神秘的德国实验室,追捕变异病毒,日赚一辆法拉利,7天出结果
德国新冠变异病毒的感染突飞猛进,令人谈虎色变。目前已经有22%的新增感染者为变异病毒所致,而且这个比例还在快速增加中。德国与丹麦接壤的城市Flensburg近日突然大规模爆发变异病毒感染,该市已经实施了宵禁。
变异病毒是如何确认的?这要去看看这个神秘的实验室了。德国莱茵河的右岸,有一座小城叫希尔登 (Hilden)。在这个不起眼的小城中有一个名叫卡根新冠实验室(Labor von Qiagen )。
Hilden在红色线区域内,距离杜塞尔多夫很近
这个实验室的安全等级为二级生物安全水平:实验人员与处理病原体人员需为特定培训和高级培训的科学家;实验时限制特定人士的出入,采取极端的防治污染物品预防措施; 需要生物安全柜或其他物理遏制设备;可能产生造成传染性气融胶或喷雾的实验必须在二级生物安全柜进行。
这是德国对新冠突变病毒做检测的实验室。外来人员谢绝进入参观。在这里工作的科学家也被称为“突变病毒猎人”。
德国《图片报》摄影记者贾娜·科尔贝(Jana Kolbe)被批准可以进入卡根新冠实验室。她和实验室的生物技术专家凯特·卡特(中间)和亚历山大·维亚尔(右一)一起检查新冠突变体的基因
从2月17日以来,很明显,因感染英国变异毒株B1.1.7的新冠病毒感染患者已占全德感染病例的22%。《凶险无比的复合变异病毒浮现!德国变异病毒感染潮爆发》(点击阅读)。
在这里,新冠病毒基因组一览无遗
在一扇带有黄色警告标志的玻璃门后面是实验室,研究人员在那里通过测序来追踪突变体。
卡根实验室的项目主管和生物技术专家凯特·卡特(Kai Te Kaat)解释说:
“基因组包含了病毒的蓝图。你可以把它想象成一个有3万个字母的长单词。在测序过程中,每个字母都被读出。”
实验室主任亚历山大·维亚尔和项目管理负责人兼生物技术专家凯特·卡特(右)在突变实验室工作
通常情况下,需要3到7天才能出结果。因为“测序非常复杂。”
只有阳性的新冠样本才会被测序!
在最严格的安全条件下,实验室主任亚历山大·维亚尔(Alexander Vial)将病毒从拭子上释放出来。
通过小管中的化学溶液从病毒从拭子中清除
在离心机中,病毒管被旋转,以将遗传物质与其他颗粒分离。
对于实验室主任来说,接下来是用移液器进行长达三天的马拉松! 因为:在测序之前,必须将病毒的蓝图分解成各个部分。
亚历山大·维尔拿起移液器,并用各种酶处理病毒
卡特解释说:“每次从基因组中读出一个信息(可以把它想成一个字母)需要5到6分钟。为了更快地进行测序,基因组被分成大约150个字母长的部分。”
为此,他们将病毒被反复加热,冷却和酶处理。
移液器中的一滴足以将遗传信息“加载”到芯片上。
根据测序仪的容量,一个芯片上最多可以收集350个样本。德国政府为每个样本支付220欧元的检测费。一个芯片的费用为77000欧元。
2月17日,周三,罗伯特·科赫研究所(RKI)宣布:从2月8日到14日,在德国,总共检查了大约25490个新冠病毒突变样本。
带测序仪的实验室必须保持16度的室温。只有这样测序仪设备才能在72小时内读出病毒的遗传信息。
就是这个小型设备承担者最艰巨任务:测序仪可以读出病毒基因组的每个字母
卡特表示:“设备中会发生颜色反应,将颜色分配给每个片段上的每个字母。然后使用相机对其进行拍照。然后将照片序列转换为计算机序列。”
结果就是大约30000个字母的数据集。如果与原始新冠病毒相比有变化,那就是突变体!
“大多数情况下,无需担心,全球已经发现12000个新冠病毒突变。然而,到目前为止,只有少数变种可以自我发展,成为人类新的敌人,”卡特说。
摄影记者贾娜·科尔贝的最近距离观察突变病毒:站在生物技术专家凯特·卡特的背后
数据集由柏林的RKI专家评估。现在很清楚:在每个联邦州都检测到了英国变种(B.1.1.7),并且已经占感染的22%。
根据病毒学家的说法,这种变体很可能也会成为新冠病毒感染患者的主要构成病毒,或许会引起第三波疫情潮,《新冠警报!德国在“第三波疫情”起点上 变异病毒猖獗 图林根延长封锁》(点击阅读)。
不过,想必,德国的“突变猎人”会在他们的实验室中密切注意这一点!
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