/张亚南/石林


直播时间:2020年02月06日(星期四),下午13:00-14:00



授课内容

本期邀请到的三位嘉宾,分别从三个角度来阐述,第一位嘉宾郑克孝副研究员会从生物学的角度来介绍新型冠状病毒的基本知识、抗病毒药物的作用机理以及几种潜在药物靶点;第二位嘉宾张亚南工程师将以新型冠状病毒为例介绍多尺度模拟以及机器学习在靶向药物设计方面的应有,尤其是介绍了药物设计常用的数据库,如何从病毒结构中切除可以用于DFT计算的结构以及如何对切除的结构进行加H钝化处理;第三位嘉宾石林研究员将介绍配体-受体相互用作及其结合自由能的理论计算,介绍了多种常用的结合自由能计算方法。

嘉宾介绍


郑克孝,副研究员,分别于2003年(四川大学)及2007年(中科院上海生命科学研究院)获工学学士和理学硕士学位。在中科院苏州纳米所生化平台长期从事基于生物芯片的药物及生物标记物的高通量筛选、体外诊断技术平台研发、以及对药企的技术服务工作。作为团队骨干成员研发出第一种非标记的高通量小核酸检测微阵列以及国内首个图形编码的悬浮阵列多因子分析系统。主持国家自然科学基金青年项目及江苏省重点研发计划面上项目各一项,作为主要发明人之一获国内外发明专利授权4件,在Biosens. Bioelectron., Nucl. Acids Res., Anal. Chem. 等国际学术期刊上发表论文10余篇。


张亚南,计算、数据库专家,硕士毕业于中科院,长期从事计算机辅助药物设计,对各种药物设计的数据库非常熟悉,尤其擅长结合多种尺度以及机器学习辅助靶向药物预测与筛选,目前是QM Simulations公司合伙人。 


石林,研究员,于2002年获东南大学物理系学士学位,2007年获清华大学物理系博士学位,2011年赴美国劳伦斯伯克利国家实验室做访问学者一年。2007年加入苏州纳米所测试分析平台,主要从事半导体材料的理论模拟计算。主持国家自然科学基金面上项目、中科院“十二五”信息化专项超级计算重点应用示范项目和教育部留学人员回国科研启动经费各一项,国家自然科学青年基金和江苏省基础研究计划(自然科学基金)各一项。2016年入选中国科学院青年创新促进会会员。石林老师主要从事基于第一性原理的理论计算工作。与美国劳伦斯伯克利国家实验室的汪林望教授共同在原有的第一性原理计算软件PEtot的基础上开发了一套电声耦合计算软件包,开展了局域声子、非辐射复合、发光效率和寿命等特性的理论计算和测试分析工作。已在Phys. Rev. Lett., Adv. OpticalMater., ACS Catal. 和Phys. Rev. B等国际学术期刊发表SCI论文20余篇。


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