每当我们一提到蛋白免疫印迹杂交实验(Western Blot)的时候,相信做科研的小伙伴们都会“虎躯一震”,洪荒之气猛冲天灵盖,满脑子的问号:我是谁?我在哪?为什么酱紫对我?
这个实验室最最基本的技能,我们对她真是又爱又恨却又割舍不下。
好看的条带“千篇一律”,而我的总是“出其不意”,那么,不禁要思考一下,为什么我就做不出一张条带清晰、背景干净、没有杂带的结果呢?别急,今天我们就来分析一下这个“小妖精”磨人的招数,一一将她打破,降服。
WB相信大家并不陌生,其主要是利用聚丙烯酰胺的分子筛效应,根据蛋白质亚基分子量的大小将其分离开,然后进行目的蛋白质的检测。在此我们就最常见的细胞样本的WB展示一下实验流程
了解了WB的基本流程之后,就要开始我们的“WB奇妙之旅”了,本次列车通往WB结果的乐园,中途不许下车哦,你期待吗?😉对于不同样本的制备,我们根据不同种属,不同来源,不同定位来制备所需要的样本,基本有以下几类,以供列位“实验人”参考。在种属方面主要有动物、植物和微生物三大类,而从细胞定位上,使用的裂解液及蛋白提取试剂盒又也是不同的。其实在样本制备的过程中,我们会遇到很多问题,而这些问题又会导致不同的结果产生,因此制备样品时一定要按照相关试剂盒说明书或者实验步骤来进行,才能保证后续顺利进行。1)在电泳的过程中,首先我们要注意的是,在低电流,低电压的条件下跑出来的条带相对比较清晰,蛋白的条带比较凝聚,不容易出现条带弯曲倾斜的情况,缺点就是时间会比较长。2)制胶:根据目的蛋白的分子量大小选择配制合适浓度的分离胶,在配置过程中玻璃板一定要清洗干净,分离胶不要加太满,要使蛋白样本有足够的浓缩时间;胶的凝聚要充分且均匀,不要有气泡。3)转膜:注意海绵垫,滤纸,膜,胶的叠放位置,以确保正确的转印方向;在胶和膜之间确保不要有气泡!不要有气泡!不要有气泡!重要的事情说三遍。4)封闭和抗体孵育:封闭的时候,要有足够的封闭液,封闭时间要足够充分;一般一抗孵育是在4℃静置过夜,若是抗体特异性好,信号强的话可以抗体室温摇床孵育2h左右;二抗一般室温孵育1h即可。洗膜用标准的TBST缓冲液,摇床清洗3次,每次10min,若是判断由于抗体原因导致背景过高,可以把洗涤次数提高到4~6次。5)显影拍照:加过显影剂之后,注意调节曝光时间,拍照模式,根据实际情况进行调整,以达到最佳效果。历尽千辛万苦,熬过万般磨难,终于到了我们实验的最后一步,那就是对结果的分析,我们不仅要学会做出一个满意的条带,还要了解对于条带是怎么分析的。
对于WB的结果来说,最常用的就是Image J软件了,下载链接:https://imagej.nih.gov/ij/download.html,在网站中按照机型下载安装就行。Image J的使用非常简单,在此我来简单介绍一下。 2)单击File Open在文件夹中找到WB图片;3) 把图片转化成灰度图片:Image Type 8-bit;4)消除图片背景的影响:Process Subtract Background,在弹出的对话框中,填上50基本就可以了,并勾上Light background,点击OK。此时图片背景会变白一些。 5)设置定量参数:Analyze Set Measurements。在弹出的对话框中勾选Area、Mean gray value、Min& max gray value、Integrated density。6)设置单位:Analyze Set Scale。在弹出的对话框“Unit of length”后面填上“pixels”,其他的不用改动,然后把WB图片转换成亮带:Edit Invert7)选择菜单栏下的不规则圆形工具,将圆圈手动拉倒第一条带,并尽量将条带都圈起来,单击Ctrl+m,即可弹出你选定区域的灰度统计值。结果中的IntDen即积分灰度值。 8)手动移动不规则圆圈至下一条条带,重复步骤7,直至所有条带都被测量,选结果中的“Edit”的“Select All”,然后复制数据“IntDen”到Excel表即可进行分析。 9)在excel表格中将目的蛋白的灰度值除以内参蛋白的灰度值,进行归一化处理,在Graphpad Prism软件中作柱状图。Western blot 超值福利享不停
活动时间:即日起至2021年1月30日
活动内容:蛋白互作、表达差异、目的蛋白验证,WB检测少不了,2021年文章怎么能缺少几个完美的条带 ~
活动详情:凡即日起在科学指南针平台预约Western blot,满2000即可享受6折优惠(包含提取蛋白和WB检测部分),实在是太可了! 🤩