科研绘图神器 | Image J一本通,哪里不会点哪里!
好看的图片总是令人心驰神往,身心愉悦。比如朋友圈的图片总是让人赏心悦目,赞叹不已。各位学术er在发朋友圈的时候是不是拍照n分钟,修图n*n小时呢?
如果说朋友圈的图片有利于展示自己的美好形象,那么论文中图片,便是我们学术上的形象了。看顶刊上的配图,总是能够感觉到专业,严谨,以至震撼!“如何做出专业的图片”便那么自然而然涌上心头。
小科经过耐心细致搜集,终于完成了作图神器——ImageJ的“葵花宝典”,因为入门难度之大,小科倾情奉献,以飨各位科研er。(使用攻略均来源于网络,仅作整理分享,版权归原作者所有,如有侵权,请联系删除)
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安装教程
小科搜集了Fiji的Mac和Windows安装包。Fiji其实就是ImageJ,这个名字其实就是:Fiji is just ImageJ的首字母。Fiji和ImageJ1的区别就是:Fiji自动包含了各种有用的插件,而ImageJ1需要手动安装插件。
(ImageJ与Fiji)
拿到安装包后直接解压缩双击运行即可,看到如下界面即成功安装。如果没有成功,一般是解压缩后的路径含有中文,换到英文路径下一般就可以了。
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使用教程
ImageJ虽然说是作图神器,对于生物和医学的学术er来说简直是必备专业软件,但是入门难度属实不低,鉴于此,小科精心搜集了全网的教程,涵盖了这款利器的所有功能的教程,包括了基本功能篇、定量分析篇、综述篇以及插件篇。
荧光照片的合并与分割,错落有序的照片合并在一起,是如此美妙,反向操作分割开来的完整保存又是这样的惊奇。
对于更精细的专业要求如比例尺,图像信息,明场图片白平衡,角度测量,电镜上色,校正轴向光照,伪彩添加……应有尽有,尽在这本绝世武学《ImageJ一本通》中。
(比例尺)
(明场图片白平衡)
(角度测量)
(电镜上色)
对于照片的专业分析,无论是荧光照片、径向平均荧光强度,可以说是不费吹灰之力,详细教你荧光共定位分析,孔隙率,脑片分层灰度值,免疫组化分析,细胞膜荧光强度检测等等等!学会了这些,是何等的专业!
(平均荧光强度)
(径向强度)
(共定位分析)
(孔隙率)
(灰度值)
(免疫组化分析)
(强度检测)
面积测量,细胞计数,专业的图片软件就是这么强大。毕竟像这么如此不规则又如此众多的细胞,如何实现去实现上述两个功能?ImageJ可以轻松搞定!哪管什么不规则面积,更不怕细胞重叠,不在话下。
(面积测量)
(细胞计数)
(重叠细胞计数)
众多的插件让ImageJ所向披靡!Simple Neurite Tracer(神经元追踪)、Sholl Analysis(神经元分支统计)、Kappa(曲率计算与拟合)更多插件敬请各位学术er去探索~
(神经元追踪)
(神经元分支统计)
(曲率计算与拟合)
这么详细的教程,这么丰富的功能,此时不领,更待何时!
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来源:知乎。仅作分享,如有侵权,请联系删除。
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